; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021057 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021057
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationchr12:3658956..3660391
RNA-Seq ExpressionIVF0021057
SyntenyIVF0021057
Gene Ontology termsGO:0006278 - RNA-dependent DNA biosynthetic process (biological process)
GO:0006310 - DNA recombination (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0090502 - RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0030430 - host cell cytoplasm (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003887 - DNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
GO:0003964 - RNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
GO:0004523 - RNA-DNA hybrid ribonuclease activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036942.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold86G00180 [Cucumis melo var. makuwa]0.096.44Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        M AEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNV ENPLPDHENPK          C+NEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMK SKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQES NESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNIT ISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPI+AK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

KAA0036950.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold86G00300 [Cucumis melo var. makuwa]0.096.86Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNAR DYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINA WLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK          CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYV HEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSE KDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLKA+PWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

KAA0037621.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold277G002820 [Cucumis melo var. makuwa]4.65e-30192.67Show/hide
Query:  MTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISNVSH
        MTSMFMNTLRAPFYERMIGNAS   SDIIVIGERIEYGIKHGRLAE TTEYGGIKKGTI KKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISNVSH
Subjt:  MTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISNVSH

Query:  IPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLA
        I YNSYVP HTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKT+SDTWRFD IPMTYTELLPQLIQNRQLA IPMIPIQP YPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLA
Subjt:  IPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLA

Query:  LKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYDESRHCIFHRGVAG
        LKR VQSLIN GWLSFKKSGEK NVNENPLPDHENPK          CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGY+ESRHCI H+GVAG
Subjt:  LKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYDESRHCIFHRGVAG

Query:  HVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQ
        HVVQQCQKFRSKVQQ MDSKILTVYRGQ KDEMKDSK+C LMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQ
Subjt:  HVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQ

Query:  VITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        VITGP VDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPS+GLILEQGRKNEKRN KEHCKDQDVEMPIIAK
Subjt:  VITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

KAA0060421.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold22G002400 [Cucumis melo var. makuwa]4.39e-30489.52Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        M AEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAE TTEYGGIKKGTISKKKEGE+HAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPSYISNVS+IPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSK NSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLA IPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTENC ALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEK NVNENPLP+HENPK          CKNEVHEIVMPMEALFE LFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFH+GVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQ KDEMKDSK+C LMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLKAVPWRYDC VIT                      DNLTVPS+GLILEQGRKNEKRN KE+CKDQDVEMPIIAK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

KAA0066096.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold21G00870 [Cucumis melo var. makuwa]0.093.08Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIV+GERIEYGIKHGRLAE TTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIF QRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPS+ISNVSHIPYNSYVPAHT+SETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLA IPMIPIQP YPKWYDSNARCDYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTEN LALKR VQSLIN GWLSFKKSGEK NVNENPLPDHENPK          CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPK----------CKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFH+GVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQ KDEMKDSK+C LMDEV EKKDSFLPRPLTVFYQESHNEST FCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLK VPW YDCQVITGP VDNITGISGITRS RCYKPDNLTVPS+GLILEQGRKNEKRN KEHCKDQDVEMPIIAK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T0H8 Uncharacterized protein6.4e-27196.44Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        M AEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNV ENPLPDHENP          KC+NEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMK SKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQES NESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNIT ISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPI+AK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

A0A5A7T0R1 Uncharacterized protein3.4e-27296.86Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNAR DYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINA WLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP          KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYV HEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSE KDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLKA+PWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

A0A5A7T7R4 Ribonuclease H1.0e-25292.67Show/hide
Query:  MTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISNVSH
        MTSMFMNTLRAPFYERMIGNAS   SDIIVIGERIEYGIKHGRLAE TTEYGGIKKGTI KKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISNVSH
Subjt:  MTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISNVSH

Query:  IPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLA
        I YNSYVP HTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKT+SDTWRFD IPMTYTELLPQLIQNRQLA IPMIPIQP YPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLA
Subjt:  IPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLA

Query:  LKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYDESRHCIFHRGVAG
        LKR VQSLIN GWLSFKKSGEK NVNENPLPDHENP          KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGY+ESRHCI H+GVAG
Subjt:  LKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYDESRHCIFHRGVAG

Query:  HVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQ
        HVVQQCQKFRSKVQQ MDSKILTVYRGQ KDEMKDSK+C LMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQ
Subjt:  HVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQ

Query:  VITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        VITGP VDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPS+GLILEQGRKNEKRN KEHCKDQDVEMPIIAK
Subjt:  VITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

