; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0020120 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0020120
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationchr09:6476483..6477039
RNA-Seq ExpressionIVF0020120
SyntenyIVF0020120
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648529.1 hypothetical protein Csa_008197 [Cucumis sativus]1.11e-9189.08Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP          DPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK

TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]1.42e-10994.59Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP          DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]1.14e-9989.19Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP          DPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]5.78e-10994.05Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP          DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAV AVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]3.17e-9185.56Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK-----SHKPDPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVS
        MAAIPSSSLQFPNSLTLP   K     +   DPES  +DSE  GSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST A SSVYLPPVPLKE VS
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK-----SHKPDPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVS

Query:  GGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        GGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  GGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein1.2e-7689.19Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP          DPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016679.9e-8494.05Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP          DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAV AVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein3.4e-8494.59Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP          DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061191.3e-6779.03Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPDP---------ESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSK HK  P           TP+   +PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPDP---------ESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        LKE VSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC1114890221.4e-6681.08Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSK HKP          DPES  +DSE P SDGDDFEDRLA  R + R GTGKKAEIRKARKS+KGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKP----------DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+ ALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQ YFVAA AA+YIKYEKEKVSVWP+DEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein8.7e-4858.82Show/hide
Query:  AAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPDPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVSGGLKVE
        A  P++   F    T   +++  +PDPE+T S+S   G+D D FE RL+ +R RYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKE VSGGLKVE
Subjt:  AAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPDPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVSGGLKVE

Query:  FGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRD
         GFSP+SERING IA LG++AL+LVELATGKSV++YHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP+D
Subjt:  FGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTCTCTCACACTTCCTTCCAATTCAAAGTCTCACAAGCCAGATCCGGAATCTACCCCCTCGGATTCAGAACA
ACCTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGCTTCCGATACCGAAGCGGAACGGGAAAGAAGGCAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGA
AAGGTTCTACCACTGCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGCTGAAGGAGCCGGTCTCCGGCGGACTTAAAGTGGAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGG
ATCAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATTTCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCGACCGGAAAAAGCGTCATCAGTTATCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGT
GTATTTTGTGGCGGCGGTTGCTGCGGTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCGGGATGAAATCAAAAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTCTCTCACACTTCCTTCCAATTCAAAGTCTCACAAGCCAGATCCGGAATCTACCCCCTCGGATTCAGAACA
ACCTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGCTTCCGATACCGAAGCGGAACGGGAAAGAAGGCAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGA
AAGGTTCTACCACTGCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGCTGAAGGAGCCGGTCTCCGGCGGACTTAAAGTGGAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGG
ATCAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATTTCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCGACCGGAAAAAGCGTCATCAGTTATCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGT
GTATTTTGTGGCGGCGGTTGCTGCGGTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCGGGATGAAATCAAAAGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPDPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVSGGLKVEFGFSPYSER
INGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS