; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021119 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021119
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionUDP-glucose 4-epimerase
Genome locationchr11:20190795..20191726
RNA-Seq ExpressionIVF0021119
SyntenyIVF0021119
Gene Ontology termsGO:0006012 - galactose metabolic process (biological process)
GO:0003978 - UDP-glucose 4-epimerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001509 - NAD-dependent epimerase/dehydratase
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044897.1 UDP-glucose 4-epimerase GEPI48-like [Cucumis melo var. makuwa]1.02e-4190.36Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAAG--CEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGK
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL AAG  CEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAAG--CEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGK

KAE8710786.1 UDP-glucose 4-epimerase 1 [Hibiscus syriacus]1.88e-4287.95Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGK
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL     GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGK

KDO76557.1 hypothetical protein CISIN_1g026752mg [Citrus sinensis]9.73e-4277.08Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFFCICFLE
        MPFV QVAVGRRP LTVFG+DYSTKDGT VRDY+H++DLADGHIAAL KL     GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGKV +   FCI F+ 
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFFCICFLE

RRT73022.1 hypothetical protein B296_00002302 [Ensete ventricosum]6.54e-4279.12Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA---GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFF
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H++DLADGHIAAL+KL      GCE YNLG+GKGTSVLEMVA FEKASGKV+L +F+
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA---GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFF

RWW34432.1 hypothetical protein GW17_00000808 [Ensete ventricosum]1.29e-4179.12Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA---GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFF
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H++DLADGHIAAL+KL      GCE YNLG+GKGTSVLEMVA FEKASGKV+L +F+
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA---GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BS45 UDP-glucose 4-epimerase4.3e-3387.36Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL AA  GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

A0A5A7TSN5 UDP-glucose 4-epimerase4.3e-3387.36Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL AA  GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

A0A6J1ETR8 UDP-glucose 4-epimerase9.6e-3386.21Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DY+TKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL AA  GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

A0A6J1J0C8 UDP-glucose 4-epimerase9.6e-3386.21Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DYSTKDGT VRDY+H+VDLADGHIAA+RKL AA  GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

A0A6J1J4U1 UDP-glucose 4-epimerase9.6e-3386.21Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DY+TKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL AA  GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAA--GCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65781 UDP-glucose 4-epimerase GEPI481.2e-3280.46Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRPALTVFG+DY+T DGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL     GCEVYNLGTGKGTSVLEMV  FE+ASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

Q6K2E1 UDP-glucose 4-epimerase 43.0e-3174.71Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLV--AAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRP+LT+FG+DY+TKDGT VRDY+H+VDLA+GHIAALRKL   + GC+ YNLGTGKGTSVLE+V  FEK SGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLV--AAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

Q8LNZ3 UDP-glucose 4-epimerase 12.9e-3480.22Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLV----AAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYF
        MPFVQQVAVGRRPALTV+G+DY+TKDGT VRDY+H+VDLADGHIAALRKL       GCEVYNLGTGKGTSVLEMVA FEKASGK + L F
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLV----AAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYF

Q9SN58 UDP-glucose 4-epimerase 52.7e-3279.31Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRP LTVFG+DY+TKDGT VRDY+H++DLADGHIAALRKL     GCEVYNLGTG GTSVLEMV  FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

Q9T0A7 UDP-glucose 4-epimerase 27.8e-3278.16Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MP+VQQVAVGRRP LTVFG+DY TKDGT VRDY+H++DLADGHIAALRKL  +   CEVYNLGTG GTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12780.1 UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 14.4e-3070.93Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVA---AGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVV
        MP++QQVAVGR P L V+G DY T+DG+ VRDY+H++DLADGHIAALRKL A    GC  YNLGTG+GTSVLEMVA FEKASGK +
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVA---AGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVV

AT1G63180.1 UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 36.4e-2967.44Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVA---AGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVV
        MP++QQVAVGR P L VFG DY T DG+ VRDY+H++DLADGH+AAL KL +    GC  YNLGTG+GTSVLEMV++FEKASGK +
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVA---AGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVV

AT1G64440.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.7e-2970.11Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MP+VQQV VGR P L ++G+DY+TKDGT VRDY+H+VDLADGHI AL+KL     GCEVYNLGTGKGT+VLEMV  FEKASG  + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

AT4G10960.1 UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 51.9e-3379.31Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MPFVQQVAVGRRP LTVFG+DY+TKDGT VRDY+H++DLADGHIAALRKL     GCEVYNLGTG GTSVLEMV  FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL

AT4G23920.1 UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase 25.6e-3378.16Show/hide
Query:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL
        MP+VQQVAVGRRP LTVFG+DY TKDGT VRDY+H++DLADGHIAALRKL  +   CEVYNLGTG GTSVLEMVA FEKASGK + L
Subjt:  MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKL--VAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCTTTGTACAACAAGTTGCTGTCGGCAGGCGTCCTGCCTTGACAGTCTTTGGATCTGACTATTCAACAAAAGATGGAACCGAAGTACGTGATTATCTTCACATTGT
TGATTTAGCTGATGGACACATTGCTGCATTGCGCAAGCTAGTTGCGGCTGGTTGTGAAGTTTACAATTTGGGAACTGGAAAGGGTACATCAGTCTTGGAGATGGTTGCAA
CTTTTGAAAAGGCATCTGGAAAGGTAGTTTTACTCTACTTCTTTTGCATTTGTTTTCTAGAAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCCTTTGTACAACAAGTTGCTGTCGGCAGGCGTCCTGCCTTGACAGTCTTTGGATCTGACTATTCAACAAAAGATGGAACCGAAGTACGTGATTATCTTCACATTGT
TGATTTAGCTGATGGACACATTGCTGCATTGCGCAAGCTAGTTGCGGCTGGTTGTGAAGTTTACAATTTGGGAACTGGAAAGGGTACATCAGTCTTGGAGATGGTTGCAA
CTTTTGAAAAGGCATCTGGAAAGGTAGTTTTACTCTACTTCTTTTGCATTTGTTTTCTAGAAACTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPFVQQVAVGRRPALTVFGSDYSTKDGTEVRDYLHIVDLADGHIAALRKLVAAGCEVYNLGTGKGTSVLEMVATFEKASGKVVLLYFFCICFLET