A0A5A7V3W7 Retrotrans_gag domain-containing protein1.3e-24789.52Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        M AEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAE TTEYGGIKKGTISKKKEGE+HAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPSYISNVS+IPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSK NSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLA IPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTENC ALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEK NVNENPLP+HENP          KCKNEVHEIVMPMEALFE LFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFH+GVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQ KDEMKDSK+C LMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLKAVPWRYDC VIT                      DNLTVPS+GLILEQGRKNEKRN KE+CKDQDVEMPIIAK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

A0A5A7VIB2 Uncharacterized protein2.7e-26193.08Show/hide
Query:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY
        MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIV+GERIEYGIKHGRLAE TTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIF QRKY
Subjt:  MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKY

Query:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH
        EQNFPS+ISNVSHIPYNSYVPAHT+SETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLA IPMIPIQP YPKWYDSNARCDYH
Subjt:  EQNFPSYISNVSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYH

Query:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
        AGGVGHSTEN LALKR VQSLIN GWLSFKKSGEK NVNENPLPDHENP          KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD
Subjt:  AGGVGHSTENCLALKRNVQSLINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENP----------KCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYD

Query:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF
        ESRHCIFH+GVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQ KDEMKDSK+C LMDEV EKKDSFLPRPLTVFYQESHNEST FCNPKKLTIQVPSPFKF
Subjt:  ESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRGQGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKF

