; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022410 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022410
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like
Genome locationchr11:21823928..21825396
RNA-Seq ExpressionIVF0022410
SyntenyIVF0022410
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143175.1 protodermal factor 1 [Cucumis sativus]2.92e-14893.31Show/hide
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XP_008456355.1 PREDICTED: protodermal factor 1-like [Cucumis melo]1.28e-15799.15Show/hide
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XP_022947015.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita moschata]5.12e-12882.19Show/hide
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XP_022970795.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita maxima]1.45e-12881.2Show/hide
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XP_038900371.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]1.06e-13788.84Show/hide
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        MR+KQAS LLFTLLAGLLSQSLLIPV STSI DQKSYYSPP DPHSG+PP+GSH SPIPPSHG GG+P HYSTPTPSTPS     GGGYYNPPSSGG SP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF76 Uncharacterized protein1.4e-11593.31Show/hide
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A0A1S3C4A9 protodermal factor 1-like1.2e-12299.15Show/hide
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A0A5A7UHX0 Protodermal factor 1-like1.2e-12299.15Show/hide
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        TKQVRTSFVSALSSNKAAGDQANTFKLANEGK+ P
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A0A6J1G5M6 protodermal factor 1-like2.8e-10082.19Show/hide
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        MR+KQAS LLFTLLAGLLSQSLLIPVLST+I DQKSYYSPPDPH+G+PP+GSH +PIPPSHG GGT PHYSTPTPST    PSGG GYYNPP SGGS P+
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        SYLNSLASNRFP+TTKQV++SFVSAL+SN+AA DQAN FKLANEGK+
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A0A6J1I3W1 protodermal factor 1-like9.7e-10181.2Show/hide
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        MR+KQAS LLFTLLAGLLSQSLLIPVLST+I DQKSYYSPPDPH+G+PP+GSH +PIPPSHG GGT PHYSTPTPST    PSG  GYYNPPSSGGS P+
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Query:  TPVDPGTPSTPSTPSVPSTPSTPT------------IPTTPFTCNYWLNHPGLIWGVLGWWGTLGNAFGATNVPGFGTNLNLLQALSNTRNDGYGALLRE
        TPVDPGTPSTPSTPS PSTPSTP+             PTTPFTCN+WLNHPG+IWGVLGWWGTLGN FGATNVPGFGTNLNLLQALSNTR DG+GALLRE
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        GTASYLNSLASNRFP+TTKQV++SFVSAL+SN+AA DQAN FKLANEGK+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S728 Protodermal factor 11.6e-4444.85Show/hide
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        S  ++ L A LLSQ L   V S    D K+YY SPP      P S +PPS + GS            P PPSH    +    TPTP TPS     + PP 
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Query:  SGGSPPSTPVDPGTPSTPS----------------------------------TPSVPSTPSTPTI----PTTPF----------TCNYWLNHPGLIWGV
        + GSPPS P  P  PSTPS                                  TP +  +P TP I    P TPF          TC+YW NHP LIWG+
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Query:  LGWWGTLGNAFGA----TNVPGFGTNLNLLQALSNTRNDGYGALLREGTASYLNSLASNRFPYTTKQVRTSFVSALSSNKAAGDQANTFKLANEGKLNPE
        LGWWGT+G AFG     +++PGF  ++NLLQALSNTR+D  GAL REGTAS+LNS+ +++FP+TT QVR  FV+ LSSNKAA  QA+TFKLANEG+L P 
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Query:  L
        +
Subjt:  L

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20515.1 unknown protein3.4e-0536.62Show/hide
Query:  TNLNLLQALSNTRNDG--YGALLREGTASYLNSLASNRFPYTTKQVRTSFVSALSSNKAAGDQANTFKLAN
        ++L L+++ +    +G  YGALL++G A+ +NS A   F Y   +V+T  + A+ S  AA  QA  F +AN
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AT2G42840.1 protodermal factor 11.2e-4544.85Show/hide
Query:  SALLFTLLAGLLSQSLLIPVLSTSITDQKSYY-SPPD-----PHSGSPPSGSHGS------------PIPPSHGNGGTPHYSTPTPSTPSGGGGYYNPPS
        S  ++ L A LLSQ L   V S    D K+YY SPP      P S +PPS + GS            P PPSH    +    TPTP TPS     + PP 
Subjt:  SALLFTLLAGLLSQSLLIPVLSTSITDQKSYY-SPPD-----PHSGSPPSGSHGS------------PIPPSHGNGGTPHYSTPTPSTPSGGGGYYNPPS

Query:  SGGSPPSTPVDPGTPSTPS----------------------------------TPSVPSTPSTPTI----PTTPF----------TCNYWLNHPGLIWGV
        + GSPPS P  P  PSTPS                                  TP +  +P TP I    P TPF          TC+YW NHP LIWG+
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Query:  LGWWGTLGNAFGA----TNVPGFGTNLNLLQALSNTRNDGYGALLREGTASYLNSLASNRFPYTTKQVRTSFVSALSSNKAAGDQANTFKLANEGKLNPE
        LGWWGT+G AFG     +++PGF  ++NLLQALSNTR+D  GAL REGTAS+LNS+ +++FP+TT QVR  FV+ LSSNKAA  QA+TFKLANEG+L P 
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Query:  L
        +
Subjt:  L


