; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021240 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021240
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationchr01:28716282..28716677
RNA-Seq ExpressionIVF0021240
SyntenyIVF0021240
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008451660.1 PREDICTED: rapid alkalinization factor-like [Cucumis melo]1.58e-74100Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
        MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCNAISRCRS
        DRGCNAISRCRS
Subjt:  DRGCNAISRCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]3.44e-6993.75Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
        MA  VSFLLPIFLLVAILTVSSTA TPSWVL GAHARCHGSMAECM EDIEF+MDSEINRRILADLNYISYDAL+ANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCNAISRCRS
        DRGCNAISRCRS
Subjt:  DRGCNAISRCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]4.61e-5777.12Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAT------TPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVSFLLP  L+ AILTVSSTA       +PSWVL GA ARCHGSMAECM ++IE+EM+SEINRRILA  NYISY+AL+AN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAT------TPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCNAISRCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCNAISRCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]3.10e-5575.42Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATT------PSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLP   + A LTV STA +      PSWVL  A A CHGSMA+CM +DIEF+MDSEINRRILAD+NYISYDALRAN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATT------PSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCNAISRCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCNAISRCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.50e-6283.9Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAT------TPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVSFLLP FL+ AILTVSSTA       TPSWVL GA ARCHGSMAECM  DIEFEM+S+INRRILADLNYISYDAL+AN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAT------TPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCNAISRCRS
        AEANPYDRGCNAISRCRS
Subjt:  AEANPYDRGCNAISRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein3.4e-5293.75Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
        MA  VSFLLPIFLLVAILTVSSTA TPSWVL GAHARCHGSMAECM EDIEF+MDSEINRRILADLNYISYDAL+ANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCNAISRCRS
        DRGCNAISRCRS
Subjt:  DRGCNAISRCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like2.9e-56100Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
        MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCNAISRCRS
        DRGCNAISRCRS
Subjt:  DRGCNAISRCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like2.9e-56100Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
        MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPY

Query:  DRGCNAISRCRS
        DRGCNAISRCRS
Subjt:  DRGCNAISRCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 334.9e-4377.12Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAT------TPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVSFLLP  L+ AILTVSSTA       +PSWVL GA ARCHGSMAECM ++IE+EM+SEINRRILA  NYISY+AL+AN+VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAT------TPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCNAISRCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCNAISRCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like1.2e-4175.42Show/hide
Query:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATT------PSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLP   + A LTV STA +      PSWVL  A A CHGSMA+CM +DIEF+MDSEINRRILAD+NYISYDALRAN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATT------PSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCNAISRCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCNAISRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.2e-2555.56Show/hide
Query:  PIFLLVAILTV----SSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAEC--MKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG
        P+ +++AILTV    ++  +  S       ++C+G++AEC     + EFEMDSEINRRILA   YISY ALR N+VPCSR+GASYYNC+ GA+ANPY RG
Subjt:  PIFLLVAILTV----SSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAEC--MKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG

Query:  CNAISRCR
        C+AI+RCR
Subjt:  CNAISRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor4.0e-2655.96Show/hide
Query:  LPIFLLVAILTVSSTATTPS----WVL-GGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG
        L + +L+    +S  A   S    WV+   +   C GS+ EC+ E+ EFE+DSE NRRILA   YISY AL+ NSVPCSR+GASYYNC+PGA+ANPY RG
Subjt:  LPIFLLVAILTVSSTATTPS----WVL-GGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG

Query:  CNAISRCRS
        C+AI+RCRS
Subjt:  CNAISRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 234.6e-2247.58Show/hide
Query:  LLPIFLLVAI----LTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECM----------------KEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGAS
        +  I L++A+    + VSS +T  +         C G++AEC                 +   EFEMDSEINRRILA   YISY ALR N++PCSR+GAS
Subjt:  LLPIFLLVAI----LTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECM----------------KEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGAS

Query:  YYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR
        YYNC+ GA+ANPY RGC+AI+RCR
Subjt:  YYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 223.7e-2450.89Show/hide
Query:  IFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGA-----------HARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANP
        I+ ++AIL +  +A   +   G +            + C GS+AEC+ E+ E E DS+I+RRILA   YISY A+R NSVPCSR+GASYYNCQ GA+ANP
Subjt:  IFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGA-----------HARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANP

Query:  YDRGCNAISRCR
        Y RGC+ I+RCR
Subjt:  YDRGCNAISRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 15.8e-2553.91Show/hide
Query:  IFLLVAILTVSSTATTP------------SWVLGGAH-ARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEA
        +FL + IL V   ++ P            +W   G + + CHGS+AEC+  + E EMDSEINRRILA   YISY +L+ NSVPCSR+GASYYNCQ GA+A
Subjt:  IFLLVAILTVSSTATTP------------SWVLGGAH-ARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEA

