; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0020612 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0020612
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationchr11:29470498..29472099
RNA-Seq ExpressionIVF0020612
SyntenyIVF0020612
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]8.08e-140100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein4.7e-10699.01Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988826.9e-10599.49Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein3.9e-108100Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557804.9e-8786.63Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883508.7e-8484.24Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein1.2e-2946.15Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)3.3e-3548.02Show/hide
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AT2G33510.2 unknown protein3.4e-3244.7Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACAGCAATATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTACTGGTAGTAGCTGGATGCAAGAGATGCTTCATGTATTTCATGGTGCCGAAACAGGTTGAAGATTGTCCCAAATGCA
GCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGATAACACACATTCTTTCCTTTCTTATTCTCATTCTTTCTTCCATTTCATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGACGAGATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGA
TTCTCTTGAGCAATCTTTCCGTAACTTCTCCCTCAACCACCGTCTATCCTCTGCCGCCCCCTCTTCCGCCGGAGTGCGGAGATCACCGTCTTCATTTTCTTCCTCTTCTT
CTTCCTCCGATGACGAACCTCATCTTCCTCTTCATCAACATAATCGCTTCGACACAATCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCCCTCCCTCCTTTCTGGGAGCAATGCCTC
GATTTGAAGACAGGGGAAGTTTACTATAGAAACTGCCGAACCGGAATGAAGGTAAAAGAAGATCCGAGGACAGCCGTAGCACACAGCCGAGATTTATATTCGGAAGACGA
CGGGGAGGACGGTGATGAGAGTTCTTCAGACGGTGGAAGTGAGGAGTCGTGTTCTTCATCGTCGTACGGTGGTAGTAGACAGCAATATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATG
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GACGAGAGTAATGGGTTCCCATGAACCACTTTTTTTTTTCTTTTGAGAAAAACAAGAAACCAAAATCAAACTGTATTTGGGTTAATTGATCTGACAAAATCATTGATTCT
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TTGTTATAGAAAAAAGAATCTGAGGAAATGCCATGGATGGTGTATGAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGATAGAGAGAGGGTATGAATGGGATGGTCAACGACTCAAAGGGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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