; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022643 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022643
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRibonuclease Z
Genome locationchr05:2282076..2287512
RNA-Seq ExpressionIVF0022643
SyntenyIVF0022643
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001279 - Metallo-beta-lactamase
IPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like


Homology Show/hide homology
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KAA0061661.1 ribonuclease Z [Cucumis melo var. makuwa]2.25e-25098.3Show/hide
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A0A1S3BN27 ribonuclease Z, chloroplastic1.7e-196100Show/hide
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A0A5A7V7F0 Ribonuclease Z1.6e-19498.3Show/hide
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A0A5D3DC50 Ribonuclease Z5.2e-19399.14Show/hide
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A0A6J1ERP8 tRNase Z TRZ2, chloroplastic7.5e-18492.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9DNT1 Ribonuclease Z5.1e-1228.03Show/hide
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        HI +++   +   +K  LL H S+RY++ DI    ++LQ
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P60193 Nuclear ribonuclease Z (Fragment)6.5e-6063.31Show/hide
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Q58897 Ribonuclease Z1.0e-1229.34Show/hide
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Q8L633 tRNase Z TRZ2, chloroplastic3.2e-13970.34Show/hide
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        MQ+S    P+ PP++FP    H+P + T +       +  + V+  + SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y++EGISVGG ETCVI+PE
Subjt:  MQISIPISPLRPPQVFP---FHQPVLHTPKPQGVALHSHLNPVNSFRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPE

Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +F+P  IKEDVEKLLEIHRTMGQVEL+V+L+ L VGETYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE

Query:  TQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF
        T HVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTTS++MLDPRNADALRAKVLITEATFLDE+ S EHA+  GHTHI 
Subjt:  TQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF

Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGFKSMY
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E+IR+AV KLQ+ V+AKV+PLTEGF+S Y
Subjt:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGFKSMY

Q8LGU7 tRNase Z TRZ13.7e-9558.84Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV
        +K + +EGY +EG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ +PA IKE VE L E+HR +   
Subjt:  RKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV

Query:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK
        EL  +LV LD+GE + +R +L  +AF+T HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTTSDF++D  NADAL+AK
Subjt:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK

Query:  VLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGF
        VL+ E+TFLD++VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY +++I  AVS L   +  +V  LT+GF
Subjt:  VLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74700.1 tRNAse Z12.6e-9658.84Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV
        +K + +EGY +EG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ +PA IKE VE L E+HR +   
Subjt:  RKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQV

Query:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK
        EL  +LV LD+GE + +R +L  +AF+T HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTTSDF++D  NADAL+AK
Subjt:  ELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAK

Query:  VLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGF
        VL+ E+TFLD++VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY +++I  AVS L   +  +V  LT+GF
Subjt:  VLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGF

AT2G01730.1 cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit-II1.8e-0423.56Show/hide
Query:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLL-------EIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQG
        + ITH H+DH+G LP +       G   +S PT  L   + ED  +++       E+  T         ++A+D+ +T ++  +L  RA+   HV+ +  
Subjt:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLL-------EIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQG

Query:  YVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGD--TTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATF
         ++Y+                     K G           + +TGD   T+D  L     D L+  +LI+E+T+
Subjt:  YVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGD--TTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATF

AT2G04530.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein2.3e-14070.34Show/hide
Query:  MQISIPISPLRPPQVFP---FHQPVLHTPKPQGVALHSHLNPVNSFRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPE
        MQ+S    P+ PP++FP    H+P + T +       +  + V+  + SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y++EGISVGG ETCVI+PE
Subjt:  MQISIPISPLRPPQVFP---FHQPVLHTPKPQGVALHSHLNPVNSFRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPE

Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +F+P  IKEDVEKLLEIHRTMGQVEL+V+L+ L VGETYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFE

Query:  TQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF
        T HVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTTS++MLDPRNADALRAKVLITEATFLDE+ S EHA+  GHTHI 
Subjt:  TQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIF

Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGFKSMY
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E+IR+AV KLQ+ V+AKV+PLTEGF+S Y
Subjt:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQANVTAKVVPLTEGFKSMY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATTTCTATCCCCATTTCGCCTCTCAGACCTCCTCAAGTTTTCCCATTTCATCAACCTGTTTTACACACACCCAAACCTCAGGGAGTTGCTCTCCATAGTCATCT
GAATCCTGTAAATTCCTTCAGAGATTCCGGTCTTTTATCTACAATCGGCGTCGAAGAAGAGTACCGGAGAGCACGGTCACAGGTTAATCGAAAAGGGGTCGATTTAGAAG
GGTATTCCGTCGAGGGAATCTCAGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATCATTCCGGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCATCTCGAGCAATTCAGCAA
AACTTTGTATTTATCACTCACGCCCACCTTGATCACATTGGTGGGCTACCAATGTATGTAGCTAGTCGTGGTTTATATAGTTTAAGTCCTCCTACAGTATTTTTGCCTGC
TTGTATTAAAGAAGATGTGGAAAAACTACTTGAGATTCACAGGACCATGGGCCAGGTGGAGTTGGACGTTGATTTGGTTGCACTAGATGTGGGAGAAACATATGAAATGC
GTAATAATCTTGTCTGCAGAGCATTTGAAACTCAGCATGTGATACCAAGCCAGGGTTATGTCATTTATTCAGTTAGAAAGAAATTGAAGAAGCAATACATGCATCTAAAG
GGGAAACAGATCGAGAAGCTAAAGAAATCTGGAGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCTCCGGAGGTGGCCTTCACAGGTGATACAACATCAGATTTTATGCTTGATCC
CCGTAATGCTGATGCATTGAGGGCAAAAGTTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTGGATGAAGCTGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATGGTCATACTCACATATTTG
AGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTAACTCATTTTTCATCTCGATACCATATAGAGGACATCCGTAAAGCAGTATCAAAGCTGCAGGCG
AACGTGACGGCAAAAGTGGTTCCTCTCACTGAAGGATTCAAGTCAATGTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACATCTTCTACTCTTTGTGTTTTCCTTTCCTCTCGGAGACCAAGTAAACCTCCCCTAAACCCCATTTCTTCTTCCTCCAATTCCTTTCACATTCTTATGTTATTAATTCC
CTTCTAACCCATTCCAAGATGCAAATTTCTATCCCCATTTCGCCTCTCAGACCTCCTCAAGTTTTCCCATTTCATCAACCTGTTTTACACACACCCAAACCTCAGGGAGT
TGCTCTCCATAGTCATCTGAATCCTGTAAATTCCTTCAGAGATTCCGGTCTTTTATCTACAATCGGCGTCGAAGAAGAGTACCGGAGAGCACGGTCACAGGTTAATCGAA
AAGGGGTCGATTTAGAAGGGTATTCCGTCGAGGGAATCTCAGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATCATTCCGGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCA
TCTCGAGCAATTCAGCAAAACTTTGTATTTATCACTCACGCCCACCTTGATCACATTGGTGGGCTACCAATGTATGTAGCTAGTCGTGGTTTATATAGTTTAAGTCCTCC
TACAGTATTTTTGCCTGCTTGTATTAAAGAAGATGTGGAAAAACTACTTGAGATTCACAGGACCATGGGCCAGGTGGAGTTGGACGTTGATTTGGTTGCACTAGATGTGG
GAGAAACATATGAAATGCGTAATAATCTTGTCTGCAGAGCATTTGAAACTCAGCATGTGATACCAAGCCAGGGTTATGTCATTTATTCAGTTAGAAAGAAATTGAAGAAG
CAATACATGCATCTAAAGGGGAAACAGATCGAGAAGCTAAAGAAATCTGGAGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCTCCGGAGGTGGCCTTCACAGGTGATACAACATC
AGATTTTATGCTTGATCCCCGTAATGCTGATGCATTGAGGGCAAAAGTTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTGGATGAAGCTGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATG
GTCATACTCACATATTTGAGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTAACTCATTTTTCATCTCGATACCATATAGAGGACATCCGTAAAGCA
GTATCAAAGCTGCAGGCGAACGTGACGGCAAAAGTGGTTCCTCTCACTGAAGGATTCAAGTCAATGTATTAGTATAGGATATGGATCGATGGTTACAAAGTGTAATTATT
TAGCATCAAAACAGAGAAACAGGAACATAGGTAATTATTTCTCTGTAAATTTATTGTTGGTTTCTTTAGCATTAGGCCCTTAGCAACAACTTTACTTTTCCTTATTAATA
GCCAAAGTGACACATGTCTAAAGTTATAATGCATATAGAGATGGAAGCTGGAATCATAAAAGTCCAAAATTCGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQISIPISPLRPPQVFPFHQPVLHTPKPQGVALHSHLNPVNSFRDSGLLSTIGVEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSVEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQ
NFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFLPACIKEDVEKLLEIHRTMGQVELDVDLVALDVGETYEMRNNLVCRAFETQHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLK
GKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTSDFMLDPRNADALRAKVLITEATFLDEAVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHIEDIRKAVSKLQA
NVTAKVVPLTEGFKSMY