; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022114 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022114
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationchr02:20573281..20574569
RNA-Seq ExpressionIVF0022114
SyntenyIVF0022114
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044676 - MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587655.1 Transcription factor MYB2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.29e-14475.71Show/hide
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XP_022926469.1 transcription factor JAMYB-like [Cucurbita moschata]1.48e-14575.36Show/hide
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        DG RRHF  EQNSTSSES++ISQVSDPFSDVPSWNHG  E  AA+F+Y  GDS    T W+DDDDSF GCLWNFDGLWQF
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XP_038901337.1 transcription factor MYB62-like [Benincasa hispida]2.62e-16282.11Show/hide
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        MASPCKN +PS S S            SSGSS  IEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKP+V+RGNL
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        S+P  DGNRRHF  E+NSTSSES++ISQVSDP SDVPSWNHGGG+T AANF+Y  GDS LQ TDWIDDDDSF GCLWNFDGLWQF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPL1 SANT domain-containing protein1.4e-9772.56Show/hide
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         + +    ++SK       R    I + W       + ILNI TNSPEFKDIINR WIPRLLHQINDSSS     PPPPHTA THPTPQFSDSDSLP  D
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A0A1S3BWZ6 transcription factor MYB24-like4.3e-155100Show/hide
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A0A5D3DYB4 Transcription factor MYB24-like4.3e-155100Show/hide
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A0A6J1EF71 transcription factor JAMYB-like7.5e-11575.36Show/hide
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        DG RRHF  EQNSTSSES++ISQVSDPFSDVPSWNH G E  AA+F+Y  GDS    T W+DDDDSF GCLWNFDGLWQF
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A0A6J1I942 transcription factor MYB62-like3.3e-11074.19Show/hide
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        MASPCK    + S SSS SSS +ED+Q+ +RRGPW+VDEDSLL+HSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKP+V+RGNLSPQEQLLILDLH
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        SRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRT+VQKQAK+LNI TNS EFK+IIN  WIPRL+HQIN+S        SSPPPP+        Q SD+D+LP  D
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        G  RHF  EQNSTSSESV+ISQVSDPFSDVPSWNH   E  AA FEY  G+S    T W+DDDD+F GCLWNFDGLWQF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10MB4 Transcription factor MYB24.9e-5563.23Show/hide
Query:  EVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRT
        ++RRGPW+V+ED LL++ I+ HGEGRWN LA  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+P++RRGN++PQEQLLIL+LHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRT
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Query:  KVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFS
        +VQK AK L    NS +FKD++  LW+PRL+ +I  +++           TP  S
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Q2QZJ8 Transcription factor JAMYB2.7e-5350Show/hide
Query:  EDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIK
        E   +E+RRGPW+VDED  LI+ IS HGEGRWN LA  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+P+V+RGN + +EQLLILDLHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIK
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Query:  NYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNS-TSSESVEISQVSDPFSDVPS
        NYWRT+VQK AK LN   NS  FKD +  LW+PRL  +I+               +  +S++D L  V G       N    S S+  S  SD F+    
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Query:  WNHGGGETAAANFEYTTGDSLLQHTDWIDDDD
              +    N      D  +   DW+ + D
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Q9C9G7 Transcription factor MYB625.3e-5760.92Show/hide
Query:  SSSGSSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQL
        S     SF E +  E+RRGPW+++ED+LL + I  +GEGRWN +A  +GL+RTGKSCRLRWLNYLKP++RRGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKIAQ L
Subjt:  SSSGSSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQL

Query:  PGRTDNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSL
        PGRTDNEIKNYWRT+VQKQA+ LNI +NS +F D +   W+PRL+ ++  +SS     T TT+  PQ ++++SL
Subjt:  PGRTDNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSL

Q9FGY3 Transcription factor MYB785.6e-5154.08Show/hide
Query:  DDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKN
        +++ +VRRGPW+V+ED  LI+ I+ HGEGRWN LA  + L+RTGKSCRLRWLNYL+P+VRRGN++ +EQLLIL+LH+RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
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Query:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSS--SPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQN---STSSESVEISQVSD
        YWRT+VQK AK L    NS +FKD +  LW+PRL+ +I  +S  S       TT       ++++   VD        N   +  + SV +S VSD
Subjt:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSS--SPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQN---STSSESVEISQVSD

Q9LDE1 Transcription factor MYB1085.1e-5254.4Show/hide
Query:  DDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKN
        +D+ +++RGPW+ +ED  L++ I+ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+P+VRRGN++ +EQLLIL+LHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
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Query:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQIN--DSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTS
        YWRT+VQK AK L    NS +FKD +  LW+PRL+ +I    +SS     T TT  T     S  + T +    +++ N+ +
Subjt:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQIN--DSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G25340.1 myb domain protein 1168.6e-5544.61Show/hide
Query:  DDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKN
        ++ +E R+GPW+++ED+LL + IS +GEGRWNLLA  SGL+R GKSCRLRWLNYLKP+++RGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKI++ LPGRTDN+IKN
Subjt:  DDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKN

Query:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSS-SPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTSSESVEISQVSDPFSDVPSW
        YWRT+VQKQA+ LNI +NS +F +++   W PRL+++I D+S +      A     P   DS  L    G        S S +  + SQ  D FSD+ + 
Subjt:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSS-SPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTSSESVEISQVSDPFSDVPSW

Query:  ----NHGGGETAAANFEYTTGDSLLQH-------------------TDWIDDDDSFNGCLWNFDGLWQF
               GG +   +  Y++   L +                     D   +DD     +WN D +WQF
Subjt:  ----NHGGGETAAANFEYTTGDSLLQH-------------------TDWIDDDDSFNGCLWNFDGLWQF

AT1G48000.1 myb domain protein 1121.9e-5451.76Show/hide
Query:  EVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRT
        E+RRGPW+V+ED  L+  IS+HGEGRWN L+  +GL RTGKSCRLRWLNYL+P++RRG++S QEQ +IL+LHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRT
Subjt:  EVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRT

Query:  KVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTSSESVEISQVSDPFSDVPSWNHGG
        +VQK AK+L    NS +FKD I  LW+PRL+ +I  + S       + H +P+ S   +  +   +      +    + VE   + D  ++   W +GG
Subjt:  KVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTSSESVEISQVSDPFSDVPSWNHGG

AT1G68320.1 myb domain protein 623.7e-5860.92Show/hide
Query:  SSSGSSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQL
        S     SF E +  E+RRGPW+++ED+LL + I  +GEGRWN +A  +GL+RTGKSCRLRWLNYLKP++RRGNL+PQEQLLIL+LHS+WGNRWSKIAQ L
Subjt:  SSSGSSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQL

Query:  PGRTDNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSL
        PGRTDNEIKNYWRT+VQKQA+ LNI +NS +F D +   W+PRL+ ++  +SS     T TT+  PQ ++++SL
Subjt:  PGRTDNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSL

AT2G47190.1 myb domain protein 26.2e-5342.97Show/hide
Query:  SSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRT
        S+S   ++ S+VR+GPW+ +ED++L++ +S+HG+ RWN +A  SGL+RTGKSCRLRWLNYL+P+VRRGN++ +EQ +IL LHS WGNRWSKIAQ LPGRT
Subjt:  SSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRT

Query:  DNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQN-------STSSESVEIS
        DNEIKNYWRT+VQKQAK L    NS  FK+ +  +W+PRL+ +IN  S P       +  T      +    V+     F QN       +T   +   +
Subjt:  DNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQN-------STSSESVEIS

Query:  QVSDPFSDVPSWNHGGGETAAANFEYTTGDSLLQHTDWIDDDDSFNGCLWNFDGLW
          ++ FSDV      GG    + ++ +      +  DW        GC+   D +W
Subjt:  QVSDPFSDVPSWNHGGGETAAANFEYTTGDSLLQHTDWIDDDDSFNGCLWNFDGLW

AT3G06490.1 myb domain protein 1083.6e-5354.4Show/hide
Query:  DDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKN
        +D+ +++RGPW+ +ED  L++ I+ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+P+VRRGN++ +EQLLIL+LHSRWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
Subjt:  DDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKN

