; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022262 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022262
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr04:20526931..20527944
RNA-Seq ExpressionIVF0022262
SyntenyIVF0022262
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048382.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.09e-9368.08Show/hide
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KAA0068169.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.52e-201100Show/hide
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TYK10971.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.81e-9763.3Show/hide
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        IIAEKKVF NWSHP AKGLLNK F YYDE AYVFERDRTTGRFA+ FVDV  NEP          G  SS      GL  P  M     + TR       
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                        LLRE+ DLS+LDRALCQR+LMS MDDM  F+EMTD+ERKNF RV LRDI R
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TYK21089.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.46e-19999.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TRV1 Retrotransposon protein1.3e-7454.55Show/hide
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        G T      R+  +  D     I +  DQ +   RE  +   R          EF  +LRE+P+L++LDRAL QR L+SRMDD++ F+ M +DER+ FCR
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        V LRDI R
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A0A5A7VSX7 Retrotransposon protein2.7e-157100Show/hide
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A0A5D3CGP2 Retrotransposon protein1.9e-7862.92Show/hide
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                   R    LLRE+ DLS+LDRALCQR+LMS MDDM  F+EMTD+ERKNF RV LRDI R
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A0A5D3CWL2 Retrotransposon protein5.8e-7553.27Show/hide
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               R+  +  D     I V  DQ +   RE  +   R          EF  +LRE+P+L++LDRAL QR L+SRMDD++ F+ M +DER+ FCRV 
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        LRDI R
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A0A5D3DCS9 Retrotransposon protein8.7e-15699.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATSSRAPKHVWTKENEDTLVECLVELVSTRGWKSDNVTFQSSYLVQLVCMMVEKLHGCHVRATIVIDCIIKTLKWTFQAIAKMRGPAYSGFGWNDDAKCIIAEKKVFNN
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