; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021399 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021399
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptiontranscription factor SPATULA
Genome locationchr08:3629750..3632133
RNA-Seq ExpressionIVF0021399
SyntenyIVF0021399
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TYK12876.1 transcription factor SPATULA [Cucumis melo var. makuwa]4.63e-292100Show/hide
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A0A1S3B0R8 transcription factor SPATULA9.4e-234100Show/hide
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A0A5D3CR49 Transcription factor SPATULA1.6e-228100Show/hide
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A0A6J1GF25 transcription factor SPATULA-like isoform X19.6e-16280.46Show/hide
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        TN  +TPF+L PPIQ HLVPFYLS S KSKE C R+ LR DHQ VN  + QSE TP  SCP NIP  PDL+ L+NGVS+EPCIIE NRS
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A0A6J1ILN5 transcription factor SPATULA-like isoform X13.3e-16280.56Show/hide
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Q0JNI9 Transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR-LIKE 153.1e-2472.41Show/hide
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Q6AT90 Transcription factor APG2.9e-2238.98Show/hide
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        T  A+A+A ++S+ P  +   + Q       S P FS      L  P PS         RA  PP    PPP         + +A  ++      PS   
Subjt:  TLPAAATAVSSSSPPDDISLFLQQIMRRSSSSAPHFS------LLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGQLNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGV

Query:  LHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLE--ALVEELPT--------KPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPN
          D   P  T+     SS   G  D  + +  D  + +  E  A  +EL          + +   SSKRSR AEVHNLSE+RRR RINEKM+ALQ LIPN
Subjt:  LHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLE--ALVEELPT--------KPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPN

Query:  SNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNSPGSLQYLQLSHMRM
         NK DKASML+EAIEYLK LQLQVQM+SM  G+ + PM  P +   +Q  HM+M
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Q8GZM7 Transcription factor PIF17.7e-2346.01Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+    Q+  P    M+  G
Subjt:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG

Q9FHA2 Transcription factor ALC1.7e-2244.32Show/hide
Query:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGQLNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE
        P PS   EL+  +R     T    P      + P + + V S+E F  S S G +               SS   G S+  + D++  E +         
Subjt:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGQLNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE

Query:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNSP
          +    R+S KR+  A+ HNLSEK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ L++ NGL L+PM  P
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Q9FUA4 Transcription factor SPATULA1.6e-4157.79Show/hide
Query:  SSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ
        SS+SVGAS  NE DE+DCESEEG EA+V+E P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ
Subjt:  SSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ

Query:  VQMLSMRNGLSLHPMNSPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPDQKTAPIH-PFMSDIGRTNAAETPFDLVPPIQAHLVPFYLSES
        VQML+MRNG++LHP+  PG +L  LQLS +R              +  N   L+  +Q  +  + P M      N   + + L P I++H  PF L  S
Subjt:  VQMLSMRNGLSLHPMNSPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPDQKTAPIH-PFMSDIGRTNAAETPFDLVPPIQAHLVPFYLSES

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20180.1 phytochrome interacting factor 3-like 55.4e-2446.01Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+    Q+  P    M+  G
Subjt:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG

AT2G20180.2 phytochrome interacting factor 3-like 55.4e-2446.01Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+    Q+  P    M+  G
Subjt:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG

AT2G20180.3 phytochrome interacting factor 3-like 55.4e-2446.01Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+    Q+  P    M+  G
Subjt:  LHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPD----QKTAPIHPFMSDIG

AT4G36930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-4257.79Show/hide
Query:  SSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ
        SS+SVGAS  NE DE+DCESEEG EA+V+E P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ
Subjt:  SSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQ

Query:  VQMLSMRNGLSLHPMNSPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPDQKTAPIH-PFMSDIGRTNAAETPFDLVPPIQAHLVPFYLSES
        VQML+MRNG++LHP+  PG +L  LQLS +R              +  N   L+  +Q  +  + P M      N   + + L P I++H  PF L  S
Subjt:  VQMLSMRNGLSLHPMNSPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPDQKTAPIH-PFMSDIGRTNAAETPFDLVPPIQAHLVPFYLSES

AT5G67110.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-2344.32Show/hide
Query:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGQLNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE
        P PS   EL+  +R     T    P      + P + + V S+E F  S S G +               SS   G S+  + D++  E +         
Subjt:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGQLNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE

