CuGenDBv2

Gene ID	IVF0022043
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	ribosomal protein L16
Genome location	tig00007088:1171531..1171779
RNA-Seq Expression	IVF0022043
Synteny	IVF0022043
Gene Ontology terms	GO:0032543 - mitochondrial translation (biological process) GO:0005762 - mitochondrial large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000114 - Ribosomal protein L16 IPR016180 - Ribosomal protein L10e/L16 IPR020798 - Ribosomal protein L16, conserved site IPR036920 - Ribosomal protein L10e/L16 superfamily

Homology

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AEN56098.1 ribosomal protein L16 [Cucumis melo subsp. melo]

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QKS75278.1 ribosomal protein L16, partial [Lapageria rosea]

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YP_004849332.1 ribosomal protein L16 [Cucumis sativus]

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A0A5A7TFQ7 Ribosomal protein S3 (Mitochondrion)

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A0A5D3CBR7 Ribosomal protein S3 (Mitochondrion)

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A0A7G3V0Z7 Ribosomal protein L16

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G3EIY4 Ribosomal protein L16

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G3EU15 Ribosomal protein L16

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P27927 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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P46801 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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P49389 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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Q04715 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

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Arabidopsis top hits

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AT2G28830.1 PLANT U-BOX 12

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ATMG00080.1 ribosomal protein L16

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGAGCGGACAATTCCGAAGAAATGGTCAAATATGGGTCAGAGTTCTCGCAGATCTCCCTATTACCGGGAAACCTACAGAAGTCAGAATGGGAAGAGGAAAAGGAAATCC
TACGGGTTGGATTGCTCGTGTGTCCACGGGACAAATCCCATTTGAAATGGATGGTGTGAGTTTGTCAAATGCTCGACAAGCCGCTACATTAGCGGCGCATAAACCATGTT
CGTCAACCAAGTTTGTTCAGTGGTCGTAA

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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IVF0022043 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome