| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0052366.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45 [Cucumis melo var. makuwa] | 3.24e-227 | 91.85 | Show/hide |
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| XP_023536426.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.08e-214 | 91.54 | Show/hide |
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| XP_038899577.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45-like [Benincasa hispida] | 6.94e-231 | 97.18 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KZM9 RRM domain-containing protein | 1.9e-186 | 98.21 | Show/hide |
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| A0A5D3CC44 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 2.2e-179 | 91.85 | Show/hide |
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RGRSSSYSASPSPRKVP
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| A0A6J1C2C4 serine/arginine-rich splicing factor SR45 isoform X1 | 1.1e-167 | 92.23 | Show/hide |
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TPPRTVA KRDGPKPENVG +AEKDDMKRQRE SPRRK PSPRRRSPVARRGGS PRRQPDSPRRRPESPPRRRVESPFRRDS PPRRRPASP+R GR
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|
|
| A0A6J1C2D4 serine/arginine-rich splicing factor SR45 isoform X2 | 1.6e-169 | 93.4 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSPPSG SGSSSRSRSFSGSDSRSS SRSRSRS SVSRSRSRSRS SSSSSLSRSGSSRSR+PPPQRKSPTETARR+RASPPPAKRSSPP
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PRKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIF NFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTR DAEKAQVYMDGAQIDGNVIR RFTLPQRQKMPTPPRT
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Query: VATVSKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQRESSPRRKLPSPRRRSPVARRGGS-PRRQPDSPRRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
VA KRDGPKPENVG +AEKDDMKRQRE SPRRK PSPRRRSPVARRGGS PRRQPDSPRRRPESPPRRRVESPFRRDS PPRRRPASP+R GRSPSPL
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RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRTPPRR RSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRP AA RRGRSSSYSASPSPRKV
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 5.5e-18 | 41.86 | Show/hide |
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+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + +R
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P P M R+ RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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|
|
| Q28E41 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 3.8e-19 | 43.02 | Show/hide |
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+R RRS SGS SSSRSRS S S S S S S S S S S S S SRS SSSSS S S SS S +P P R+ + RRSR+ KR ++ SP
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+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R + +R
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Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRQRESSPRRKLPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P + P M R+ RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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| Q3KPW1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-B | 3.2e-18 | 42.25 | Show/hide |
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++ RRS SGS SSSRSR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S +P P R+ + RRSR+ KR ++ SP
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+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R + +R
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P + P M R+ RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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|
|
| Q5XG24 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-A | 5.5e-18 | 41.86 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
++ RRS SGS SSS SR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S +P P R+ + RRSR+ KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVSKR
+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R + +R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVSKR
Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRQRESSPRRKLPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDAEKDDMKRQRESSPRRKLPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 4.2e-103 | 66.58 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SR+PP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
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Query: ATVSKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQRESSPRRKLP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+ KRD PK +N DAEKD +R RE+SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: ATVSKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQRESSPRRKLP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVP
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++P
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 3.0e-104 | 66.58 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SR+PP + KSP ARR R+ PPP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
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+ KRD PK +N DAEKD +R RE+SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
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Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVP
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++P
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|
| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 1.3e-102 | 66.16 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SR+PP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVSKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQRESSPRRKLPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
+ KRD PK +N DAEKD R+ PR +L SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVSKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQRESSPRRKLPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
Query: ARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVP
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++P
Subjt: ARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVP
|
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| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 4.8e-102 | 64.71 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SR+PP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRTPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVSKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQRESSPRRKLP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+ KRD PK +N DAEKD +R RE+SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: ATVSKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQRESSPRRKLP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSA
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+ G G AGRRGRSSSYS+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSA
Query: SPSPRKVP
SPSPR++P
Subjt: SPSPRKVP
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| AT2G29210.1 splicing factor PWI domain-containing protein | 2.4e-08 | 48.6 | Show/hide |
Query: KRQRESSPRRKLPSPRRR---SPVARRGGSP---RRQPDSPRRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRR--PASPMRGGRSPSPLARRHRSPPRPSPRRIRG
+R R S RR L SPRRR SP R SP R+P RR P RR SP SPP RRR P+ P R RSPSP ARRHRSP P+ +R
Subjt: KRQRESSPRRKLPSPRRR---SPVARRGGSP---RRQPDSPRRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRR--PASPMRGGRSPSPLARRHRSPPRPSPRRIRG
Query: SPV--RRRSPPPPRRR---TPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSP
SP R RSPPP RRR +PP R R P P RRRS SP+ R RS S + R R A +RGRS S SPSP
Subjt: SPV--RRRSPPPPRRR---TPPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSP
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