; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022270 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022270
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationchr05:25666972..25669003
RNA-Seq ExpressionIVF0022270
SyntenyIVF0022270
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.88e-23189.05Show/hide
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XP_022946029.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita moschata]3.79e-23189.34Show/hide
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A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like2.0e-205100Show/hide
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A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like2.0e-205100Show/hide
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A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.3e-18089.34Show/hide
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A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.0e-17787.9Show/hide
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Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 282.3e-2031.94Show/hide
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        GP KI+R+Y DW+DD+
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 317.3e-1134.19Show/hide
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Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 568.3e-4735.22Show/hide
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        +KFY  E CPYGD C FLH       D+  + RES AIS+    +P + G         + A + S S A       +PS WKT++C KWE+TG+CPFG 
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        +
Subjt:  D

Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 123.5e-4533.33Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  +   
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---

Query:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
             G++G     +      N K L          V   A +S  T V    A      KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 392.6e-8050.59Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI

Query:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T     SS L 
Subjt:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-

Query:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
         EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein2.5e-4633.33Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  +   
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---

Query:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
             G++G     +      N K L          V   A +S  T V    A      KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT1G66810.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein3.3e-0632Show/hide
Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ
        R++  R     +IS+ + G   +N    +S ++ S+ +S SVS +     ++  G          R    KT+LC KW+ TG C +GD C FAHG  EL+
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein2.1e-0526.17Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R    + +                       K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein1.6e-2131.94Show/hide
Query:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFW
        K KLC KF  G  CPY    C+F H           P  +++   ++ R RES A+S+G  G                     +V+  L++        W
Subjt:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFW

Query:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG------------------REGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWK
        KT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SEL  + G                  + G+V T    V P + +   SS++T         P G    +  KWK
Subjt:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG------------------REGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWK

Query:  GPKKINRIYADWLDDL
        GP KI+R+Y DW+DD+
Subjt:  GPKKINRIYADWLDDL

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein1.8e-8150.59Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI

Query:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T     SS L 
Subjt:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTSVLPSSAL-

Query:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
         EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAATGATATGAGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCCAGGAATGATCCATT
TGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTGAATTCTA
GGGGGCACCCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATATTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGAAATGGTGCTAGTTGT
AACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAA
GATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATT
CTGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGTACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGT
TCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTG
CCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTAAATGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCATCTT
CGAGTTTGACAACCAGTGTACTTCCATCCTCTGCCTTACCGGAGGGCCAGGCAAAGCCAAGTTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCCGAT
TGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTAACTCGCCTACAAAAATTCCCTTGTGGCGATTCAGAAGATTCCATGGTTTTGGCCTTCCTCAATCCTCCGATTTTCATTAGGGTTTTCGTTTCTCCTTGGCGGCTAG
GGTTTTGATTCTTCATTCACTTTGTTGTTTTTCTTTTCGACCTCTTCATTATAAATATATAACTACAACTCTTTCACTTTCGCCATTGTTTTGATTCCTTCTTCCATTGA
TCTTCATTCCGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTATTGATATTTCAAAAACCTTTTGTTTATTTATCCAAACTCAACTTTAATTTGCCTACTTTTCTTGTTTTCTTGTTTTCT
TGTTTTCTTTTTCTTCTTGCCAATTGTTGGTATAAGGGAGGATGATCACGTCGATTGATTGAAATTTCTATTGGGTGGATTCGTTGTTCGTTGTTGATTCATTGTTTTGA
TTGATTAAAGAGAACTGGGTTTTGTTTTAGAAGATGAGTTTCAATGATATGAGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGG
TTGCTGGTCTCAGTTTCCCAGGAATGATCCATTTGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTC
CTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTGAATTCTAGGGGGCACCCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATATTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAAATTT
AAGCTTGGTTTGTGTAGAAATGGTGCTAGTTGTAACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGA
TCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAAGATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTC
TTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATTCTGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGTACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTTCT
AGTTATATTGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGTTCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGA
GATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTGCCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTAAATG
TAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCATCTTCGAGTTTGACAACCAGTGTACTTCCATCCTCTGCCTTACCGGAGGGCCAGGCAAAGCCAAGTTTGCTGAAATGGAAA
GGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCCGATTGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGAGCTTTTTTTTTTTCAGTTGAAGT
TAAAGTTTTTGAAGTTGGTTTGCTGAGGATTCAATTGATTAGTTACAATATGGGAGTTGGGTTGGTGGTGGTTTTTCTGAATTAGATGAAAGGAGTGTAAAAATGTTTTG
GTGAGAATTGATTGGGAATATGGATAGAAGAAGAGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDMRGSVIPPPLHSYGSNGDASGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASC
NFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSC
SVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYAD
WLDDLPLSPSSTSKMEG