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAAGCAAACAAGCTTCTGCTCTCCTTTTCACTTTGCTTGCTGGGCTGCTTTCTCAAAGCCTACTCATCCCTGTATTGTCCACCTCCATTACTGATCAGAAAAGCTA
CTACTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGATCTCCTCCATCAGGTTCACATGGCAGTCCTATCCCACCATCACATGGTAATGGAGGAACGCCACATTACTCCACACCAACAC
CTTCCACACCGTCTGGTGGCGGTGGATACTACAACCCTCCGTCTTCTGGTGGTAGCCCACCAAGCACCCCTGTAGATCCAGGCACTCCTAGCACTCCAAGCACTCCTAGT
GTTCCTAGCACACCAAGCACGCCTACCATTCCCACTACTCCATTTACCTGCAATTATTGGCTGAATCATCCAGGATTGATATGGGGAGTATTGGGATGGTGGGGAACATT
AGGAAATGCCTTCGGAGCAACCAATGTCCCAGGGTTTGGAACAAATCTCAACTTGCTCCAAGCACTTTCTAACACAAGGAATGATGGGTATGGGGCCCTTCTCAGAGAAG
GAACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCTAGTAACAGATTCCCCTACACAACCAAGCAAGTTAGGACAAGTTTCGTCTCAGCACTCAGCTCCAACAAAGCAGCAGGCGAT
CAGGCCAACACGTTCAAGTTAGCCAACGAGGGCAAATTAAACCCAGAGCTTGATTTCCCCACTTTTTCCTACCATTTACCATCTAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGTAACTTCACTTTCCCTCAACCCCCCTTCTATATATTCCCCCATTTGTCCTAAACATTCCATCCATCACCATTACCATTCCTTCCCTTCTTTCCCATCTCTAATCCCTT
TGCTCCCAATCAGAAAAACAGCCAACCAAAGAAACAACCATGAGAAGCAAACAAGCTTCTGCTCTCCTTTTCACTTTGCTTGCTGGGCTGCTTTCTCAAAGCCTACTCAT
CCCTGTATTGTCCACCTCCATTACTGATCAGAAAAGCTACTACTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGATCTCCTCCATCAGGTTCACATGGCAGTCCTATCCCACCATCAC
ATGGTAATGGAGGAACGCCACATTACTCCACACCAACACCTTCCACACCGTCTGGTGGCGGTGGATACTACAACCCTCCGTCTTCTGGTGGTAGCCCACCAAGCACCCCT
GTAGATCCAGGCACTCCTAGCACTCCAAGCACTCCTAGTGTTCCTAGCACACCAAGCACGCCTACCATTCCCACTACTCCATTTACCTGCAATTATTGGCTGAATCATCC
AGGATTGATATGGGGAGTATTGGGATGGTGGGGAACATTAGGAAATGCCTTCGGAGCAACCAATGTCCCAGGGTTTGGAACAAATCTCAACTTGCTCCAAGCACTTTCTA
ACACAAGGAATGATGGGTATGGGGCCCTTCTCAGAGAAGGAACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCTAGTAACAGATTCCCCTACACAACCAAGCAAGTTAGGACAAGT
TTCGTCTCAGCACTCAGCTCCAACAAAGCAGCAGGCGATCAGGCCAACACGTTCAAGTTAGCCAACGAGGGCAAATTAAACCCAGAGCTTGATTTCCCCACTTTTTCCTA
CCATTTACCATCTAAATAACTAATGAGTGTGCCTTAGCAGTTAGTAGTGAGACAGTGAGACCAATTTACCATTGCATGTGTTGTTTTGTTTTATTTTGTTCTTGTTTCTA
GTTTCTTGCAATCTCTTTTGTTCATGTATTTGAACATAGAGATGCTCAGTCTTTGTTATCCAAATTCATTGTGAAATCAAGATTGTTTCAAGAGTTAATTTGTTTAATCA
GATTATCCAAAAGGGGGTTGAAAATTAAAAGTTCAGATGCTTGTTATCTACACTAATCTATTGTTTCTATCACTATGCTTTAAAAGGGTAGTAAAATCCATGAAGTGTTT
GTATTTATGGCGCATTAATGAGGAAATGCACTACATTCAATAAGGTTAACCTACAAAAGAACAAACAACTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSKQASALLFTLLAGLLSQSLLIPVLSTSITDQKSYYSPPDPHSGSPPSGSHGSPIPPSHGNGGTPHYSTPTPSTPSGGGGYYNPPSSGGSPPSTPVDPGTPSTPSTPS
VPSTPSTPTIPTTPFTCNYWLNHPGLIWGVLGWWGTLGNAFGATNVPGFGTNLNLLQALSNTRNDGYGALLREGTASYLNSLASNRFPYTTKQVRTSFVSALSSNKAAGD
QANTFKLANEGKLNPELDFPTFSYHLPSK