; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022279 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022279
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionsyntaxin-71-like
Genome locationchr04:20473909..20477565
RNA-Seq ExpressionIVF0022279
SyntenyIVF0022279
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0048278 - vesicle docking (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR006012 - Syntaxin/epimorphin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004144411.1 syntaxin-71 [Cucumis sativus]3.45e-17598.49Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_008442667.1 PREDICTED: syntaxin-71 [Cucumis melo]1.20e-17598.49Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_008461731.1 PREDICTED: syntaxin-71-like [Cucumis melo]2.53e-177100Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_023521570.1 syntaxin-71-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.48e-17296.6Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLE++PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T+TK NGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+ TVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_038904060.1 syntaxin-71 [Benincasa hispida]4.02e-17497.74Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYA+VEADIEAALQKAEDASKEKNRAS+VALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVT+TKNNGGWTSSASR EIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LE82 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein3.4e-13698.49Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A0A0LFR8 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein1.1e-13497.36Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADI+AALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQV LMDEIDTKVDKAASDLKNTN RL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3B689 syntaxin-711.5e-13698.49Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3CFA3 syntaxin-71-like8.1e-138100Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A5A7TS26 Syntaxin-719.3e-13497.71Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY +
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54IX6 Probable syntaxin-8B1.3e-0423.18Show/hide
Query:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEDVPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTVTT
        D   +L  ++ ADI+      E + +++N   +V  N  A++R     +  ++ +LQ  L     + +  ++L  R + V   +++ +++ +  D  +  
Subjt:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEDVPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTVTT

Query:  TKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
        T        + +   I + S+ +F     + TE + QF        Q++ MR  +QD+ LD++S+ +   KNMAH M+ E+D+   ++D+++   D  + 
Subjt:  TKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS

Query:  DLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL
         L+N N R+ +T+ Q   S    + I++L I++
Subjt:  DLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL

Q94KK5 Syntaxin-731.6e-9066.67Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S + I+FD   SD R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRL+DTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Q94KK6 Syntaxin-721.6e-8765.04Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL EDV KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K  N  W  +SA    IKFD S+   DD +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRL+  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

Q9SF29 Syntaxin-711.8e-11078.57Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL E+VPKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K+   WT  S+ SR +IKFDSDGRFDD+YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09740.1 syntaxin of plants 711.3e-11178.57Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL E+VPKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K+   WT  S+ SR +IKFDSDGRFDD+YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G45280.1 syntaxin of plants 721.2e-8865.04Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL EDV KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K  N  W  +SA    IKFD S+   DD +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRL+  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

AT3G61450.1 syntaxin of plants 731.1e-9166.67Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S + I+FD   SD R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRL+DTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G61450.2 syntaxin of plants 733.8e-9567.79Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S + I+FD   SD R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQDQGLD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRL+DTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGATGCAATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGATGTAGAAAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCCGGCGACGATGCCTTCGC
TCGTCTCTACGCCACTGTTGAAGCTGACATTGAAGCCGCTCTACAGAAAGCGGAGGATGCTTCTAAAGAGAAGAATAGGGCATCCGTGGTGGCGTTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACGAAGGCTCGATTACTGGAGGATGTCCCCAAGTTGCAGAGGTTGGCTGTAAAGAGGGTTAAAGGGCTATCAACTGAAGATCTTACCACTCGGAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCGGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGAACTGTGACTACCACAAAAAATAATGGTGGCTGGACATCCTCAGCTTCACGGACAGAAATCAAATTTGACTC
AGATGGGCGATTTGATGATGAGTACTTCCAACACACTGAGGAGTCCAGTCAGTTTAGACAGGAGTACGAAATGAGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTGGACATGATAT
CAGAAGGGTTGGATACTCTGAAGAATATGGCACATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTTCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAACGTTAGATTAAGGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGTATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGGATTGCTGC
TTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTAGGAAGATTTAGGTTTCTTTGTAATATTCCATCCTAAAAAGTTTTATGTTTCTTTGTAATATTCCATCATATAGGGAAAGGAAACTACAATTATGAAATTGAGCCCAG
TGTATGAGTCATTACACTAGCTTTTGTGCACGATTTCCGTAGAGATTCTCGGAACCACTTTCACCGCCGTAAGTCACCGGAAACCCACCGGAGCGCGGAGGCTAAGGATC
GAAGATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGATGCAATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGATGTAGAAAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCCGGCGACGATGCCT
TCGCTCGTCTCTACGCCACTGTTGAAGCTGACATTGAAGCCGCTCTACAGAAAGCGGAGGATGCTTCTAAAGAGAAGAATAGGGCATCCGTGGTGGCGTTGAATGCGGAG
ATTCGTCGTACGAAGGCTCGATTACTGGAGGATGTCCCCAAGTTGCAGAGGTTGGCTGTAAAGAGGGTTAAAGGGCTATCAACTGAAGATCTTACCACTCGGAATGATTT
GGTGCTTGCATTGCCGGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGAACTGTGACTACCACAAAAAATAATGGTGGCTGGACATCCTCAGCTTCACGGACAGAAATCAAATTTG
ACTCAGATGGGCGATTTGATGATGAGTACTTCCAACACACTGAGGAGTCCAGTCAGTTTAGACAGGAGTACGAAATGAGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTGGACATG
ATATCAGAAGGGTTGGATACTCTGAAGAATATGGCACATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTTCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGC
ATCTGACCTTAAGAACACCAACGTTAGATTAAGGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGTATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGGATTG
CTGCTTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGAGCTAAGGAAGGGGAAAAAACTTCATGTTCTTGTGGAATATTTGTGTCAAGGTTTCTAGGAAGAGTATCTGTATCCAGT
AAATAATGTGATCGTGTTTGTGTTGTTTATAATATTTGTACGTCATATTCTTTTACACCGGACTCGCTGTGTACTATCAATTCTTGGTTATGTTGCTTGATTCTTTAATA
TTGCACTTGTGTAACCTGTCTTTGCTTTTCGCTTCGAATTTGAATACTGATCTCCCATGCTTGACATTTTAGATCATATGTAGAAATCAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV
LALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
DLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK