; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0023560 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0023560
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionheterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
Genome locationchr11:12365046..12368379
RNA-Seq ExpressionIVF0023560
SyntenyIVF0023560
Gene Ontology termsGO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
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IPR034131 - DAZ-associated protein 1, RNA recognition motif 2
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
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A0A6J1CH94 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 isoform X19.4e-25495.38Show/hide
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        MQTDSGKLFVGGISWDTDE+RLKEYF+A+GDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFAD S+ADRVIREKHNIDGRM  AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP

Query:  GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
        GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
Subjt:  GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY

Query:  GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
        GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNF+IGLNPGYGG+SNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGY+ GNG
Subjt:  GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG

Query:  GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLGAGGYGRNSGTVLPPT
        GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSA SNAHLGSAS GSIGG+ FANSGV+W SSGISSQGGG+NVFSN+GNLNYGGVDSSYSLGAGGYGRN+GTVLPPT
Subjt:  GNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLGAGGYGRNSGTVLPPT

Query:  SSFPTSTVGFDGPFADFYSAGYGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSAASDVSARSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
        SSFPTSTVGFDGPFADFYSAGYGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSAASDVS+RSSPGFIG HSVNRRQSNRGNTT
Subjt:  SSFPTSTVGFDGPFADFYSAGYGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSAASDVSARSSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.155.8e-4343.09Show/hide
Query:  DSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPG
        + GK+F+GG++W+T +D L++YF  +G+V++  +M+D TTGR RGFGF+ F +P   + V+ ++H++DG++   KRA+PR +Q                 
Subjt:  DSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGPG

Query:  RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPK
        +T K+FVGG+    TE EF+N+F+QFG + D  +M D +T RPRGFGF+TY++E AVE  + + +  ++GK VEVKRA PK
Subjt:  RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPK

Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.0e-6342.09Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
        M +D GKLFVGGISW+TDED+L+E+F  YG+V +A++M+D+ TGR RGFGF++F+DPSV DRV++EKH+ID R    KRA+ R +Q + GRT G++N S 
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP

Query:  GPG-----RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPL
          G     +T+KIFVGGL  T+T+ EF+ YF+ +G +TDV +MYD  T RPRGFGF+++DSE+AV+ VL KTFH+L+GK VEVKRA+PK+ +PG     +
Subjt:  GPG-----RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPL

Query:  GGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMD-GRFSPVSSGRSVFTPFG-SGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNI
        GG   G         GY QGY  +    Y  RMD  RF    S  +    +G SGYG           GYG  SN A    YG      YTG++  +G  
Subjt:  GGYNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMD-GRFSPVSSGRSVFTPFG-SGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNI

Query:  GYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSG-GLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIG-GTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLGAGGYGR
        G  +G G           N+ G+G G + G    NS     S+  G+ G G+G A+SG  +G  G +      + +SN G   YGG    YS    GYG 
Subjt:  GYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSG-GLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIG-GTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLGAGGYGR

Query:  NS--GTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYSAGYGDPTWRSSNFERDGSG
         +  G V    S   ++  G  G    +   GYGD +WRS   +  G G
Subjt:  NS--GTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFYSAGYGDPTWRSSNFERDGSG

Q96EP5 DAZ-associated protein 15.8e-4338.28Show/hide
Query:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGP--
        GKLFVGG+ W T ++ L+ YF+ YG+VV+ VIMKD+TT + RGFGF+ F DP+    V+  + H +DGR    K   PR  Q    RT        GP  
Subjt:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSPGP--

Query:  --GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
           ++ KIFVGG+     E+E + YF +FG +T+VV++YD    RPRGFGFIT++ E++V++ +   FH++ GK VEVKRA P++        P G   +
Subjt:  --GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY

Query:  GQSRVNSFLNGYT--------QGY--------SSSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FGSGYGMGVNFDIGLNP
        G   V +  NG+         QGY        +   IGGYG    GR +P          VS+    F P   F  GYG    F  G  P
Subjt:  GQSRVNSFLNGYT--------QGY--------SSSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FGSGYGMGVNFDIGLNP

Q98SJ2 DAZ-associated protein 11.2e-4339.93Show/hide
Query:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGR-TSGSINVSPGP-
        GKLFVGG+ W T ++ L+ YF+ YG+VV+ VIMKD+TT + RGFGF+ F DP+    V+  + H +DGR    K   PR  Q    R   G     P   
Subjt:  GKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREK-HNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGR-TSGSINVSPGP-

Query:  -GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNYG
          R+ KIFVGG+     E+E K YF++FG +T+VV++YD    RPRGFGFIT++ E++V++ +   FH++ GK VEVKRA P++ S   +  P G   +G
Subjt:  -GRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNYG

Query:  QSRVNSFLNGYT-------QGYS--------SSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FGSGYGMGVNFDIGLNP
           + S  NG+T       QGYS          TIGGYG +  GR  P          VS+    F P   F  GY     F  G  P
Subjt:  QSRVNSFLNGYT-------QGYS--------SSTIGGYGVRMDGRFSP----------VSSGRSVFTP---FGSGYGMGVNFDIGLNP

Q9C652 RNA-binding protein 15.3e-4447.74Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRND-----------QNIV
        M  D  KLFVGGI+ +T E+ LK+YF+ YG V+EAV+ K++ TG+ RGFGF+ FA+     + +R+ H I G+    ++A+ +++           +  V
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRND-----------QNIV

Query:  GRTSGSINVSPGPG---RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKE
         + +G +      G   RT+KIFVGGL+S  TE EFK+YF++FG  TDVVVM+D  T RPRGFGF+TYDSE++VE V+   FHEL+ K VEVKRA+PKE
Subjt:  GRTSGSINVSPGPG---RTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein8.6e-15964.13Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
        MQ+D+GKLF+GGISWDT+E+RLKEYF+++G+V+EAVI+KDRTTGR RGFGF+VFADP+VA+ VI EKHNIDGR+  AK+AVPR+DQN+V R+ S SI  S
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS

Query:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
        P GPGRTRKIFVGGL S+VTES+FK YF+QFGT TDVVVMYDHNT RPRGFGFITYDSEEAVEKVL+KTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG G
Subjt:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G

Query:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
        Y+YG +RVN+ LNGY QG++ + +GGYG+RMDGRFSPV +GRS F  + SGYGM VNFD GL  G+ G +N+  N++YGRG+SPYY GN++RFG  +GYE
Subjt:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE

Query:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWG-SGGLNNGTNSANSNAHL---GSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSG-NLNYGG-VDSSYSLGAGGY
         GN GGNSSFFSS T+NLWG +GGLN   N+ NSN++    GS+SG +     F NSGV+WG     + GGGNN  SN      YGG  +S + LG GGY
Subjt:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWG-SGGLNNGTNSANSNAHL---GSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSG-NLNYGG-VDSSYSLGAGGY

Query:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFYSAG--YGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSA--ASDVSAR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT
          RN G     P+SSF     T+  G+D    A+FY  G  Y DPTWRS   E +G  PF YG+G    +SDVSAR SSPG++G +SVN+RQ NRG  T
Subjt:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFYSAG--YGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSA--ASDVSAR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRGNTT

AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.1e-15864.31Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS
        MQ+D+GKLF+GGISWDT+E+RLKEYF+++G+V+EAVI+KDRTTGR RGFGF+VFADP+VA+ VI EKHNIDGR+  AK+AVPR+DQN+V R+ S SI  S
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRT-SGSINVS

Query:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G
        P GPGRTRKIFVGGL S+VTES+FK YF+QFGT TDVVVMYDHNT RPRGFGFITYDSEEAVEKVL+KTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG G
Subjt:  P-GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLG-G

Query:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE
        Y+YG +RVN+ LNGY QG++ + +GGYG+RMDGRFSPV +GRS F  + SGYGM VNFD GL  G+ G +N+  N++YGRG+SPYY GN++RFG  +GYE
Subjt:  YNYGQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFG-NIGYE

Query:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWG-SGGLNNGTNSANSNAHL---GSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSG-NLNYGG-VDSSYSLGAGGY
         GN GGNSSFFSS T+NLWG +GGLN   N+ NSN++    GS+SG +     F NSGV+WG     + GGGNN  SN      YGG  +S + LG GGY
Subjt:  SGN-GGNSSFFSSATQNLWG-SGGLNNGTNSANSNAHL---GSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSG-NLNYGG-VDSSYSLGAGGY

Query:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFYSAG--YGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSA--ASDVSAR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRG
          RN G     P+SSF     T+  G+D    A+FY  G  Y DPTWRS   E +G  PF YG+G    +SDVSAR SSPG++G +SVN+RQ NRG
Subjt:  -GRNSG-TVLPPTSSF----PTSTVGFD-GPFADFYSAG--YGDPTWRSSNFERDGSGPFGYGLGSA--ASDVSAR-SSPGFIGGHSVNRRQSNRG

AT4G26650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.8e-9847.89Show/hide
Query:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-
        +D GKLF+GGISWDTDE+RL+EYF  YGD+VEAVIM+DRTTGR RGFGFIVFADPSVA+RVI +KH IDGR   AK+AVPR+DQ ++ R +  ++ +SP 
Subjt:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-

Query:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP
             G  RT+KIFVGGL S++TE+EFKNYFDQFGTI DVVVMYDHNT RPRGFGFIT+DSEE+V+ VL KTFHELNGKMVEVKRAVPKEL S  P+RSP
Subjt:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP

Query:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGR--GLSPYYTGN
        L GY  NYG    +S  NS+ N +  GY+++ +G       GRFSP+ SGR+ F    S +G+G+N ++ LN  + GN+     L Y R  G   + + +
Subjt:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGR--GLSPYYTGN

Query:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLG
         +R+ + IGY  G+    S ++ + ++LWG     N ++S+    +LG + G + G         +WG S + S   G           YG    SY  G
Subjt:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLG

Query:  AGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFY--SAGYGDPTWR------SSNFERDG-SGPFGYGLGSAASDVSARSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
        +G  G           SF  +T GFDG   + Y  S+ Y D TW+       S+ E DG S  +G+G+ +  SD SA +S G+ G ++V  RQ++RG
Subjt:  AGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFY--SAGYGDPTWR------SSNFERDG-SGPFGYGLGSAASDVSARSSPGFIGGHSVNRRQSNRG

AT4G26650.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.8e-9847.89Show/hide
Query:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-
        +D GKLF+GGISWDTDE+RL+EYF  YGD+VEAVIM+DRTTGR RGFGFIVFADPSVA+RVI +KH IDGR   AK+AVPR+DQ ++ R +  ++ +SP 
Subjt:  TDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSIN-VSP-

Query:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP
             G  RT+KIFVGGL S++TE+EFKNYFDQFGTI DVVVMYDHNT RPRGFGFIT+DSEE+V+ VL KTFHELNGKMVEVKRAVPKEL S  P+RSP
Subjt:  -----GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKEL-SPGPSRSP

Query:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGR--GLSPYYTGN
        L GY  NYG    +S  NS+ N +  GY+++ +G       GRFSP+ SGR+ F    S +G+G+N ++ LN  + GN+     L Y R  G   + + +
Subjt:  LGGY--NYG----QSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGR--GLSPYYTGN

Query:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLG
         +R+ + IGY  G+    S ++ + ++LWG     N ++S+    +LG + G + G         +WG S + S   G           YG    SY  G
Subjt:  SDRFGN-IGYESGNGGNSSFFSSATQNLWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLG

Query:  AGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFY--SAGYGDPTWR------SSNFERDG-SGPFGYGLGSAASDVSARSSPGFIGGHSVNRRQSNRG
        +G  G           SF  +T GFDG   + Y  S+ Y D TW+       S+ E DG S  +G+G+ +  SD SA +S G+ G ++V  RQ++RG
Subjt:  AGGYGRNSGTVLPPTSSFPTSTVGFDGPFADFY--SAGYGDPTWR------SSNFERDG-SGPFGYGLGSAASDVSARSSPGFIGGHSVNRRQSNRG

AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.1e-9245.59Show/hide
Query:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP
        M+ +S KLF+GGISW+T EDRL++YF+++G+V+EAVIMKDR TGR RGFGF+VFADP+VA+RV+  KH IDG++  AK+AVPR+D  +  +++ S+  SP
Subjt:  MQTDSGKLFVGGISWDTDEDRLKEYFNAYGDVVEAVIMKDRTTGRGRGFGFIVFADPSVADRVIREKHNIDGRM--AKRAVPRNDQNIVGRTSGSINVSP

Query:  GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY
        GP  ++KIFVGGLAS+VTE+EFK YF QFG ITDVVVMYDH T RPRGFGFI+YDSEEAV+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+++    R+ +   ++
Subjt:  GPGRTRKIFVGGLASTVTESEFKNYFDQFGTITDVVVMYDHNTLRPRGFGFITYDSEEAVEKVLIKTFHELNGKMVEVKRAVPKELSPGPSRSPLGGYNY

Query:  GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG
        G SR++S LN YTQG+S S I GYGV+ + R+SP    R  F+PFG GYG+ +NF+      YG  S+      +GR  SP Y  +  RFG+   ESG  
Subjt:  GQSRVNSFLNGYTQGYSSSTIGGYGVRMDGRFSPVSSGRSVFTPFGSGYGMGVNFDIGLNPGYGGNSNFANNLNYGRGLSPYYTGNSDRFGNIGYESGNG

Query:  --GNSSFFSSATQN-LWGSGGLNNGTNSANSNAHLGSASGGSIGGTGFANSGVSWGSSGISSQGGGNNVFSNSGNLNYGGVDSSYSLGAGGYGRNSGTVL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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