; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022267 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022267
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionhippocampus abundant transcript 1 protein-like
Genome locationchr03:22679416..22683464
RNA-Seq ExpressionIVF0022267
SyntenyIVF0022267
Gene Ontology termsGO:0034220 - ion transmembrane transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015276 - ligand-gated ion channel activity (molecular function)
GO:0038023 - signaling receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011701 - Major facilitator superfamily
IPR036259 - MFS transporter superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064854.1 tetracycline resistance protein, class A-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.19e-16096.51Show/hide
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KAE8652028.1 hypothetical protein Csa_018757 [Cucumis sativus]3.36e-15794.51Show/hide
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XP_016899943.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488384 isoform X3 [Cucumis melo]2.23e-16799.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BD51 tetracycline resistance protein, class A-like isoform X18.8e-13198.83Show/hide
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A0A1S4DVD1 uncharacterized protein LOC103488384 isoform X21.2e-13099.22Show/hide
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A0A1S4DVE6 uncharacterized protein LOC103488384 isoform X31.5e-13099.61Show/hide
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A0A5A7V9L6 Hippocampus abundant transcript 1 protein-like4.1e-10477.78Show/hide
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A0A5A7VC62 Tetracycline resistance protein, class A-like isoform X15.9e-12796.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4IF94 Hippocampus abundant transcript-like protein 14.8e-0923.44Show/hide
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        F+ LK     ST     +  F S L + G ++S   YL+    F   +IA  + + G+ S ++Q +    L+  LG    + +G+ F    +  +     
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         W+ + A + + +     P + ++VS+   +++QG AQG I+GI    N + P ++
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P02982 Tetracycline resistance protein, class A2.7e-0725Show/hide
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        AD      RA  FG +SA      V G +      +   F   A   A AAL          +  NF    L+G  +   S K E+      +L  L SF
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                 AA++A F  +  VG   + ++ +  + +FH+D   I   +   G+  S++Q ++T  +   LGE R L +G+  +    +L + A   W++
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        +   +         P LQ+++S+QV    QG+ QG ++ ++S  ++V P +F+ +   S+
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P70187 Hippocampus abundant transcript 1 protein2.2e-0921.92Show/hide
Query:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASV----CGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTDSASN----CNFSAPLLSGENVESVSSKKEKYASA
        + AD   EH R+ A+G++SA  +++ V     G    R    S     A + A +   ++ V + +S        ++ AP +S E  +  +S K+    +
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Query:  LPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGVFFNCLHMLLHS
        +  L                 +  F S L + G ++S   YL+    F  + +A  + + G+ S I+Q ++  +L+  +G    + +G+ F  L +  + 
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             W+ + A   + +     P + ++VS+   A +QG  QG I+GI    N + P ++
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Q07282 Tetracycline resistance protein, class E2.7e-0721.88Show/hide
Query:  ADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARF---LSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTDSASNCNFSAPLLSGENVESVSSKKEKYASALPSLTDL
        AD  PE  R   FG++ A      + G +   F   LS+ + F  AA+   +A L + +F+     N N  +  L  E +   +S   +  S L  L  +
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Query:  FSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYL--KAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGVFFNCLHMLLHSLAWSE
        F  ++                   +G   + ++ L  + +F +D   +   + + G+  ++ Q L    +   LGE + ++VG+  +   + L ++    
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Query:  WVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFS
        W+ +   +         P LQ I+S +VG   QG+ QG ++ ++    V+ P VF+
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Q96MC6 Hippocampus abundant transcript 1 protein2.2e-0921.92Show/hide
Query:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASV----CGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTDSASN----CNFSAPLLSGENVESVSSKKEKYASA
        + AD   EH R+ A+G++SA  +++ V     G    R    S     A + A +   ++ V + +S        ++ AP +S E  +  +S K+    +
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Query:  LPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGVFFNCLHMLLHS
        +  L                 +  F S L + G ++S   YL+    F  + +A  + + G+ S I+Q ++  +L+  +G    + +G+ F  L +  + 
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             W+ + A   + +     P + ++VS+   A +QG  QG I+GI    N + P ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G16980.1 Major facilitator superfamily protein1.8e-4338.41Show/hide
Query:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTD-----------SASNCNFSAPLLSGENVESVS------
        + A NV   +R S FGIL+ + S + VC +L ARFLSI+STFQ AA +  +  +YMRVFL +            +  C     + +G +++ ++      
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Query:  --SKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGV
          +K   + S   S  D+ S +  S+   QA VV FF+  ++ G  +++MY+LKA+F F+K+  A+L ++  +  SISQL + P L   +GE ++LS G+
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Query:  FFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLTG
             +    S+AWS WV Y   M     +F  P +  I S+QVG+SEQGK QGCISG+ +FA VV+PFV+SPLTG
Subjt:  FFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLTG

