| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0032972.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.49e-184 | 59.1 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNSSIVQLLA +KLN DN LNTILVVD L FVL EECPQTP+SN NR SRKAYDRWIK NEKA VYILASM DVLAKKHESLAT KEIMDSLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
MFGQP+WSLRH+AIKYIYTK+MKEG SVREHV+DMMMHFNIAEVN GAIDEANQ
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
Query: -------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSL
E +S KRLS+G ITLKVGTGEMVSAKA+GDLKLF NDRYI+LKNVL IERLVK LL+QLEDNSL
Subjt: -------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSL
Query: PPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYS-------------------------------------------
PPCD CL+GKM+K SF GKGLRAKT ELV+S+LCG MNVKA+GGYEYFISFIDDYS
Subjt: PPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYS-------------------------------------------
Query: -------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTF
SKL+LEEISKN+TDRPSSSTKVVDKTRNIGQTH QEL EPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQI+ P++GIE+PL F
Subjt: -------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTF
Query: KQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTLMD
K+ MNDVD DQW+K+MDL+M+SMYSN VWTL+D
Subjt: KQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTLMD
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| KAA0035260.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.88e-171 | 61.95 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNSSIVQLLA EKLN DN LNTILVVDDLR VL +ECPQTPTSN NR SRKAYDRW+KA+EKA VYILA+M+DVLAKKH+ LAT K I+D+LK
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
MFG+PEWSLRH+AIKYIYTK+MK+ SVREHVLDMMMHFNI EVN GAIDEANQENNSWK LSEGEITLKVGTGEMVSAKA+G+LK
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
Query: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGG-----YEY
IERLVKSG LS+LEDNSLPPC+S LEGKM+KRSFTGKGLRAK ELV+SD+CG MNVKARGG YE
Subjt: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGG-----YEY
Query: ---------------------------FIS---------FIDDYS--SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDR
F+S I D+ +KLVL EISKN D+PSSSTKVVDKT+ GQTH QEL EPR S RV+ QP+R
Subjt: ---------------------------FIS---------FIDDYS--SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDR
Query: YLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWT
YLGLSE+ +V PN+GIE+PLT+KQ MNDVD DQW+KAM+LE++SM+ N VWT
Subjt: YLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWT
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| KAA0035827.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.81e-170 | 57.56 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNS IVQLLA EKLN DN LNTILVVDDLRF L EE QTP SN NR SRKAYD+ IKAN+KARVYILASMSDVLAKKHESLAT K+IMDSLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
MFGQ EWS+RH+AIKYIYTK MK+G SVREHV+DMMMHFNI EVNGG IDEANQ
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
Query: -------------------------------------------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKV
N K +GEITLKV TG+MVSAKA+GDLKLF+NDRYI+LKNVL
Subjt: -------------------------------------------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKV
Query: SSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYSS------
I RLVK+GLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKM KRSFTGKGLR K S EL++SDLCG MNVKARGGYEYFISFIDDYS
Subjt: SSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYSS------
Query: -----------KLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKA
K EI +N +DRPSSSTKVVDKTRNIGQT+ Q+LGEPRRSGRV+RQPDRYLGLSEAQI+ P++GIE+PL++KQ MNDVD D+W+KA
Subjt: -----------KLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKA
Query: MDLEMKSMY
MDLEM+S++
Subjt: MDLEMKSMY
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| KAA0035987.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.07e-187 | 63.28 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MN IVQLLA EKLN DN LNTILVVDDLRFVL EECPQTP SN NR SRK YDRWIKA+EKA VYILASMSDVLAKKHESLATTK+I+DSLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
MFGQ EWS+RH+ IKYIYTK+MKE S+REHVLDMMMH NIAEVNGGAIDEANQEN+SWK+LSEGE+TLKVGTGEMVSAKA+GDLKLFF+DRYIMLKNVL
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
Query: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKG-----LRAKTSSEL-------------VNSDLC
T +RLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKM+KRSFTGKG LR+ E + S L
Subjt: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKG-----LRAKTSSEL-------------VNSDLC