Query:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQIN--DSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTS
        YWRT+VQK AK L    NS +FKD +  LW+PRL+ +I    +SS     T TT  T     S  + T +    +++ N+ +
Subjt:  YWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQIN--DSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCCTTGTAAGAACCCAAGTCCAAGTCCGAGTCCGAGCAGTAGCGGGTCGTCTAGTTTTATTGAAGATGATCAAAGCGAGGTTAGAAGGGGGCCATGGAGTGT
CGATGAGGACTCTCTTCTTATTCATTCTATTTCTGTCCATGGAGAAGGCCGTTGGAATTTGCTTGCTATTCGTTCAGGGCTTAGAAGAACAGGGAAGAGCTGTAGACTGA
GATGGCTTAATTATCTAAAACCTGAAGTGAGGAGAGGAAATCTTTCTCCTCAAGAACAACTTTTGATTCTTGACCTTCATTCCAGATGGGGCAATAGGTGGTCAAAAATT
GCACAACAATTACCCGGAAGAACCGACAATGAAATAAAAAACTACTGGAGGACCAAAGTCCAAAAACAAGCAAAGATTCTCAACATCGGCACCAATAGCCCAGAATTCAA
AGACATTATCAACCGCTTATGGATCCCTAGATTACTCCATCAAATAAACGATTCTTCTTCTCCTCCGCCGCCACACACGGCGACGACACATCCGACCCCTCAATTTTCCG
ATTCCGATTCACTTCCGACAGTCGATGGGAACCGTCGCCATTTTGAGCAAAACAGCACCAGTTCGGAATCTGTGGAAATCTCGCAGGTCTCTGATCCATTCTCTGACGTC
CCATCTTGGAACCACGGCGGCGGAGAGACGGCGGCGGCGAATTTTGAATACACTACAGGCGATTCTTTGTTGCAACATACGGATTGGATTGACGACGACGATTCCTTTAA
CGGCTGCTTGTGGAACTTCGACGGCTTGTGGCAATTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAAAAAAAAATCTTTGTGTTCTTCAATGGCTTCTCCTTGTAAGAACCCAAGTCCAAGTCCGAGTCCGAGCAGTAGCGGGTCGTCTAGTTTTATTGAAGATGATC
AAAGCGAGGTTAGAAGGGGGCCATGGAGTGTCGATGAGGACTCTCTTCTTATTCATTCTATTTCTGTCCATGGAGAAGGCCGTTGGAATTTGCTTGCTATTCGTTCAGGG
CTTAGAAGAACAGGGAAGAGCTGTAGACTGAGATGGCTTAATTATCTAAAACCTGAAGTGAGGAGAGGAAATCTTTCTCCTCAAGAACAACTTTTGATTCTTGACCTTCA
TTCCAGATGGGGCAATAGGTGGTCAAAAATTGCACAACAATTACCCGGAAGAACCGACAATGAAATAAAAAACTACTGGAGGACCAAAGTCCAAAAACAAGCAAAGATTC
TCAACATCGGCACCAATAGCCCAGAATTCAAAGACATTATCAACCGCTTATGGATCCCTAGATTACTCCATCAAATAAACGATTCTTCTTCTCCTCCGCCGCCACACACG
GCGACGACACATCCGACCCCTCAATTTTCCGATTCCGATTCACTTCCGACAGTCGATGGGAACCGTCGCCATTTTGAGCAAAACAGCACCAGTTCGGAATCTGTGGAAAT
CTCGCAGGTCTCTGATCCATTCTCTGACGTCCCATCTTGGAACCACGGCGGCGGAGAGACGGCGGCGGCGAATTTTGAATACACTACAGGCGATTCTTTGTTGCAACATA
CGGATTGGATTGACGACGACGATTCCTTTAACGGCTGCTTGTGGAACTTCGACGGCTTGTGGCAATTCTAATTTTTAGTTAAATAGCTCTAATTGGATCCTTTTTTTCCT
TTTGTTTTTTGGAAAATAAACTTAGCGCTTTGTTTTATATTATTATTTTGTTATTTTTTTAAATTTGTTTCTGTAAAAAATAACAAATATATTTTAATTTTCTCAAATGT
GT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASPCKNPSPSPSPSSSGSSSFIEDDQSEVRRGPWSVDEDSLLIHSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPEVRRGNLSPQEQLLILDLHSRWGNRWSKI
AQQLPGRTDNEIKNYWRTKVQKQAKILNIGTNSPEFKDIINRLWIPRLLHQINDSSSPPPPHTATTHPTPQFSDSDSLPTVDGNRRHFEQNSTSSESVEISQVSDPFSDV
PSWNHGGGETAAANFEYTTGDSLLQHTDWIDDDDSFNGCLWNFDGLWQF