; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021484 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021484
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationchr05:7213861..7215160
RNA-Seq ExpressionIVF0021484
SyntenyIVF0021484
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047513.1 hypothetical protein E6C27_scaffold498G001420 [Cucumis melo var. makuwa]5.50e-4555.8Show/hide
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        MM MP PLF EYSVDRNHIS +SL    NAL++G+T+++++I ++E QN I   FE S PS LPL+ ELTF+ PMEDWSP  V  +GK+FSIESE+F++I
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        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE+
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KGN45637.1 hypothetical protein Csa_005027 [Cucumis sativus]5.90e-6261.49Show/hide
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           FEPSR S +P+  ++ F +PMEDWS  ++  + K FSIES++F +I+TTF  YNEVDT
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KGN61523.1 hypothetical protein Csa_006491 [Cucumis sativus]6.99e-7968.75Show/hide
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        +FKFEPS                                                     ILITS+GSQITFSAVP EEIIIREEVCFVKFV
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TYK26483.1 hypothetical protein E5676_scaffold313G00490 [Cucumis melo var. makuwa]5.16e-4156.2Show/hide
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        MM MP PLF EYSVDRNHIS +SL    NAL++G+T+++++I ++E QN I   FE S PS LPL+ ELTF+ PMEDWSP  V  +GK+FSIESE+F++I
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        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
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XP_031736681.1 uncharacterized protein LOC116402062 [Cucumis sativus]9.48e-7261.29Show/hide
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        +  FEPS PS LPL+ ELTF+ PMEDWS  QV+ +GK+FSIES++F +I+  FS + E +TILI S GS+++FS +P  E  + EE
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KB76 Uncharacterized protein1.6e-4761.49Show/hide
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A0A0A0LIE0 Uncharacterized protein2.2e-6068.75Show/hide
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A0A5A7TVD7 Uncharacterized protein1.6e-3455.8Show/hide
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A0A5D3DSC2 Uncharacterized protein2.7e-3456.2Show/hide
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        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
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A0A5D3DZ07 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein4.1e-2235.83Show/hide
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        MF +K+ N DP LDATS   +   D   LKF+PS F +IA ++ P F A + +    F  +SVD +H S++SL  F +A+L+G +++SM+IHL +  N +
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Query:  IFKFEPSRPSALPLHHELTFLP--MEDWSPNQVSLN-GKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSKGSQITFSAVPCEEIIIRE
        I +F+       PLHHELT  P   ED    Q  L+  K F ++S+    I+    ++     I +    S++ FS +  +EII+ E
Subjt:  IFKFEPSRPSALPLHHELTFLP--MEDWSPNQVSLN-GKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSKGSQITFSAVPCEEIIIRE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTCCATCAAGGTTGACAACCTTGATCCTTTTTTAGATGCAACCTCTCTATTCACCGAATTTATTAACGACGAAATCTGTCTCAAGTTTTCACCGTCGACGTTTTC
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GATGCTTCCGGAATGCTCTGTTGGAAGGTCAAACCTATTCCTCAATGAGTATCCATCTTCAAGAACCCCAAAATACCATAATCTTTAAATTTGAGCCTTCAAGGCCTTCT
GCACTACCATTGCATCATGAATTGACATTCTTGCCCATGGAAGATTGGTCTCCTAACCAAGTTAGCTTAAATGGAAAACTTTTCTCCATTGAGTCTGAAATGTTTAGCAA
TATTTTAACAACATTTTCTGTCTACAATGAAGTTGATACAATTTTGATTACCTCAAAGGGTTCACAAATCACATTCTCTGCGGTTCCATGTGAGGAGATAATTATTAGGG
AAGAGGTATGTTTTGTGAAATTTGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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