CuGenDBv2

Gene ID	IVF0021282
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Dirigent protein
Genome location	tig00001472:140950..141602
RNA-Seq Expression	IVF0021282
Synteny	IVF0021282
Gene Ontology terms	GO:0048046 - apoplast (cellular component)
InterPro domains	IPR004265 - Dirigent protein IPR044859 - Allene oxide cyclase/Dirigent protein

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0052915.1 dirigent protein 19-like [Cucumis melo var. makuwa]

1.89e-112

100

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KAG6577817.1 Dirigent protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

7.81e-85

83.64

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KAG7015856.1 Dirigent protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

4.87e-85

83.64

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XP_023007642.1 dirigent protein 19-like [Cucurbita maxima]

2.45e-84

83.64

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        SL+LSS+FTL   SLLS  ++  E  ATHH  H H  RHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGV GPGVSQTTTPFGTMF FHDPLTT  DR SKLVGTS
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        EGTSITS  DGL+SISIAKISLRLR+HTGSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSP
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XP_038905738.1 dirigent protein 19-like [Benincasa hispida]

2.37e-87

84.02

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        M LSSL LSSIFTL  FSLLS  S+ VEA+ T+HHHHH H  +LRSLHFSLFQHETINKTGYFIV GVVGP VSQTTTPFGT+F FHDPLTT A+R SKL
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        VGT+EGTSITS  DGLQSISIAKISLRL+HH GSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSP
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2N9EIH7 Dirigent protein

8.9e-57

74.51

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        L +L S    + + HHHHHHHHH H  L+SLHFSLFQHETINKTGY IV GV GP  SQTTTPFGT+FAF DP+T  A+R SKLVG +EGTSITSS DGL
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        +SISIAKI+LRL++H GS+SIVGGTHN+KPS+HP+VGGTGDFLFVQGYVTSSP
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A0A5D3CJJ8 Dirigent protein

2.4e-86

100

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A0A6J1EB83 Dirigent protein

2.0e-64

82.42

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A0A6J1KZ97 Dirigent protein

5.2e-65

83.64

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        SL+LSS+FTL   SLLS  ++  E  AT  HH  H HRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGV GPGVSQTTTPFGTMF FHDPLTT  DR SKLVGTS
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A0A7N2R780 Dirigent protein

3.1e-57

71.17

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        L + + T+  F+LLS      +A ++ HHHHHHHH+ L+SLHFSLFQHETIN+TGY IV GV GPGVSQTTTPFGT+FAF DP+T  A+R SKLVG +EG
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        TSITS  DGL+SISIAKI+LRL++H+GS+SIVGGTHN+KPS+HP+VGGTGDFLFVQGYVTSSP
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1V1FH01 Pterocarpan synthase 1

4.9e-04

30.95

Show/hide

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        +TL  LLLS +   ++ S+        E K TH             LHF  + H+ +      +V      G ++ + PFGT+ A  DPLT G +  SKL
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Query:  VGTSEG--TSITSSFDGLQSISIAKISLRLRHHTGSLSIVGGTHNVKP--SNHPIVGGTGDFLFVQGY
        VG ++G  TSI+    GL  +     S     +  +LSI+     +        IVGGTG F F +GY
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I1JNN8 Pterocarpan synthase 1

4.9e-04

28.48

Show/hide

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        L+  LL S+ T  ++S L+ T +    +   H            LHF  F H+ +      +V      G ++   PFGT+ A  DPLT G ++ SKLVG
Subjt:  LSSLLLSSIFTLFFFSLLSLTSINVEAKATHHHHHHHHHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVVGPGVSQTTTPFGTMFAFHDPLTTGADRVSKLVG

Query:  TSEGTSITSSFDGLQSISIAKISLRLRHHTGSLSIVGGTHNVKPS---NHPIVGGTGDFLFVQGY
         ++G   + S + +  + +  ++       GS   V G + +         IVGGTG F F +GY
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G58170.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein

6.6e-04

24.54

Show/hide

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        + S  + F  S  +L  + +         +  HH+  +  HF ++ H+ +       V  +  P      T FG M    +PLT      SK+VG ++G 
Subjt:  LSSIFTLFFFSLLSLTSINVEAKATHHHHHHHHHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVVGPGVSQTTTPFGTMFAFHDPLTTGADRVSKLVGTSEGT

Query:  SITSSFDGLQSISIAKISLRLRHHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSS
           +S + +  +     ++    + GS   V G ++V  K    P++GG+G F F +GYV +S
Subjt:  SITSSFDGLQSISIAKISLRLRHHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGACTCTTTCTTCCCTCCTTCTCTCTTCCATTTTCACACTTTTTTTCTTCTCTCTCTTATCTTTGACCTCCATCAACGTCGAGGCCAAGGCCACTCACCATCATCATCA
CCACCACCACCACCGTCACCTTCGCTCTCTCCACTTCTCCCTCTTCCAACACGAAACAATCAACAAAACCGGTTACTTCATTGTGCCGGGGGTGGTTGGCCCCGGCGTCA
GCCAAACCACCACCCCATTTGGCACCATGTTTGCTTTCCACGACCCTTTAACCACCGGCGCGGATCGTGTCTCGAAGCTAGTAGGTACGTCGGAGGGAACCTCCATAACC
TCTAGCTTTGACGGCTTGCAAAGCATTAGCATAGCCAAGATCAGCTTGCGTTTGAGGCACCATACCGGTTCCCTCTCGATCGTTGGTGGGACTCATAATGTTAAACCGTC
GAACCACCCTATCGTGGGAGGGACCGGGGACTTCTTGTTTGTACAAGGCTATGTGACATCGTCTCCGTGTGGATCTTGTCGGCATCACGGTGGTTTACAAGTTGGAGTTT
CATCTTTACTGGCCACCCTATGCATAATAACTCTCTCTTTATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCAATAATCAATACCAACATGACTCTTTCTTCCCTCCTTCTCTCTTCCATTTTCACACTTTTTTTCTTCTCTCTCTTATCTTTGACCTCCATCAACGTCGAGGCCAAGGC
CACTCACCATCATCATCACCACCACCACCACCGTCACCTTCGCTCTCTCCACTTCTCCCTCTTCCAACACGAAACAATCAACAAAACCGGTTACTTCATTGTGCCGGGGG
TGGTTGGCCCCGGCGTCAGCCAAACCACCACCCCATTTGGCACCATGTTTGCTTTCCACGACCCTTTAACCACCGGCGCGGATCGTGTCTCGAAGCTAGTAGGTACGTCG
GAGGGAACCTCCATAACCTCTAGCTTTGACGGCTTGCAAAGCATTAGCATAGCCAAGATCAGCTTGCGTTTGAGGCACCATACCGGTTCCCTCTCGATCGTTGGTGGGAC
TCATAATGTTAAACCGTCGAACCACCCTATCGTGGGAGGGACCGGGGACTTCTTGTTTGTACAAGGCTATGTGACATCGTCTCCGTGTGGATCTTGTCGGCATCACGGTG
GTTTACAAGTTGGAGTTTCATCTTTACTGGCCACCCTATGCATAATAACTCTCTCTTTATAAAACAAAATTTACTTTTCTGAATAACTATGTAATCAGCTGCG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MTLSSLLLSSIFTLFFFSLLSLTSINVEAKATHHHHHHHHHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVVGPGVSQTTTPFGTMFAFHDPLTTGADRVSKLVGTSEGTSIT
SSFDGLQSISIAKISLRLRHHTGSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPCGSCRHHGGLQVGVSSLLATLCIITLSL

IVF0021282 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome