; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022026 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022026
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr05:17601248..17601451
RNA-Seq ExpressionIVF0022026
SyntenyIVF0022026
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043564.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]9.38e-3794.03Show/hide
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]7.39e-41100Show/hide
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TYK19779.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.42e-3594.03Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]7.39e-41100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B4J8 uncharacterized protein LOC1034859528.3e-31100Show/hide
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A0A5A7TJS2 Retrotransposon protein1.7e-2894.03Show/hide
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A0A5A7U0J9 Putative nuclease HARBI18.3e-31100Show/hide
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI18.3e-31100Show/hide
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A0A5D3D8J6 Retrotransposon protein1.7e-2894.03Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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