CuGenDBv2

Gene ID	IVF0022301
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome location	chr03:752279..753241
RNA-Seq Expression	IVF0022301
Synteny	IVF0022301
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7015908.1 hypothetical protein SDJN02_21012, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

7.16e-103

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XP_008441227.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485423 [Cucumis melo]

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100

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XP_011649907.1 uncharacterized protein LOC105434677 [Cucumis sativus]

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92.89

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XP_023549797.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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80.9

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XP_038885392.1 uncharacterized protein LOC120075791 [Benincasa hispida]

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91.92

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TrEMBL top hits

e value

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A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC103485423

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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein

1.7e-100

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A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC111020211

1.8e-70

81.35

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        FGFQ+WRKSNR N QRDPFFDAF+ECSK+  +AA  AELWS   G++ GKAI+RSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIV LPRTP SSFDLL
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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC111456137

8.8e-73

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        MFQSSRRT SFSSSS +  SSSSSSSSSRGSYYFP +SP SA ATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+SLLPLPP STTL SSKRF
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        GF DWRKSNRQN QRDPFFDAF+ECSKEP+ A        AELW+  SNGKA++RSLSDRFGFLN  SSCKRTCGVSESIVY PR   SSFDLLN R+GG
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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC111487739

1.1e-72

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        MFQSSRRT SFSSSSS   SSSSSSSSSRGSYYFP +SP SA ATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+ LLPLPP ST L SSKRF
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G22680.1 unknown protein

8.5e-20

42.71

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        +RR++S   SS+ ++S+  S SSSS  S  F G SP    ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R        LS+LLPLPP+ +  S + R    
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          +K+      RDPF  A +ECSK    A  D E  +G  + K + +S S   G LNLYSSC+R C VSESIVYLP++  +S+D L+  + G
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AT1G71970.1 unknown protein

8.2e-23

43.2

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        SSRR    S SSS+S SS SS SSS  S  FPG+SP ++ ATP+R     +PFSWE LPG PK  S     R +    + LLPLPP+   S   +  K  
Subjt:  SSRRTHSFSSSSSNSLSSSSSSSSSRGSYYFPGESPFSASATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSLLPLPPN---STTLSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNRQNPQRDPFFDAFLECSK-EPTNAAVDAEL------------WSGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT-PTSSF
             +K++     +DPF  A LECSK E TN+  D ++             SG S+      S+ DRFG +NLY SC+RTC V+ESIVYLPR    +S+
Subjt:  GFQDWRKSNRQNPQRDPFFDAFLECSK-EPTNAAVDAEL------------WSGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT-PTSSF

Query:  DLLNQR
        D L  R
Subjt:  DLLNQR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCTTCTTCTTCTAATTCCCTCTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGCTCTTACTATTTCCCCGGTGA
ATCTCCTTTCTCCGCCTCCGCCACTCCAATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCAGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGCTCC
GACGAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCTTCTCTCCTCCCTTTACCTCCCAATTCCACCACCCTATCCTCTTCCAAACGCTTCGGATTTCAAGACTGGAGGAAATCGAACCGC
CAAAATCCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCAACGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGGCGCTAGCAATGGTAAGGC
GATTACAAGAAGTTTGAGCGATCGATTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGTACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTTCCTAGAACGCCGACGA
GTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCAGCGGCGGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTGGGTTTTTGTGTGAGCTAAAAGCCAAATCCCAATTCCCAAATTTCTCTAAAAAAGAGAATGTGAAGAATCAAAACAGAAAAGAAAAAAGAAACTGAATACATACAATG
TTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCTTCTTCTTCTAATTCCCTCTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGCTCTTACTATTTCCCCGGTGAATC
TCCTTTCTCCGCCTCCGCCACTCCAATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCAGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGCTCCGAC
GAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCTTCTCTCCTCCCTTTACCTCCCAATTCCACCACCCTATCCTCTTCCAAACGCTTCGGATTTCAAGACTGGAGGAAATCGAACCGCCAA
AATCCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCAACGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGGCGCTAGCAATGGTAAGGCGAT
TACAAGAAGTTTGAGCGATCGATTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGTACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTTCCTAGAACGCCGACGAGTT
CGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCAGCGGCGGTTGAAGAAGAAAAAAACAAGAGATAAGTTGGTGATTCGATTAAATGTTTGTTTAGTTTAATTAATCTCTTTGTTTGTGG
ATTATGAATATGGAATGGGTTAATCCTAATTTGGCTTTGTTAATCTGTGATTACTCCCCTGGATTTGTTACGTTTGTGAAATTTACCTCAAAATTTGAATCGAAAATTGC
AAAATCAATCTCCTAAGTCTTAATTTATGTTTTCTTTTTTAAAATTATATTATTATATGTGAATTGAATTATTTATTTGTGAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFQSSRRTHSFSSSSSNSLSSSSSSSSSRGSYYFPGESPFSASATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSLLPLPPNSTTLSSSKRFGFQDWRKSNR
QNPQRDPFFDAFLECSKEPTNAAVDAELWSGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTPTSSFDLLNQRSGG

IVF0022301 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome