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IVF0021193 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021193
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionAFG1-like ATPase family protein
Genome locationchr11:6877797..6882273
RNA-Seq ExpressionIVF0021193
SyntenyIVF0021193
Gene Ontology termsGO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAA2965121.1 AFG1-like ATPase isoform X1 [Olea europaea subsp. europaea]1.93e-0790.32Show/hide
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CAA2965122.1 AFG1-like ATPase isoform X1 [Olea europaea subsp. europaea]1.17e-0790.32Show/hide
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CAA2965123.1 lactation elevated 1 isoform X1 [Olea europaea subsp. europaea]1.07e-0790.32Show/hide
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KAG6529779.1 hypothetical protein ZIOFF_011993 [Zingiber officinale]8.30e-0865.22Show/hide
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XP_016902926.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501079 [Cucumis melo]1.58e-1188.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061GWR4 AFG1-like ATPase family protein isoform 22.4e-0552.17Show/hide
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A0A199VJT4 Lactation elevated protein 11.9e-0565.22Show/hide
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A0A1S4E3W5 uncharacterized protein LOC1035010796.8e-0851.28Show/hide
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A0A2P2K7P6 Uncharacterized protein1.1e-0570.73Show/hide
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M5XEI6 Uncharacterized protein2.4e-0590.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G28070.1 AFG1-like ATPase family protein5.4e-0580.77Show/hide
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AT4G28070.2 AFG1-like ATPase family protein1.8e-0887.1Show/hide
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AT4G30490.1 AFG1-like ATPase family protein2.0e-0777.42Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GATGTAAGTTTGACTTCATATTTGGATATTTTTTACTTTTATAACCTCAATTTACATGGAAGTTTGTTACTTTTGTGA
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CCATCTCCATGGCAACCACAAACGACAAATGATGACAACCATCCCCATTTTCCATCTCCACGATGGAACCGGACAAAATACATGAAATAGAAGACCTTGAGAAGAAGAAG
AAGAAGGAAGAAAAGGATGGCTTATAACTTTGTTGGTGTGCCAATAGATGGCTGGGCTCAGTGTAGTTAATATTTCAAAGCCAACTTTGTGTTCTTTTTTGGGCAAGTTC
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TTGTGTTTTTTTTAACTTTTCAAGTGATTAATTTTTTTTTGAAAAGAAGGCATTTTAGAAAGAAAAAAAAGTGAATTTTGTTATAGTTCTCTATGTTGGTCTGAAAATTT
TGAACAATGTGTGGTGGCAGGGAGGAAGAGATGCAAAATCTGAACAGAAGTACAAACACAAAGATGGCATGATTGAGTTTGCTCTCCCTTTTGTTTACTTATTAGTGGCG
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CGATCCATGGAGCCTAGTTAGTTCTTCTAGTTTTGGCATTTCATGCAATGGCATTCACTTTGGGATACTGGGCATCGAAAATTTCAATCATAAGAAAAATTTCACTCTGG
CATTGGAAGGTGTCCCAATATTTGGACTCCACAACAGAACAGCAACGTATCGTTTTGTCACTTTGGTTGATGTAAGTTTGACTTCATATTTGGATATTTTTTACTTTTAT
AACCTCAATTTACATGGAAGTTTGTTACTTTTGTGACTTTAAGTCGTTTGCTAGAACCTTTGAACCCCAGTTTAATGAATATCTATTTGCTAGAACTTTGAAAATCGCCT
GTTCTTGTATTTTATTCTTGTTTATTTCCATTGATCTGTTTTTTAGAACAACTGAAGGCATTTTTAATCCCAAAACTATCATTCAAAGCAATAAAATTACATAAAAGATT
ATTCATGGAGAAAAACAAGTGATCTAATTGCAATGTTACATAATTTGCCTTGGTATTATTCATTGGACAAAGTGACTATAAGTTGATACCTTTTCTGTAACTATACACCA
TTGTAGTTTAAAATGGCCATGGAGTGTTTTAAATCAGTTGAAGGTGGTCTCTTAGTGGATACAAGTTGTGGTAGGGGTTTGTTTTCCAGAAATTTTGCAACATATGGATC
TTTCTCAAGTGTAATTGCTCTTGATTTCTTTGAGAATATGCTTCTTCAATGTTATGACTTCATTAAGAAAGATACTACTCTCTTGAACAAGTAATTTTAGTGACCTTTAT
TCTCTCTTAGTTTAGTTCTTTAGAACTGCAATCACTATTATATTCGGCTAGCTTGTGTATTATTATTCTATTGGCTAATGATGCAAGCTCTAACTAAATTTTACTTTCTG
CATTGAATAAGTATAGACTTGAGATATGTAGTGCCCATTTGATGTGTTATTTGTAAATATGATTTTTGTAAGAGTAGTTATAGCCACTTCTTACATTCTAGTTTTGCTGG
ATGGTCGATTAGGTATGGCTAAGTTGGCTTGGTCTATATTGAACTGATTTTGAGAAAAGTTTTGAATTGTAATGTACTTATCTTTACGTCATATATGCATTTAATATTAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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