; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021180 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021180
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr07:5622171..5622401
RNA-Seq ExpressionIVF0021180
SyntenyIVF0021180
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0056563.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.26e-3786.84Show/hide
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KAA0057258.1 hypothetical protein E6C27_scaffold280G00930 [Cucumis melo var. makuwa]8.18e-3885.53Show/hide
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TYK08719.1 hypothetical protein E5676_scaffold76G00220 [Cucumis melo var. makuwa]1.11e-3684.21Show/hide
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TYK27431.1 hypothetical protein E5676_scaffold325G001260 [Cucumis melo var. makuwa]1.06e-3785.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U437 Retrotransposon protein2.0e-2885.53Show/hide
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A0A5A7UL03 Retrotransposon protein2.3e-2986.84Show/hide
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A0A5D3CED6 Uncharacterized protein1.3e-2784.21Show/hide
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A0A5D3D580 Uncharacterized protein7.5e-2885.53Show/hide
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A0A5D3DUQ6 Uncharacterized protein1.2e-2885.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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