CuGenDBv2

Gene ID	IVF0021959
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	ATP synthase subunit alpha
Genome location	chr12:4484364..4484726
RNA-Seq Expression	IVF0021959
Synteny	IVF0021959
Gene Ontology terms	GO:0006754 - ATP biosynthetic process (biological process) GO:1902600 - proton transmembrane transport (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0016020 - membrane (cellular component) GO:0043231 - intracellular membrane-bounded organelle (cellular component) GO:0032559 - adenyl ribonucleotide binding (molecular function)
InterPro domains	IPR004100 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain IPR023366 - ATP synthase subunit alpha, N-terminal domain-like superfamily IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase IPR036121 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

AQM55888.1 ATP synthase subunit 1, partial [Curcuma haritha]

5.96e-43

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AQM55890.1 ATP synthase subunit 1, partial [Curcuma neilgherrensis]

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AQM55891.1 ATP synthase subunit 1, partial [Curcuma kudagensis]

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AQM55893.1 ATP synthase subunit 1, partial [Curcuma oligantha var. lutea]

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VAI70049.1 unnamed protein product [Triticum turgidum subsp. durum]

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I1TKW8 ATP synthase subunit alpha (Fragment)

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I1TKY9 ATP synthase subunit alpha (Fragment)

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I1TL03 ATP synthase subunit alpha (Fragment)

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I1TL04 ATP synthase subunit alpha (Fragment)

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Q5VL92 ATP synthase subunit alpha (Fragment)

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

P05494 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

1.4e-34

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P0C520 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

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P0C521 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

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P18260 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

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Q06735 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

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Arabidopsis top hits

e value

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AT2G07698.1 ATPase, F1 complex, alpha subunit protein

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ATCG00120.1 ATP synthase subunit alpha

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ATMG01190.1 ATP synthase subunit 1

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Sequences

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CDS sequence

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ATGGTAGAATTTGTCAGCGGTGTCAAAGGAATAGCCTTAAATCTTAAGAATGAGAACGTAAGGATTGCTGTCTTTGGTAGTGATACTGCTATTAAAGAAAGAGATTTTGG
CAAGCGCATTGGATCGATTATGGATATTCCAGCAAGAAAGGTTATGTTCGGGCGTATGGTCGATGCTTTACGTATCAAAGTGAAAGCCCTTGGGATTATTGAACGCAAAT
CAATGCACGAGCCTATGAAAACAGGGTTAAAAGCTATGGATAGCCTGGTTCCTATAGGTAGGGGCCCACGACAACTGATAATCAAGGAGCGATAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MVEFVSGVKGIALNLKNENVRIAVFGSDTAIKERDFGKRIGSIMDIPARKVMFGRMVDALRIKVKALGIIERKSMHEPMKTGLKAMDSLVPIGRGPRQLIIKER

IVF0021959 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome