CuGenDBv2

Gene ID	IVF0023846
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr07:22234835..22241642
RNA-Seq Expression	IVF0023846
Synteny	IVF0023846
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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        VVARDKGMGKKNNLLGLLDSPVLADTMALTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
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        RKSGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
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        LKICHIIQIFPPEESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRESLMNMFIGVCGKDSHSTAAEALGL
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G43235.1 unknown protein

4.2e-81

43.74

Show/hide

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        FS+P  R         +PR R  RK++ +    T  +    S+SS     D +L   +++ +++  A+  F           + FL S  DAF DL+TLI
Subjt:  FSSPDSRPLFTPLSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSS----SDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLREFLSSGLDAFDDLRTLI

Query:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKVLFGIVSRLGNKFSSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARDKGMGKKNNLLGLLDSPVLA
        + DD NR + VSC++ST++FVG +V+L FV  F ++VL  + S L   F S     VVRRDRSLGG+EVVV                N      DS    
Subjt:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKVLFGIVSRLGNKFSSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARDKGMGKKNNLLGLLDSPVLA

Query:  DTMALTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRKSGVKVSFNTENMRDSFYRASV
         +   +  +S      +     LPKWWP ++  ++    ++++YQ EANR+VRA+VDNR SG+D  +DDI+QLR +CR SGV+V+F  +N  DSFYR S+
Subjt:  DTMALTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRKSGVKVSFNTENMRDSFYRASV

Query:  DFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEESSPEMEMLT
        DFVLN  SR P     + I  ED   F+AGLAE+IG+  + AAR+VSAAVAAR RS+FLQAWAL +Q +HSE+ AEL KIC I +IFPP E S EMEM+ 
Subjt:  DFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEESSPEMEMLT

Query:  LGLKKHLKVEQRESLMNMFIGV-CGKDSHSTAAEALGLV
         GL+K +K+E+R+SL+  F+G+ C +DS  +AAEALGLV
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Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CTTCACCCCTCTCTCCTGCTTCAAACCACGCCGTCGTACTCGTCGGAAAAACAGCCTCACCAAGCTCCGCACCACCACCCACCATCCCTTCGACTCCTCGTCTTCTTCCT
CTGATTCGAACCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCTCGCTCCCACCTTCGCGAGTTTCTG
TCATCGGGATTGGATGCTTTCGATGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGATCAGAATCGCACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGTCA
ATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGGTTTTATTTGGGATTGTATCTCGTTTAGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTATACGGCCCCTGTGGTGAGAA
GGGACCGGAGCCTTGGTGGACGAGAGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGTTGTAGCGCGAGATAAAGGTATGGGGAAGAAGAACAATCTTTTAGGGTTATTGGACAGT
CCCGTGCTAGCGGACACAATGGCTCTGACTGATATTTCAAGTGAAGTTTCGAAGAATGGGGTTTGGGTTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTCCCCCG
ACGGAATGCTACGGCGAATAGGCAAGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGCCCTTGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGACGATATTG
TTCAATTGCGTGAAATATGCAGGAAATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTAT
AGCAGGACTCCCATTTACCCACACTTAATTCTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTTGTTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATTGAGAATGTTCGTGCTGCCAG
GATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCGGAGTTGTTGAAGATCT
GTCACATTATCCAGATATTCCCTCCTGAGGAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAACACTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAAT
ATGTTTATTGGTGTTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGTGCTTCCTCCAAATAAGGGGAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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AGCTTTATTGTATTGTATATATCATCATTCCGCCATTTTAGGTGCGGAAACACGGAGCTTCCAATTCTTTTGCTCTACATGGGCTAATGGACACCACAACAACCACACTC
TGCCTCTTCCTTCCATATCCATTCATTTCCCCTCGCCATAACCTCCACTTCAACCGCCGTTTCTCCTCGCCGGACTCCCGACCACTCTTCACCCCTCTCTCCTGCTTCAA
ACCACGCCGTCGTACTCGTCGGAAAAACAGCCTCACCAAGCTCCGCACCACCACCCACCATCCCTTCGACTCCTCGTCTTCTTCCTCTGATTCGAACCTCCAAACTGTAA
TTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCTCGCTCCCACCTTCGCGAGTTTCTGTCATCGGGATTGGATGCTTTCGAT
GATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGATCAGAATCGCACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGTCAATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGT
GGTCTTTGTAGTTAAGGTTTTATTTGGGATTGTATCTCGTTTAGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTATACGGCCCCTGTGGTGAGAAGGGACCGGAGCCTTGGTGGACGAG
AGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGTTGTAGCGCGAGATAAAGGTATGGGGAAGAAGAACAATCTTTTAGGGTTATTGGACAGTCCCGTGCTAGCGGACACAATGGCT
CTGACTGATATTTCAAGTGAAGTTTCGAAGAATGGGGTTTGGGTTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTCCCCCGACGGAATGCTACGGCGAATAGGCA
AGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGCCCTTGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGACGATATTGTTCAATTGCGTGAAATATGCAGGA
AATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTATAGCAGGACTCCCATTTACCCACAC
TTAATTCTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTTGTTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATTGAGAATGTTCGTGCTGCCAGGATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGC
TAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCGGAGTTGTTGAAGATCTGTCACATTATCCAGATATTCCCTC
CTGAGGAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAACACTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAATATGTTTATTGGTGTTTGTGGTAAA
GATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGTGCTTCCTCCAAATAAGGGGAATTGATATCATCAAAGCTTCGGTCCTGAAGATGTCCATACACTTTTTAAGTA
GGCTTCTAACTCCTGAAATTTTCTTCTCATAACTTTGTATAAATTATTGTGATCAAATTTAGCATTATTCATTGATTGGCTCATTCATCCGATTATTAATTAATGTGTAA
TTTGATTCTTGAATAAAAGAATTATGAAATTAGATGCTGAAAGTTCTTTAT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDTTTTTLCLFLPYPFISPRHNLHFNRRFSSPDSRPLFTPLSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSSSDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLREFL
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PVLADTMALTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRKSGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIY
SRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRESLMN
MFIGVCGKDSHSTAAEALGLVLPPNKGN

IVF0023846 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome