; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0023844 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0023844
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotein SPEAR1
Genome locationchr05:26088624..26091496
RNA-Seq ExpressionIVF0023844
SyntenyIVF0023844
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR040356 - SPEAR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008458547.1 PREDICTED: protein SPEAR1 [Cucumis melo]1.45e-137100Show/hide
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XP_011648648.1 protein SPEAR1 [Cucumis sativus]1.05e-12894.53Show/hide
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XP_023522169.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.26e-8974.76Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFV0 SPOROCYTELESS-like EAR-containing protein 11.6e-9894.53Show/hide
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A0A1S3C7M3 protein SPEAR13.1e-105100Show/hide
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A0A6J1G472 protein SPEAR1-like2.1e-6171.29Show/hide
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A0A6J1HQB1 protein SPEAR1-like6.0e-6169.95Show/hide
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                   GMGEYERGSFRYGDSQ TTT S+RW+ SNT +ETQHFG+PNM+GHL N  V DS +H NMNTKYGSDS+GSSSQNSESSET ELDLELR
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A0A6J1KB48 protein SPEAR3-like isoform X18.2e-6675Show/hide
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        SP SYGFHQNFMGMGE+ERGS R GDSQ TT  SLRWDPS+TFLET HFGQPNM+GHLFN+HVQDS I  N+N KYGSDSM  S QNSESS   ELDLEL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IDB0 Protein SPEAR36.1e-2642.65Show/hide
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          SSS  P  YGFH N M      +YER + RYGDSQ     S  W+PS   LE+QHF +PN + H          +H +      + S+GS  QN E+S
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Q84X40 Protein SPEAR11.4e-2543.54Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20080.1 unknown protein9.6e-2743.54Show/hide
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AT2G20080.2 unknown protein1.6e-1836.59Show/hide
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AT4G28840.1 unknown protein4.3e-2742.65Show/hide
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          SSS  P  YGFH N M      +YER + RYGDSQ     S  W+PS   LE+QHF +PN + H          +H +      + S+GS  QN E+S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATAATATTGAAAAGAGGAGAAGTGGGTCGCCGGCGGCGGCGGGGGGGCGGAGAGGGCGGAAGGGAGGAGGCGGAGAGAAACC
GAAGCAACCGCAGAGAGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGTGAAATGGGCTGTGCTGCTTATTCTCACTTCTATCCAAATCTCTCCGCCGGAG
ATGATATGAGAATGCAAACAACAACGCCTTCTAATTTTTCTTACTCCTCAACTCAATCATCTTCTTCCTCTCCTAATTCCTATGGCTTCCATCAAAACTTTATGGGAATG
GGAGAATATGAAAGAGGAAGCTTTAGATATGGTGATTCTCAACTAACAACAACTTCTTCTTTAAGATGGGACCCAAGTAATACATTTCTGGAGACCCAACATTTTGGGCA
ACCAAACATGAGTGGACACCTTTTCAATTCTCATGTACAGGATTCAATAATTCACAACAACATGAACACAAAATATGGGAGTGATTCAATGGGATCAAGCAGTCAGAATT
CTGAATCAAGTGAGACTCAAGAGCTAGATTTGGAGTTGAGATTATCAATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAATTGTTAAGACAGTGAAAAAAAAAAGCTTAAAAAGAGGAATTTTGAAGATCTCTGGCTTCTCAAATTAAGCCTTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCCC
TAATTTTTTTTTTGAAGTTTGAATTTTTGGAATTAGAGAGATTATATTCTATGGGGAGTGGTTATTTTGGGGAGATGAATAATATTGAAAAGAGGAGAAGTGGGTCGCCG
GCGGCGGCGGGGGGGCGGAGAGGGCGGAAGGGAGGAGGCGGAGAGAAACCGAAGCAACCGCAGAGAGGGTTGGGAGTTGCTCAGTTGGAGAAGATCAGATTGCATGGTGA
AATGGGCTGTGCTGCTTATTCTCACTTCTATCCAAATCTCTCCGCCGGAGATGATATGAGAATGCAAACAACAACGCCTTCTAATTTTTCTTACTCCTCAACTCAATCAT
CTTCTTCCTCTCCTAATTCCTATGGCTTCCATCAAAACTTTATGGGAATGGGAGAATATGAAAGAGGAAGCTTTAGATATGGTGATTCTCAACTAACAACAACTTCTTCT
TTAAGATGGGACCCAAGTAATACATTTCTGGAGACCCAACATTTTGGGCAACCAAACATGAGTGGACACCTTTTCAATTCTCATGTACAGGATTCAATAATTCACAACAA
CATGAACACAAAATATGGGAGTGATTCAATGGGATCAAGCAGTCAGAATTCTGAATCAAGTGAGACTCAAGAGCTAGATTTGGAGTTGAGATTATCAATCTAATTAAACT
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ATTAATTAGAGGTAATTAAAATTTTGATAAAAGGGTATTTTTTTTTTCTTTGAGATGTTTGAAACTATCAAAAAAGAGAGAGTGAGAGAGAAAGAAATACAAGGGTGTGA
TTTGTAAAATGGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GEYERGSFRYGDSQLTTTSSLRWDPSNTFLETQHFGQPNMSGHLFNSHVQDSIIHNNMNTKYGSDSMGSSSQNSESSETQELDLELRLSI