Query: GSMNVKARGGYE-----YFISFIDDYS----------------------------------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTK
+ GGY Y ++ + S SKLVLEEISKNTTDRPSSSTK
Subjt: GSMNVKARGGYE-----YFISFIDDYS----------------------------------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTK
Query: VVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSV
VVDKTR+IGQTHL QELGEPRRSGRV+RQPDRYLGLSEAQIV P+NGI++PLT+KQTMNDVDCDQWVKAMDLE++SMYSNSV
Subjt: VVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSV
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| TYK29680.1 putative polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.14e-174 | 58.77 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLN-------RDNLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNS+IVQLL+ EKLN + NLNTILVVDDLRF L ++CPQTPTSN NR S KAYDRWIKANEK RVYILASMSDVLAKKHESLAT KEIM+SLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLN-------RDNLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
MFGQPEWSLRH+AIKYIYTK+MKEG SVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
Query: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFI
VSSNAFLWHL LGHINLNRI RLV+SGLL+QLEDNSLPP DSC EGKM+KRSFTGKGLRAKT ELV+SDLCG MNVKAR GYEYFISFI
Subjt: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFI
Query: DDYS--SKLVLEEISKNTTDR-------------------PSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSG-----------RVIRQPDRYLGLSEAQIVT
DDYS + L + N+ ++ ++ +++ + P EL + R+ V+ PDRYLGLSEAQI+
Subjt: DDYS--SKLVLEEISKNTTDR-------------------PSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSG-----------RVIRQPDRYLGLSEAQIVT
Query: PNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTL------MDVKTTFLDGNLEESIYKVQPEGFIQKGQEQKAEKKFWNEEEVENYKVIAYI
++GIE+PLT+KQ MNDVDCDQW+K MDLEM+SMYSNSVWTL MDVKT FL+GNLEESIY VQPEGFIQKG+EQK N +E YK I
Subjt: PNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTL------MDVKTTFLDGNLEESIYKVQPEGFIQKGQEQKAEKKFWNEEEVENYKVIAYI
Query: LAKVFRVLQAHAILM--ND
VF VL A IL+ ND
Subjt: LAKVFRVLQAHAILM--ND
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T2N1 Gag/pol protein | 7.4e-138 | 57.56 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRD-------NLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNS IVQLLA EKLN D NLNTILVVDDLRF L EE QTP SN NR SRKAYD+ IKAN+KARVYILASMSDVLAKKHESLAT K+IMDSLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRD-------NLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
MFGQ EWS+RH+AIKYIYTK MK+G SVREHV+DMMMHFNI EVNGG IDEANQ
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
Query: -------------------------------------------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKV
N K +GEITLKV TG+MVSAKA+GDLKLF+NDRYI+LKNVL
Subjt: -------------------------------------------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKV
Query: SSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYSS------
I RLVK+GLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKM KRSFTGKGLR K S EL++SDLCG MNVKARGGYEYFISFIDDYS
Subjt: SSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYSS------
Query: -----------KLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKA
K EI +N +DRPSSSTKVVDKTRNIGQT+ Q+LGEPRRSGRV+RQPDRYLGLSEAQI+ P++GIE+PL++KQ MNDVD D+W+KA
Subjt: -----------KLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKA
Query: MDLEMKSMY
MDLEM+S++
Subjt: MDLEMKSMY
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| A0A5D3C7X2 Gag/pol protein | 1.8e-136 | 61.95 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRD-------NLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNSSIVQLLA EKLN D NLNTILVVDDLR VL +ECPQTPTSN NR SRKAYDRW+KA+EKA VYILA+M+DVLAKKH+ LAT K I+D+LK
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRD-------NLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
MFG+PEWSLRH+AIKYIYTK+MK+ SVREHVLDMMMHFNI EVN GAIDEANQENNSWK LSEGEITLKVGTGEMVSAKA+G+LK
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
Query: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGG-----YE-
IERLVKSG LS+LEDNSLPPC+S LEGKM+KRSFTGKGLRAK ELV+SD+CG MNVKARGG YE
Subjt: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGG-----YE-
Query: --------------------------YFIS---------FIDDYS--SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDR
F+S I D+ +KLVL EISKN D+PSSSTKVVDKT+ GQTH QEL EPR S RV+ QP+R
Subjt: --------------------------YFIS---------FIDDYS--SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDR
Query: YLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWT
YLGLSE+ +V PN+GIE+PLT+KQ MNDVD DQW+KAM+LE++SM+ N VWT
Subjt: YLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWT
