; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0020685 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0020685
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionGroup 2, putative
Genome locationchr04:23135878..23139447
RNA-Seq ExpressionIVF0020685
SyntenyIVF0020685
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048351.1 putative Group 2 [Cucumis melo var. makuwa]3.76e-13489.43Show/hide
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XP_022934269.1 uncharacterized protein LOC111441481 [Cucurbita moschata]8.50e-12281.28Show/hide
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XP_038905771.1 uncharacterized protein LOC120091726 [Benincasa hispida]9.88e-13987.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD21 Uncharacterized protein5.4e-11893.94Show/hide
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A0A1S3CFE9 uncharacterized protein LOC1035003124.2e-126100Show/hide
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A0A5A7U466 Putative Group 21.3e-10689.43Show/hide
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A0A6J1F239 uncharacterized protein LOC1114414814.1e-9781.28Show/hide
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A0A6J1J6W9 uncharacterized protein LOC1114819092.9e-9580.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G08490.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Late embryogenesis abundant protein, group 2 (TAIR:AT3G24600.1)1.0e-2051.72Show/hide
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AT3G24600.1 Late embryogenesis abundant protein, group 28.6e-0747.06Show/hide
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        V +  ++P SPI+SVK  +I  F  GEG+D+TGV TKIL+ N ++ V +D+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCTCTCCCACGCCAACAGCTCCGACATTCGCAACCCTGCCGAGGTCTCCACTTGCCACTCCCCTCTCCCCTCCGACACTTTTCCCAACGCCCATCACCATCACCACCACC
GCAACCCGACTCAGGAAGCTTCTCGTTTTACACTCTCCCACTACTCATCCTCCCGTGGCTCAAACCATGGGGCTGGAACCGACAATGGCGAGGCTCGCCTGATCGTCGGT
CGTGGTGATGGTCGAGATTGCGAGGAGGAAGAGGAGGACGGGGAGGGAAACGAGGAAGGGTATTATGGGAAGAGAAAAAGGGGTTGTTGGAAGAGGTATTTTACGTATAG
GAGTTCGGATTCTAATGCTTGGATTTGTTTGCAATTGAGTTGGAGGGCAATTTTCAGCATGGGAATTGCTTTGCTTGTGTTTTACGTTGTCACTAATCCTCCTTCACCAA
TCATTTCTGTTAAGGTGGGAGAAATACAAGAGTTTATGTTAGGGGAAGGAGTGGACAAAACAGGGGTTGGGACTAAGATTCTCACATGCAATTGCACAATGGATGTAATT
GTGGACAATCATTCTAAGCTTTTGGCCTTCACATCCTTCCTCCTTCTCTTCATATGTCTTTTGGCCCTCTTCCCATTGCAACTTCACAAGGTCCAAGATTGTATGCTGAG
AGTGGAAGGACGAGGTTTGGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGGGCTCCCATTATTTTGTATTTTCCCATGTCAGAGAGAAATCATCTGTCCGCCGCCGTGATGGAGGGTTCCGAAGAGCAAGAAGCCGTTCTCTTCCACTCTTATCCAT
GTGCTTATTACGTACAAAGCCCCTCCACTCTCTCCCACGCCAACAGCTCCGACATTCGCAACCCTGCCGAGGTCTCCACTTGCCACTCCCCTCTCCCCTCCGACACTTTT
CCCAACGCCCATCACCATCACCACCACCGCAACCCGACTCAGGAAGCTTCTCGTTTTACACTCTCCCACTACTCATCCTCCCGTGGCTCAAACCATGGGGCTGGAACCGA
CAATGGCGAGGCTCGCCTGATCGTCGGTCGTGGTGATGGTCGAGATTGCGAGGAGGAAGAGGAGGACGGGGAGGGAAACGAGGAAGGGTATTATGGGAAGAGAAAAAGGG
GTTGTTGGAAGAGGTATTTTACGTATAGGAGTTCGGATTCTAATGCTTGGATTTGTTTGCAATTGAGTTGGAGGGCAATTTTCAGCATGGGAATTGCTTTGCTTGTGTTT
TACGTTGTCACTAATCCTCCTTCACCAATCATTTCTGTTAAGGTGGGAGAAATACAAGAGTTTATGTTAGGGGAAGGAGTGGACAAAACAGGGGTTGGGACTAAGATTCT
CACATGCAATTGCACAATGGATGTAATTGTGGACAATCATTCTAAGCTTTTGGCCTTCACATCCTTCCTCCTTCTCTTCATATGTCTTTTGGCCCTCTTCCCATTGCAAC
TTCACAAGGTCCAAGATTGTATGCTGAGAGTGGAAGGACGAGGTTTGGATTAAGTGTGGGCACAAGCAATAAGGCAATGTATGGTGCGGGGAGGGAGATGGAAGACAAGC
TTGATTCTGGGATGGGATTGGAGCTTACAATTCGACTCAATTTCATTTCAAATTATAGGGTTGTTTGGAAATTCATAAGCCCACATTTTCATCGTCATGTCCAATGCTTA
TTGCTCCTTGGAAAAGCCTACGATAGAAAGCGTCACACTCCATCCTTCAATAGTACTTGCTTCACTTCTTGATGTTCATGTTAACCAACAAATTTTGCTTCTTAAATTTT
TATGAATTTTTCCTTTTTTTATTGTAAAATACTATAAGTTGTGATAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VDNHSKLLAFTSFLLLFICLLALFPLQLHKVQDCMLRVEGRGLD