CuGenDBv2

Gene ID	IVF0021626
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	TPRXL protein
Genome location	chr03:18389319..18390019
RNA-Seq Expression	IVF0021626
Synteny	IVF0021626
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]

1.50e-120

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TYK04543.1 TPRXL protein [Cucumis melo var. makuwa]

2.26e-76

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        IVGHGSASRGTLND
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]

5.05e-124

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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]

1.87e-133

91.85

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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]

1.01e-109

82.4

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein

2.4e-95

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A0A1S4E178 Uncharacterized protein

1.5e-102

91.85

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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein

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A0A5D3BXS7 TPRXL protein

8.7e-58

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        IVGHGSASRGTLND
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein

4.6e-59

66.38

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        SSIFPRL PR+SR  P   SS  S+S SSS +SWSSS SSSSSSP    +  FFKRRR  SD PSLPFEYSFDD DGDE   GS+  NSPTS LCFGG S
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        SSRAS F GCYQLVSVK A LS+VGHGSA RGT+N
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G40475.1 unknown protein

1.4e-07

33.17

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        ++ + KE +   +SS   YYGGA+                      +PPLTPPPSY+SSS S+ +K S   T+  + F +    +  + PSFS SS SSS
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Query:  SSSSLASWSSSFSSSSSSPSPFVRPKFFKRRRHFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSTAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKKALLSIVGH
        SSSS         SSSS PS        + R+ +S         S+  +D +E +  S    SPTS LC+  G SS          + S+K+AL S++ H
Subjt:  SSSSLASWSSSFSSSSSSPSPFVRPKFFKRRRHFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSTAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKKALLSIVGH

Query:  GSASR
        GS+ +
Subjt:  GSASR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGCGCCACTGACACTTCAATCCCTCCTCTTACTCCTCCTCCGTCTTACTTTTCCTCTTCACATTCTACTTCCAAAGCCTCTTCCA
AACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGCCTTACACCAAGGAAATCTCGAACTTTCCCATCTTTCTCCTCCTCTTCTGGCTCCTCTTCCTCATCCTCTTCATTAGCT
TCATGGTCATCCTCTTTCTCATCGTCCTCCTCATCTCCCTCGCCTTTCGTTAGACCTAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCACTTCTCGGATATTCCAAGCTTACCGTTTGA
GTATAGTTTTGACGATAAAGACGGAGACGAGGTGGTGGCCGGGAGTACTGCTCCGAATTCTCCTACTTCAATTTTGTGCTTTGGTGGTGGTTCTTCAAGCAGAGCTTCAT
TGTTTGGAGGTTGTTATCAGTTAGTGAGTGTGAAGAAAGCTTTGTTGTCCATTGTTGGCCATGGATCTGCAAGTAGAGGTACTCTTAATGATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MQTQNYDQISQKSSQITKHEDRFFTRALSKELNSTTNSSFRVYYGGATDTSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTFPSFSSSSGSSSSSSSLA
SWSSSFSSSSSSPSPFVRPKFFKRRRHFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSTAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKKALLSIVGHGSASRGTLND

IVF0021626 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome