; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0022751 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0022751
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionMADS-box protein SOC1
Genome locationchr11:30656096..30656374
RNA-Seq ExpressionIVF0022751
SyntenyIVF0022751
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0040014.1 MADS-box protein SOC1-like [Cucumis melo var. makuwa]3.22e-33100Show/hide
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OWM64980.1 hypothetical protein CDL15_Pgr028698 [Punica granatum]5.25e-3293.75Show/hide
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TYK24488.1 MADS-box protein SOC1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.21e-3398.39Show/hide
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XP_008460142.1 PREDICTED: MADS-box protein SOC1-like [Cucumis melo]5.05e-3298.39Show/hide
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XP_022143898.1 MADS-box protein SOC1 [Momordica charantia]5.31e-3298.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CD40 MADS-box protein SOC1-like8.1e-2498.39Show/hide
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A0A218VY28 Uncharacterized protein8.1e-2493.75Show/hide
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A0A2I0JKX1 Uncharacterized protein8.1e-2493.75Show/hide
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A0A6J1CRU8 MADS-box protein SOC18.1e-2498.39Show/hide
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A0A6P8CZN4 MADS-box protein SOC1-like8.1e-2493.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2Z9Q7 MADS-box transcription factor 565.6e-2283.33Show/hide
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O64645 MADS-box protein SOC19.2e-2587.5Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL191.0e-2387.1Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL142.7e-2491.8Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 506.0e-2490.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 206.5e-2687.5Show/hide
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 141.9e-2591.8Show/hide
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 197.2e-2587.1Show/hide
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AT5G62165.1 AGAMOUS-like 421.3e-2177.42Show/hide
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AT5G62165.2 AGAMOUS-like 421.3e-2177.42Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGAGAGGAAAGACACAGATGAGGTTAATAGAGAACGCTACAAGCCGTCAAGTCACCTTCTCCAAGAGGAGAAATGGTTTGATGAAAAAAGCTTTTGAGTTATCGGT
TCTCTGTGATGCTGAAGTTGCTCTTATCATCTTCTCCCCTAGAGGAAAGCTTTATGAATTTGCTAGCTCAAGCGTGATGGATTGTGATCTGAATTTGAATCTGATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGAGAGGAAAGACACAGATGAGGTTAATAGAGAACGCTACAAGCCGTCAAGTCACCTTCTCCAAGAGGAGAAATGGTTTGATGAAAAAAGCTTTTGAGTTATCGGT
TCTCTGTGATGCTGAAGTTGCTCTTATCATCTTCTCCCCTAGAGGAAAGCTTTATGAATTTGCTAGCTCAAGCGTGATGGATTGTGATCTGAATTTGAATCTGATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVRGKTQMRLIENATSRQVTFSKRRNGLMKKAFELSVLCDAEVALIIFSPRGKLYEFASSSVMDCDLNLNLI