Query:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK
        KDLK VPW YDCQVITGP VDNITGISGITRS RCYKPDNLTVPS+GLILEQGRKNEKRN KEHCKDQDVEMPIIAK
Subjt:  KDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLILEQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCCGAGGTTCAACCACCGTTAACAGACAAAGAAATGACATCTATGTTTATGAATACCTTGCGGGCTCCATTCTATGAGCGAATGATTGGTAATGCATCAACAAA
TTTTTCTGATATTATTGTTATTGGTGAAAGAATTGAATATGGGATAAAACACGGGAGGTTAGCAGAGGCTACAACTGAATATGGTGGAATAAAGAAAGGAACAATATCCA
AGAAGAAAGAAGGAGAGGTTCATGCAATTGGTTTTCCTAATTCAGGGAAGCACAAATCAATTTTTGGTCAGAGAAAATATGAGCAAAACTTTCCGTCATATATAAGCAAT
GTCTCTCATATCCCTTATAATAGCTATGTACCAGCCCATACCGTCTCTGAAACTCCAAAACCCGTTAACTCAAATTCTCCTCGACCATTTGTACAGGGTCAAGGTAGCAA
AACCAATTCAGATACATGGCGGTTTGATCCGATTCCCATGACTTATACAGAGCTTTTACCTCAACTAATTCAAAATCGACAGTTAGCTTCTATTCCAATGATTCCTATAC
AACCTCCTTACCCAAAATGGTATGATTCAAATGCTCGATGTGATTATCACGCTGGGGGAGTGGGACACTCAACTGAAAATTGTTTGGCTTTGAAAAGAAATGTGCAATCT
CTAATTAATGCTGGATGGTTGAGCTTCAAAAAATCTGGTGAGAAGTCGAATGTCAATGAAAATCCACTGCCTGATCATGAAAATCCAAAATGCAAAAATGAAGTCCATGA
GATAGTGATGCCTATGGAAGCACTTTTTGAAGGTCTTTTTGAAGCAGGATATGTTAGTCATGAATATCTAGACCCCAACATAAGATATGAAGGGTATGATGAAAGCAGAC
ATTGTATATTCCATCGAGGAGTTGCAGGCCACGTTGTCCAACAATGCCAAAAATTTAGATCCAAAGTACAACAACTTATGGATTCAAAGATACTCACGGTATATAGAGGA
CAAGGAAAAGACGAGATGAAAGACAGTAAAATATGTGTTTTAATGGATGAAGTTTCAGAAAAGAAAGATTCCTTTTTACCAAGACCTTTGACAGTTTTTTATCAAGAAAG
TCATAATGAGTCAACCAGCTTCTGCAATCCTAAAAAACTCACGATCCAAGTACCGAGTCCTTTCAAATTTAAGGATCTAAAAGCAGTGCCATGGCGGTATGATTGTCAGG
TCATAACAGGTCCTTTAGTTGATAACATTACAGGAATCAGCGGGATAACCCGAAGTGGAAGATGCTACAAACCAGATAACTTAACAGTCCCTTCAAATGGTCTAATACTG
GAGCAAGGTAGAAAAAATGAGAAAAGAAATGCGAAAGAGCATTGCAAAGACCAAGATGTGGAGATGCCTATCATTGCAAAGATATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCCGAGGTTCAACCACCGTTAACAGACAAAGAAATGACATCTATGTTTATGAATACCTTGCGGGCTCCATTCTATGAGCGAATGATTGGTAATGCATCAACAAA
TTTTTCTGATATTATTGTTATTGGTGAAAGAATTGAATATGGGATAAAACACGGGAGGTTAGCAGAGGCTACAACTGAATATGGTGGAATAAAGAAAGGAACAATATCCA
AGAAGAAAGAAGGAGAGGTTCATGCAATTGGTTTTCCTAATTCAGGGAAGCACAAATCAATTTTTGGTCAGAGAAAATATGAGCAAAACTTTCCGTCATATATAAGCAAT
GTCTCTCATATCCCTTATAATAGCTATGTACCAGCCCATACCGTCTCTGAAACTCCAAAACCCGTTAACTCAAATTCTCCTCGACCATTTGTACAGGGTCAAGGTAGCAA
AACCAATTCAGATACATGGCGGTTTGATCCGATTCCCATGACTTATACAGAGCTTTTACCTCAACTAATTCAAAATCGACAGTTAGCTTCTATTCCAATGATTCCTATAC
AACCTCCTTACCCAAAATGGTATGATTCAAATGCTCGATGTGATTATCACGCTGGGGGAGTGGGACACTCAACTGAAAATTGTTTGGCTTTGAAAAGAAATGTGCAATCT
CTAATTAATGCTGGATGGTTGAGCTTCAAAAAATCTGGTGAGAAGTCGAATGTCAATGAAAATCCACTGCCTGATCATGAAAATCCAAAATGCAAAAATGAAGTCCATGA
GATAGTGATGCCTATGGAAGCACTTTTTGAAGGTCTTTTTGAAGCAGGATATGTTAGTCATGAATATCTAGACCCCAACATAAGATATGAAGGGTATGATGAAAGCAGAC
ATTGTATATTCCATCGAGGAGTTGCAGGCCACGTTGTCCAACAATGCCAAAAATTTAGATCCAAAGTACAACAACTTATGGATTCAAAGATACTCACGGTATATAGAGGA
CAAGGAAAAGACGAGATGAAAGACAGTAAAATATGTGTTTTAATGGATGAAGTTTCAGAAAAGAAAGATTCCTTTTTACCAAGACCTTTGACAGTTTTTTATCAAGAAAG
TCATAATGAGTCAACCAGCTTCTGCAATCCTAAAAAACTCACGATCCAAGTACCGAGTCCTTTCAAATTTAAGGATCTAAAAGCAGTGCCATGGCGGTATGATTGTCAGG
TCATAACAGGTCCTTTAGTTGATAACATTACAGGAATCAGCGGGATAACCCGAAGTGGAAGATGCTACAAACCAGATAACTTAACAGTCCCTTCAAATGGTCTAATACTG
GAGCAAGGTAGAAAAAATGAGAAAAGAAATGCGAAAGAGCATTGCAAAGACCAAGATGTGGAGATGCCTATCATTGCAAAGATATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAEVQPPLTDKEMTSMFMNTLRAPFYERMIGNASTNFSDIIVIGERIEYGIKHGRLAEATTEYGGIKKGTISKKKEGEVHAIGFPNSGKHKSIFGQRKYEQNFPSYISN
VSHIPYNSYVPAHTVSETPKPVNSNSPRPFVQGQGSKTNSDTWRFDPIPMTYTELLPQLIQNRQLASIPMIPIQPPYPKWYDSNARCDYHAGGVGHSTENCLALKRNVQS
LINAGWLSFKKSGEKSNVNENPLPDHENPKCKNEVHEIVMPMEALFEGLFEAGYVSHEYLDPNIRYEGYDESRHCIFHRGVAGHVVQQCQKFRSKVQQLMDSKILTVYRG
QGKDEMKDSKICVLMDEVSEKKDSFLPRPLTVFYQESHNESTSFCNPKKLTIQVPSPFKFKDLKAVPWRYDCQVITGPLVDNITGISGITRSGRCYKPDNLTVPSNGLIL
EQGRKNEKRNAKEHCKDQDVEMPIIAKI