| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036972.1 DNA-directed RNA polymerase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.12e-72 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| KAG7019234.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.71e-67 | 90.84 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRY
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRY
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRY
|
|
| XP_004148776.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Cucumis sativus] | 4.16e-66 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| XP_008465290.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 [Cucumis melo] | 4.16e-66 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| XP_031736287.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X2 [Cucumis sativus] | 3.58e-66 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR--------IWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LXJ4 DNA-directed RNA polymerase | 7.4e-57 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF R KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| A0A1S3CNX9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 7.4e-57 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF R KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| A0A5A7T0K7 DNA-directed RNA polymerase | 7.4e-57 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF R KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| A0A6J1HLT9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 7.4e-57 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF R KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| A0A6J1I0L0 DNA-directed RNA polymerase subunit | 7.4e-57 | 90.77 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF R KMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A4IF62 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 5.0e-34 | 59.84 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
M T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT+ R +KM +SVLMLASFEKTADHLF+A+ G
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKV
+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKV
|
|
| F4JXF9 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 | 2.2e-37 | 62.31 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+ R KMDKSVLM ASFE+T DHLF+A+ +G
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| O14802 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 5.0e-34 | 59.84 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
M T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT+ R +KM +SVLMLASFEKTADHLF+A+ G
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKV
+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKV
|
|
| Q5ZL98 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 3.8e-34 | 59.84 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
M T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT+ R +KM +SVLMLASFEKTADHLF+A+ G
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKV
+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKV
|
|
| Q86AQ5 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 8.5e-34 | 56.92 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
M T G+ G +T SNHI+E + LGIE AR I+ EI M SHGMSIDIRH+MLL DLM+F R +KM +SVLMLASFEKT DHLF+A+V+
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
R D I GVSEC+IMG+ +PLGTG+ K+ ++
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G57660.1 nuclear RNA polymerase A1 | 1.1e-12 | 33.05 | Show/hide |
Query: SNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRIWHSKMDK--------SVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECV
SN I ++ + G+EAAR+ II EI + +S+G+S+ IRH+ L+ D MTF + M + S +FE + A+ G D +E S +
Subjt: SNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRIWHSKMDK--------SVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECV
Query: IMGIPMPLGTGMLKVRQR
+G+P GTG + QR
Subjt: IMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 2.2e-16 | 37.5 | Show/hide |
Query: EGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR------IWH--SKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDD
E VD T SNH+IE+ +VLGIEA R+ +++E++ + G ++ RH+ +L D MT+R H ++ D LM SFE+T D L +A+ D
Subjt: EGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFR------IWH--SKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDD
Query: KIEGVSECVIMGIPMPLGTG
+ GV+E +++G P+GTG
Subjt: KIEGVSECVIMGIPMPLGTG
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 1.5e-38 | 62.31 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+ R KMDKSVLM ASFE+T DHLF+A+ +G
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 1.5e-38 | 62.31 | Show/hide |
Query: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
MGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+ R KMDKSVLM ASFE+T DHLF+A+ +G
Subjt: MGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTF--------RIWHSKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNG
Query: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR
Subjt: RDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR
|
|
