; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0021872 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0021872
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSWIM-type domain-containing protein
Genome locationchr03:13014782..13015053
RNA-Seq ExpressionIVF0021872
SyntenyIVF0021872
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0044308.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold46G00290 [Cucumis melo var. makuwa]8.26e-3795.45Show/hide
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KAA0063901.1 hypothetical protein E6C27_scaffold616G00270 [Cucumis melo var. makuwa]6.29e-42100Show/hide
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KGN51592.1 hypothetical protein Csa_008873 [Cucumis sativus]1.39e-3884.72Show/hide
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TYK02495.1 hypothetical protein E5676_scaffold784G00190 [Cucumis melo var. makuwa]5.60e-3790.91Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KT57 Uncharacterized protein1.6e-2784.72Show/hide
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A0A5A7SW50 SWIM-type domain-containing protein8.3e-2992.42Show/hide
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A0A5A7TN56 SWIM-type domain-containing protein5.8e-3095.45Show/hide
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A0A5A7VDU8 SWIM-type domain-containing protein6.2e-32100Show/hide
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A0A5D3BS92 SWIM-type domain-containing protein5.8e-3095.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATGCTACTTGTTATTATTGGCCTGAGTTGTCATTCACCGAAGTTCGCCCAAATGCAAACTTACTTAAAGGACCCGATCGACCGAGAACAACAAGGATCCATAATGA
AATGGATTGGAAAGAGTCTGGTCAATCACTCAGATGCACTATCTGTAAAGTCGAAGGACACAACAGACGTATTTGTCCTCAACGTGCATCTTCTTCTTCAAGACACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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