AT2G16980.2 Major facilitator superfamily protein9.0e-4338.18Show/hide
Query:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTD-----------SASNCNFSAPLLSGENVESVS------
        + A NV   +R S FGIL+ + S + VC +L ARFLSI+STFQ AA +  +  +YMRVFL +            +  C     + +G +++ ++      
Subjt:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTD-----------SASNCNFSAPLLSGENVESVS------

Query:  --SKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGV
          +K   + S   S  D+ S +  S+   QA VV FF+  ++ G  +++MY+LKA+F F+K+  A+L ++  +  SISQL + P L   +GE ++LS G+
Subjt:  --SKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGV

Query:  FFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT
             +    S+AWS WV Y   M     +F  P +  I S+QVG+SEQGK QGCISG+ +FA VV+PFV+SPLT
Subjt:  FFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT

AT2G16990.1 Major facilitator superfamily protein9.6e-4539.71Show/hide
Query:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLT---------------------DSASNCNFSAPLLSGENV
        + A N+    R SAFGIL+ I + A + G L ARFL I+ TFQ +A +  +  +YMRVFL                      DS +    + P+L+   +
Subjt:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLT---------------------DSASNCNFSAPLLSGENV

Query:  ESVSSKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSV
             K + +     SL D+ S +KTS+ F QA VV FFS+ +D G  ++ +Y+LKA+F FDK + ADL+++  +  SISQL + P     +GE +LLS 
Subjt:  ESVSSKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSV

Query:  GVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT
        G+F   ++M + S++W+ WV Y   +F    +F  P +  I S+QVG  EQGK QGCISG+ SF  VV+PFVFSPLT
Subjt:  GVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT

AT2G16990.2 Major facilitator superfamily protein9.6e-4539.71Show/hide
Query:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLT---------------------DSASNCNFSAPLLSGENV
        + A N+    R SAFGIL+ I + A + G L ARFL I+ TFQ +A +  +  +YMRVFL                      DS +    + P+L+   +
Subjt:  FQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLT---------------------DSASNCNFSAPLLSGENV

Query:  ESVSSKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSV
             K + +     SL D+ S +KTS+ F QA VV FFS+ +D G  ++ +Y+LKA+F FDK + ADL+++  +  SISQL + P     +GE +LLS 
Subjt:  ESVSSKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSV

Query:  GVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT
        G+F   ++M + S++W+ WV Y   +F    +F  P +  I S+QVG  EQGK QGCISG+ SF  VV+PFVFSPLT
Subjt:  GVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT

AT5G42210.1 Major facilitator superfamily protein2.0e-5048.73Show/hide
Query:  VCGNLCARFLSISSTFQ-AAASTAAMAALYMRVFLTDSASNCNFSAPL-----LSGENVESVSSKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSN
        +C  L   F SI   ++  +A+   ++ LYMR+FL DS  + +  AP+     LS   +E     + +   A+  + ++ S +++S    Q A+V+FFS+
Subjt:  VCGNLCARFLSISSTFQ-AAASTAAMAALYMRVFLTDSASNCNFSAPL-----LSGENVESVSSKKEKYASALPSLTDLFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSN

Query:  LADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSI
        LA+ G HAS MYYLKAKFHF+KD+ ADLM+I G + SISQLL  P+LVP L E RLLS+G+FF C HM L  +AWS WV Y AA+F++  IF   C++SI
Subjt:  LADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSVLYIFWQPCLQSI

Query:  VSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT
        VSKQV + EQGKAQG IS I S ANV+SP  FSPLT
Subjt:  VSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAACGAATTTGTATTCTCACCTAAACCCCTTGTTCCAGGCCGACAATGTACCGGAGCACCGGCGAGCTTCTGCGTTTGGAATTTTATCTGCCATTATCTCTTCTGC
TTCCGTCTGCGGGAATCTCTGTGCTCGTTTTCTCTCCATTTCATCCACGTTTCAGGCAGCGGCTTCCACGGCGGCTATGGCGGCTTTGTATATGAGGGTTTTCCTTACTG
ATTCTGCCTCTAATTGCAATTTTTCTGCTCCCTTACTATCTGGGGAGAACGTAGAATCTGTTTCATCTAAAAAGGAAAAATATGCTTCGGCCTTGCCTTCACTGACGGAT
CTTTTTTCCTTTTTGAAGACTAGCTCGACATTTTCACAAGCAGCCGTCGTTGCATTTTTTAGCAATCTTGCTGATGTTGGCCATCATGCTTCAATAATGTACTATTTAAA
AGCGAAATTTCACTTTGACAAGGATAGAATTGCTGATTTGATGGTGATTTCTGGGGTTGCTTCAAGTATTTCTCAGCTACTCTTAACGCCCATCTTGGTTCCTGTTCTAG
GAGAGAATAGGCTACTCTCAGTTGGGGTCTTTTTCAATTGCCTGCATATGCTTCTTCACAGCTTAGCTTGGTCTGAATGGGTTTCCTATGGTGCTGCAATGTTTTCCGTT
TTGTATATTTTCTGGCAGCCTTGTCTGCAAAGCATAGTGTCGAAACAAGTTGGTGCAAGCGAGCAGGGTAAGGCTCAAGGATGCATTTCAGGCATATCTTCGTTTGCCAA
TGTTGTTTCTCCATTTGTATTCTCCCCTTTGACAGGTAACTCGCTTAAATTTGCTATTTATAGTGTAATGCAACAGCTAGAGATGTTACGACTAACAAAATTTAGGTGTT
TTCAGCTTTGTTTCTATCTGAAAACGCTCCATTTTATTTCCCTGGATTTAGCATCATGTGCGCTGCATCTGCTGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAATCCGAAGTAAAAACGTCGGATTTTTTGATCTTTATGAAAACGAATTTGTATTCTCACCTAAACCCCTTGTTCCAGGCCGACAATGTACCGGAGCACCGGCGAGCTTC
TGCGTTTGGAATTTTATCTGCCATTATCTCTTCTGCTTCCGTCTGCGGGAATCTCTGTGCTCGTTTTCTCTCCATTTCATCCACGTTTCAGGCAGCGGCTTCCACGGCGG
CTATGGCGGCTTTGTATATGAGGGTTTTCCTTACTGATTCTGCCTCTAATTGCAATTTTTCTGCTCCCTTACTATCTGGGGAGAACGTAGAATCTGTTTCATCTAAAAAG
GAAAAATATGCTTCGGCCTTGCCTTCACTGACGGATCTTTTTTCCTTTTTGAAGACTAGCTCGACATTTTCACAAGCAGCCGTCGTTGCATTTTTTAGCAATCTTGCTGA
TGTTGGCCATCATGCTTCAATAATGTACTATTTAAAAGCGAAATTTCACTTTGACAAGGATAGAATTGCTGATTTGATGGTGATTTCTGGGGTTGCTTCAAGTATTTCTC
AGCTACTCTTAACGCCCATCTTGGTTCCTGTTCTAGGAGAGAATAGGCTACTCTCAGTTGGGGTCTTTTTCAATTGCCTGCATATGCTTCTTCACAGCTTAGCTTGGTCT
GAATGGGTTTCCTATGGTGCTGCAATGTTTTCCGTTTTGTATATTTTCTGGCAGCCTTGTCTGCAAAGCATAGTGTCGAAACAAGTTGGTGCAAGCGAGCAGGGTAAGGC
TCAAGGATGCATTTCAGGCATATCTTCGTTTGCCAATGTTGTTTCTCCATTTGTATTCTCCCCTTTGACAGGTAACTCGCTTAAATTTGCTATTTATAGTGTAATGCAAC
AGCTAGAGATGTTACGACTAACAAAATTTAGGTGTTTTCAGCTTTGTTTCTATCTGAAAACGCTCCATTTTATTTCCCTGGATTTAGCATCATGTGCGCTGCATCTGCTG
CGATGATAGCATTTGTTCAGAGTATGATGATAAAAACTCCTGCCAAAGCTTGTACCAGCATCCATGTGGAAGTTTTGGTTTAGTTCTCGTTCTTCTTCCCCTGTCCATAC
CTTTGTTGTTATATATTGTAAATATTTAGTTGTTTATTCGCAAAAGTAAGCAAATCGGAGGATAAGAAAATGTTTTCTAATAGCAATTTGTTAGCGGGTGTTTGTGAAAA
GAAAGTGTAGTTGTGAATTCCAATGAATTGTACAATCTCGAAAGTTGTGAGCTTTTAGGACTTATTATGTAAGGAGCGTCGATACAACATTTTTTAATTGTACGGTCTAC
AGACTGCTCGAGGGAAACAAAGAGTATTGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKTNLYSHLNPLFQADNVPEHRRASAFGILSAIISSASVCGNLCARFLSISSTFQAAASTAAMAALYMRVFLTDSASNCNFSAPLLSGENVESVSSKKEKYASALPSLTD
LFSFLKTSSTFSQAAVVAFFSNLADVGHHASIMYYLKAKFHFDKDRIADLMVISGVASSISQLLLTPILVPVLGENRLLSVGVFFNCLHMLLHSLAWSEWVSYGAAMFSV
LYIFWQPCLQSIVSKQVGASEQGKAQGCISGISSFANVVSPFVFSPLTGNSLKFAIYSVMQQLEMLRLTKFRCFQLCFYLKTLHFISLDLASCALHLLR