Query:  NPYDRGCNAISRCRS
        NPY RGC+ I+RCRS
Subjt:  NPYDRGCNAISRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 14.1e-2653.91Show/hide
Query:  IFLLVAILTVSSTATTP------------SWVLGGAH-ARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEA
        +FL + IL V   ++ P            +W   G + + CHGS+AEC+  + E EMDSEINRRILA   YISY +L+ NSVPCSR+GASYYNCQ GA+A
Subjt:  IFLLVAILTVSSTATTP------------SWVLGGAH-ARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEA

Query:  NPYDRGCNAISRCRS
        NPY RGC+ I+RCRS
Subjt:  NPYDRGCNAISRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.5e-1541.9Show/hide
Query:  LPIFLLVAILTVSSTA--TTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRR-ILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRGCN
        + I L++ +LT++  A     +W L  +     G + E    ++++ MDSE NRR + A  +YISY ALR N+VPCSR+G SYY+C+    ANPY RGC+
Subjt:  LPIFLLVAILTVSSTA--TTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRR-ILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRGCN

Query:  AISRC
         I+ C
Subjt:  AISRC

AT3G05490.1 ralf-like 222.6e-2550.89Show/hide
Query:  IFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGA-----------HARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANP
        I+ ++AIL +  +A   +   G +            + C GS+AEC+ E+ E E DS+I+RRILA   YISY A+R NSVPCSR+GASYYNCQ GA+ANP
Subjt:  IFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGA-----------HARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANP

Query:  YDRGCNAISRCR
        Y RGC+ I+RCR
Subjt:  YDRGCNAISRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.2e-2347.58Show/hide
Query:  LLPIFLLVAI----LTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECM----------------KEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGAS
        +  I L++A+    + VSS +T  +         C G++AEC                 +   EFEMDSEINRRILA   YISY ALR N++PCSR+GAS
Subjt:  LLPIFLLVAI----LTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECM----------------KEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGAS

Query:  YYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR
        YYNC+ GA+ANPY RGC+AI+RCR
Subjt:  YYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR

AT4G15800.1 ralf-like 338.2e-2755.56Show/hide
Query:  PIFLLVAILTV----SSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAEC--MKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG
        P+ +++AILTV    ++  +  S       ++C+G++AEC     + EFEMDSEINRRILA   YISY ALR N+VPCSR+GASYYNC+ GA+ANPY RG
Subjt:  PIFLLVAILTV----SSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAEC--MKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYDRG

Query:  CNAISRCR
        C+AI+RCR
Subjt:  CNAISRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAAAGAAGTGGATTGTATAGACATACCGGGAAGAGCAAGAGAGAAAGCAACAATGGCCGCCAAGGTTTCTTTTCTTCTTCCAATTTTCTTACTAGTTGCTATCCT
GACGGTCTCCTCCACGGCCACGACCCCGAGCTGGGTCCTAGGTGGAGCTCATGCTCGTTGTCACGGATCCATGGCAGAGTGCATGAAGGAAGATATTGAATTTGAGATGG
ACTCTGAGATCAACAGACGCATATTAGCAGATTTAAACTACATAAGCTATGATGCACTCAGGGCCAACTCAGTGCCATGCTCACGCAAAGGAGCATCTTACTACAACTGT
CAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTATGACCGTGGCTGTAATGCTATTTCTCGTTGTCGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTAAAGAAGTGGATTGTATAGACATACCGGGAAGAGCAAGAGAGAAAGCAACAATGGCCGCCAAGGTTTCTTTTCTTCTTCCAATTTTCTTACTAGTTGCTATCCT
GACGGTCTCCTCCACGGCCACGACCCCGAGCTGGGTCCTAGGTGGAGCTCATGCTCGTTGTCACGGATCCATGGCAGAGTGCATGAAGGAAGATATTGAATTTGAGATGG
ACTCTGAGATCAACAGACGCATATTAGCAGATTTAAACTACATAAGCTATGATGCACTCAGGGCCAACTCAGTGCCATGCTCACGCAAAGGAGCATCTTACTACAACTGT
CAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTATGACCGTGGCTGTAATGCTATTTCTCGTTGTCGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKEVDCIDIPGRAREKATMAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTATTPSWVLGGAHARCHGSMAECMKEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANSVPCSRKGASYYNC
QPGAEANPYDRGCNAISRCRS