; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0020089 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0020089
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionMicrosomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)
Genome locationchr10:8482567..8485147
RNA-Seq ExpressionIVF0020089
SyntenyIVF0020089
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0045047 - protein targeting to ER (biological process)
GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009582 - Signal peptidase complex subunit Spc2/SPCS2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037360.1 putative signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo var. makuwa]8.90e-11489.85Show/hide
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XP_008463218.1 PREDICTED: probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo]5.88e-11696.2Show/hide
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XP_011654984.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis sativus]3.26e-11394.02Show/hide
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XP_022996614.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucurbita maxima]4.64e-11392.93Show/hide
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XP_038891545.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]6.58e-11392.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CIQ9 probable signal peptidase complex subunit 23.6e-8996.2Show/hide
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A0A5A7T1V9 Putative signal peptidase complex subunit 21.1e-8789.85Show/hide
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A0A6J1DV24 probable signal peptidase complex subunit 21.5e-8489.67Show/hide
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A0A6J1FVT7 probable signal peptidase complex subunit 27.4e-8792.93Show/hide
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A0A6J1K981 probable signal peptidase complex subunit 25.7e-8792.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P58684 Probable signal peptidase complex subunit 22.4e-7478.57Show/hide
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        P GSFTSTGL+VSSKLPRFSD YTL+I S+DPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI  YA  EPKK K
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Q55E35 Signal peptidase complex subunit 22.7e-0927.32Show/hide
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        T+   +  L D +++K  LD+S+ + VTS   Y ++ +L+  K++ G +   +A +AQFY   FP+N+  LI       V + IL +I    +K+ IL  
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             S ++  + V++ L ++   Y + I ++   SI+    V F+KS+  +F   G  +E  F  D+     ++A+   K K
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Q5BJI9 Probable signal peptidase complex subunit 27.5e-1232.96Show/hide
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        K +  D  ++K+ LD++  +++  + GY+E   L + +L + TV  +  +VA    Y   FPE++  L        +  GIL      KEKN  L     
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         PAG        +SS L RF D YTL +S +D K+  + E  +FTKSV+ +F ++G LV   + K V  L D  A E K
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Q5M8Y1 Probable signal peptidase complex subunit 21.7e-1132.4Show/hide
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        K +  D  ++K+ LD++  +++  +  YVE+  L + +LI+ T+  + A+VA    Y   FPE++  L +         GIL      KEK+  L  +  
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         PAG        +SS L RF D YTL ++    K+  A    +FTKS+ R+F  +G LV  LF  +V  L D  A E K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39960.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)1.7e-7578.57Show/hide
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AT4G04200.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)8.7e-6470.33Show/hide
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        ATKN KK NLLDH ++KHLLDESVS+IVTSRGY EDVRLSNVK ++G +II++ALVAQFY KK       DF   +V   ++Q I+Y KEKNAILFTYP 
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         GSFTSTGL+VSSKLPRFSD YTL+I S+DP+SISA + VQFTKSVT+W TKDGVLVEGLFWKDVEAL+ EY  A EPKK +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACCAAAAATGCTAAAAAGGCCAATCTCTTGGATCATCACTCTCTCAAACACCTACTCGATGAATCTGTTTCTGAGATTGTCACCAGTCGCGGCTATGTTGAAGA
CGTCAGGTTGAGTAATGTCAAATTGATTATGGGCACTGTCATCATCATCATAGCTTTGGTGGCTCAATTTTACAAAAAGAAATTCCCTGAGAATCGCGATTTCTTGATCG
TTTTTAATGGGATCTTGCAGTTTATTGTTTACACCAAGGAGAAGAACGCAATTTTGTTCACGTATCCTCCTGCAGGATCCTTCACCAGCACTGGGCTGATAGTCTCTTCA
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TACTAAAGATGGGGTTTTAGTTGAGGGACTCTTCTGGAAAGATGTTGAAGCATTGATCGATGAGTATGCTAGAGAACCAAAAAAGAGCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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