| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0035174.1 gypsy/ty3 element polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.74e-65 | 97.32 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETG KKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKK+EMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDW
S+ISFDGPGLDW
Subjt: SIISFDGPGLDW
|
|
| KAA0036991.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.39e-44 | 70.8 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKY+ + +NEKS TT D EG SSK+K GIA S ESN+ETKKEVK+EEDKT +R+KFKKVEMPVF GNDPDSWLFRADRYFQI K+ + EKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDWY
SIISFDGP LDW+
Subjt: SIISFDGPGLDWY
|
|
| KAA0047224.1 transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 6.44e-40 | 65.77 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKYI SI+NEKSVTT DT+GSS + E G KKIE + ISKE +ETKK KE+EDK+VDRNKF+KVEMPVF+GN P+ WLF+ + YFQI K+ +KMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLD
+ISFDGP LD
Subjt: SIISFDGPGLD
|
|
| KAA0066078.1 transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.13e-40 | 62.83 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKY+ +++NEKS T+ D EGSSSK+KE + +S ETKKEVK+E++K +R+KFKKVEMPVF GNDPDSWLFRADRYFQI K+ + EKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDWY
S+ISFDGP LDW+
Subjt: SIISFDGPGLDWY
|
|
| TYK17139.1 putative retroelement pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.60e-41 | 69.03 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKY+ +++NEKS TT D EGSSSK+K GIA S ESN+ETKKEVK+EEDK +RNKFKKVEM VF GNDP+SWLFRADRYFQI K+ + EKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDWY
S+ISFDGP LDW+
Subjt: SIISFDGPGLDWY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SV77 Gypsy/ty3 element polyprotein | 1.0e-52 | 97.32 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETG KKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKK+EMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDW
S+ISFDGPGLDW
Subjt: SIISFDGPGLDW
|
|
| A0A5A7T5W7 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 4.2e-35 | 70.8 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKY+ + +NEKS TT D EG SSK+K GIA S ESN+ETKKEVK+EEDKT +R+KFKKVEMPVF GNDPDSWLFRADRYFQI K+ + EKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDWY
SIISFDGP LDW+
Subjt: SIISFDGPGLDWY
|
|
| A0A5A7TW94 Transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 | 2.4e-30 | 66.67 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKYI SI+NEKSVTT DT+G SSK E G KKIE + ISKE +ETKK KE+EDK+VDRNKF+KVEMPVF+GN P+ WLF+ + YFQI K+ +KMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLD
+ISFDGP LD
Subjt: SIISFDGPGLD
|
|
| A0A5D3BLG2 Transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 | 2.2e-31 | 62.83 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKY+ +++NEKS T+ D EGSSSK+KE + +S ETKKEVK+E++K +R+KFKKVEMPVF GNDPDSWLFRADRYFQI K+ + EKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDWY
S+ISFDGP LDW+
Subjt: SIISFDGPGLDWY
|
|
| A0A5D3D379 Putative retroelement pol polyprotein | 2.7e-34 | 69.03 | Show/hide |
Query: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
MKY+ +++NEKS TT D EGSSSK+K GIA S ESN+ETKKEVK+EEDK +RNKFKKVEM VF GNDP+SWLFRADRYFQI K+ + EKMTV
Subjt: MKYIVSIINEKSVTTFDTEGSSSKLKETGGKKIEGIAISKESNDETKKEVKEEEDKTVDRNKFKKVEMPVFNGNDPDSWLFRADRYFQIRKVIEMEKMTV
Query: SIISFDGPGLDWY
S+ISFDGP LDW+
Subjt: SIISFDGPGLDWY
|
|