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| A0A5D3DE90 Gag/pol protein | 2.6e-151 | 59.1 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRD-------NLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNSSIVQLLA +KLN D NLNTILVVD L FVL EECPQTP+SN NR SRKAYDRWIK NEKA VYILASM DVLAKKHESLAT KEIMDSLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRD-------NLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
MFGQP+WSLRH+AIKYIYTK+MKEG SVREHV+DMMMHFNIAEVN GAIDEANQ
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ----------------------------------------------
Query: -------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSL
E +S KRLS+G ITLKVGTGEMVSAKA+GDLKLF NDRYI+LKNVL IERLVK LL+QLEDNSL
Subjt: -------ENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVLTTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSL
Query: PPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYS-------------------------------------------
PPCD CL+GKM+K SF GKGLRAKT ELV+S+LCG MNVKA+GGYEYFISFIDDYS
Subjt: PPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFIDDYS-------------------------------------------
Query: -------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTF
SKL+LEEISKN+TDRPSSSTKVVDKTRNIGQTH QEL EPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQI+ P++GIE+PL F
Subjt: -------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTF
Query: KQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTLMD
K+ MNDVD DQW+K+MDL+M+SMYSN VWTL+D
Subjt: KQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTLMD
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| A0A5D3E2A3 Putative polyprotein | 1.9e-141 | 58.83 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLN-------RDNLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MNS+IVQLL+ EKLN + NLNTILVVDDLRF L ++CPQTPTSN NR S KAYDRWIKANEK RVYILASMSDVLAKKHESLAT KEIM+SLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLN-------RDNLNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
MFGQPEWSLRH+AIKYIYTK+MKEG SVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQ
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
Query: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFI
VSSNAFLWHL LGHINLNRI RLV+SGLL+QLEDNSLPP DSC EGKM+KRSFTGKGLRAKT ELV+SDLCG MNVKAR GYEYFISFI
Subjt: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKGLRAKTSSELVNSDLCGSMNVKARGGYEYFISFI
Query: DDYS--SKLVLEEISKNTTDR-------------------PSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRS-----------GRVIRQPDRYLGLSEAQIVT
DDYS + L + N+ ++ ++ +++ + P EL + R+ V+ PDRYLGLSEAQI+
Subjt: DDYS--SKLVLEEISKNTTDR-------------------PSSSTKVVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRS-----------GRVIRQPDRYLGLSEAQIVT
Query: PNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTL------MDVKTTFLDGNLEESIYKVQPEGFIQKGQEQKAEKKFWNEEEVENYKVIAYI
++GIE+PLT+KQ MNDVDCDQW+K MDLEM+SMYSNSVWTL MDVKT FL+GNLEESIY VQPEGFIQKG+EQK N +E YK I
Subjt: PNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSVWTL------MDVKTTFLDGNLEESIYKVQPEGFIQKGQEQKAEKKFWNEEEVENYKVIAYI
Query: LAKVFRVLQAHAILM
VF VL A IL+
Subjt: LAKVFRVLQAHAILM
|
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| A0A5D3E3F1 Gag/pol protein | 1.1e-149 | 63.28 | Show/hide |
Query: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
MN IVQLLA EKLN DN LNTILVVDDLRFVL EECPQTP SN NR SRK YDRWIKA+EKA VYILASMSDVLAKKHESLATTK+I+DSLKG
Subjt: MNSSIVQLLAFEKLNRDN-------LNTILVVDDLRFVLIEECPQTPTSNVNRISRKAYDRWIKANEKARVYILASMSDVLAKKHESLATTKEIMDSLKG
Query: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
MFGQ EWS+RH+ IKYIYTK+MKE S+REHVLDMMMH NIAEVNGGAIDEANQEN+SWK+LSEGE+TLKVGTGEMVSAKA+GDLKLFF+DRYIMLKNVL
Subjt: MFGQPEWSLRHKAIKYIYTKQMKEGASVREHVLDMMMHFNIAEVNGGAIDEANQENNSWKRLSEGEITLKVGTGEMVSAKAMGDLKLFFNDRYIMLKNVL
Query: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKG-----LRAKTSSEL-------------VNSDLC
T +RLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKM+KRSFTGKG LR+ E + S L
Subjt: TTETQDKRQKVSSNAFLWHLTLGHINLNRIERLVKSGLLSQLEDNSLPPCDSCLEGKMSKRSFTGKG-----LRAKTSSEL-------------VNSDLC
Query: GSMNVKARGGYE-----YFISFIDDYS----------------------------------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTK
+ GGY Y ++ + S SKLVLEEISKNTTDRPSSSTK
Subjt: GSMNVKARGGYE-----YFISFIDDYS----------------------------------------------------SKLVLEEISKNTTDRPSSSTK
Query: VVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSV
VVDKTR+IGQTHL QELGEPRRSGRV+RQPDRYLGLSEAQIV P+NGI++PLT+KQTMNDVDCDQWVKAMDLE++SMYSNSV
Subjt: VVDKTRNIGQTHLPQELGEPRRSGRVIRQPDRYLGLSEAQIVTPNNGIENPLTFKQTMNDVDCDQWVKAMDLEMKSMYSNSV
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