Query:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNSP
          +    R+S KR+  A+ HNLSEK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ L++ NGL L+PM  P
Subjt:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCATTCTATTCCCAACAACTGCGATCGAAATGCATGTACTTCTTCGACGTGGACTCTCCCCGCCGCCGCCACCGCCGTCTCTTCCTCTTCCCCTCCCGACGATAT
CTCTCTGTTTCTTCAACAGATTATGCGGCGTTCCTCTTCCTCTGCTCCTCACTTCTCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCCATCTTCTCCGAGCTCACCTGCAACATTAGAG
CCTTCACCCCCCCAACCCATAACATTCCCCCTCCATACGGACAGCTCAATGCAGTGCCGGATGAGATCTCTGCCGTCGATTCTTCAGAACAATTTGCAAATTCCCCGTCA
TCCGGAGTATTACATGATCCCTTGCGCCCTTGTCCCACATCCATTCCACCCAACGCATCTTCTACGTCGGTTGGAGCTAGTGATCATAACGAAAACGATGAATTTGACTG
CGAAAGCGAGGAGGGTCTGGAGGCATTGGTTGAAGAGCTGCCTACAAAGCCCAATCCTCGCAGCTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCTGAAGTTCATAATTTGTCTGAAA
AGAGAAGGAGAAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTCTGCAAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACTGACAAGGCCTCGATGCTAGACGAAGCAATTGAATACCTG
AAGCAGCTTCAACTTCAAGTTCAGATGCTGTCGATGAGAAATGGCTTGAGTTTGCATCCTATGAACTCGCCTGGAAGTTTGCAATATCTCCAACTTTCCCACATGAGAAT
GGATTTTGGTGAAGAAAACAGGTCAATTTCTTCTGACCAAGATAGACCTAACCAGATCTTTCTCAGTTTGCCTGACCAAAAGACTGCCCCCATCCATCCTTTCATGTCAG
ACATTGGAAGAACTAATGCAGCTGAAACTCCATTTGATTTGGTCCCGCCCATCCAGGCTCACCTAGTCCCTTTTTACCTGAGTGAGTCCTCCAAGTCTAAGGAGGACTGC
AGCAGGGATTTACTGCGAGATGATCACCAGGCGGTGAATGTGAATGTGAGCCAATCGGAGAGAACTCCCTTAGCGTCATGCCCCTATAACATACCAGAGACTCCTGATTT
ACAAGGATTACAGAATGGCGTCTCAGTGGAACCATGCATCATTGAAAGAAATCGGTCTGATGTGCTTCTAAATTACACCCCAGAGCACAGCCTCGTATACCCTTCCCCTT
TTAATGGCATCAAACAAGAAGACCGACTGAAACAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATATACCCATTATTTTGGGTATGGTTTTATAGACGATTTGTAGGAGACGGAGAAAAAAAGCTGCCCACAAGTTCAGGACAGTAGCAGGGTAGCGCCGGGCATCGGAGTG
GACGATATTCAATTAAGTTAAAATGGCGACTTAGACTGCTGCTCTGCTTCGCTTTCCATTCCTCTAATATGGACCATTCTATTCCCAACAACTGCGATCGAAATGCATGT
ACTTCTTCGACGTGGACTCTCCCCGCCGCCGCCACCGCCGTCTCTTCCTCTTCCCCTCCCGACGATATCTCTCTGTTTCTTCAACAGATTATGCGGCGTTCCTCTTCCTC
TGCTCCTCACTTCTCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCCATCTTCTCCGAGCTCACCTGCAACATTAGAGCCTTCACCCCCCCAACCCATAACATTCCCCCTCCATACGGAC
AGCTCAATGCAGTGCCGGATGAGATCTCTGCCGTCGATTCTTCAGAACAATTTGCAAATTCCCCGTCATCCGGAGTATTACATGATCCCTTGCGCCCTTGTCCCACATCC
ATTCCACCCAACGCATCTTCTACGTCGGTTGGAGCTAGTGATCATAACGAAAACGATGAATTTGACTGCGAAAGCGAGGAGGGTCTGGAGGCATTGGTTGAAGAGCTGCC
TACAAAGCCCAATCCTCGCAGCTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCTGAAGTTCATAATTTGTCTGAAAAGAGAAGGAGAAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTCTGC
AAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACTGACAAGGCCTCGATGCTAGACGAAGCAATTGAATACCTGAAGCAGCTTCAACTTCAAGTTCAGATGCTGTCGATGAGAAAT
GGCTTGAGTTTGCATCCTATGAACTCGCCTGGAAGTTTGCAATATCTCCAACTTTCCCACATGAGAATGGATTTTGGTGAAGAAAACAGGTCAATTTCTTCTGACCAAGA
TAGACCTAACCAGATCTTTCTCAGTTTGCCTGACCAAAAGACTGCCCCCATCCATCCTTTCATGTCAGACATTGGAAGAACTAATGCAGCTGAAACTCCATTTGATTTGG
TCCCGCCCATCCAGGCTCACCTAGTCCCTTTTTACCTGAGTGAGTCCTCCAAGTCTAAGGAGGACTGCAGCAGGGATTTACTGCGAGATGATCACCAGGCGGTGAATGTG
AATGTGAGCCAATCGGAGAGAACTCCCTTAGCGTCATGCCCCTATAACATACCAGAGACTCCTGATTTACAAGGATTACAGAATGGCGTCTCAGTGGAACCATGCATCAT
TGAAAGAAATCGGTCTGATGTGCTTCTAAATTACACCCCAGAGCACAGCCTCGTATACCCTTCCCCTTTTAATGGCATCAAACAAGAAGACCGACTGAAACAATAGAGCT
GCAAGGATCATCAACATCGTTGACATTTTCTGTCACCCTCTATATTCTTATTCTCTTCAAATCATTCACTAGCATGGGGAAAAATTGTTGCTTTGAGCTGCCTAATTTCA
TTGTGGAGAGGATCTGCGCCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDHSIPNNCDRNACTSSTWTLPAAATAVSSSSPPDDISLFLQQIMRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGQLNAVPDEISAVDSSEQFANSPS
SGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYL
KQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNSPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQDRPNQIFLSLPDQKTAPIHPFMSDIGRTNAAETPFDLVPPIQAHLVPFYLSESSKSKEDC
SRDLLRDDHQAVNVNVSQSERTPLASCPYNIPETPDLQGLQNGVSVEPCIIERNRSDVLLNYTPEHSLVYPSPFNGIKQEDRLKQ