| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607292.1 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.15e-153 | 76.74 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS RITRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ DP TRESRGFGFITMSSNDEAE CI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTV VRRRSRSYSSRRSPSYSPY RS S S++YSSDRSRSRS S NR RRS SPYH RSYS YS
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RRYDSPYYRR HRSYSRS SP R DRSYSPYDY SPDPYYRRHR RSVSRS+SPK+R + R YSRSYSP RR R+YS S
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RSYSRS+SPERSRR S +S SISPER RS RSRS SHTPR H+ + GYS S S V SRSVSPA
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| XP_004145262.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 1.42e-221 | 94.04 | Show/hide |
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RYDSP YRRRYDSPDYYRHH+SYSRS SPYRRWSRDRSYSP D+YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPKSRN RHYSRSYSPEPRRRTLRN+ SPS+E S
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YSRSISPERSR SGSS+YSSSISPERGRS RSRSCSHTPRRHESTRKRGYSSRSRSRSQSVTSRSVSPA
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| XP_008457405.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucumis melo] | 2.50e-243 | 100 | Show/hide |
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRR
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RYDSPYYRRRYDSPDYYRHHRSYSRSSSPYRRWSRDRSYSPYDYYSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPKSRNGRHYSRSYSPEPRRRTLRNYSHSPSRESRRS
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| XP_022150940.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 [Momordica charantia] | 2.59e-154 | 75.96 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPS++RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ADP TRESRGFGFITMSSN+EAE CI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRSRS S RHRRSYGSPYH RSYS
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PY RRRYDSP YYR HRSYSRS S PY R DRSYS Y DYYS D YYRRHRYRSVSRS+SPK+R +GR YSRSYSP PRR TLR+YS S
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PS SR RSYSRS+SPERS+RSGS + S R RS RSRS SHT RRH E++ KR YS SRSRS+SV SRSVSPA
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|
| XP_038894517.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 [Benincasa hispida] | 9.41e-181 | 83.78 | Show/hide |
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MS SRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ DPLTRESRGFGFITMSSNDEA+NCI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRST YSS+RSRSRS S++RHRRSYGS Y+ RSYSYSRR
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RYDSP RR H+SYSRS SPYRR RDRSYSPYD YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPK+R + RHYSRSYSPEPRRRTLR +YS S S ESR
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RSYSRSISPERSRRS SS YS S+SPER RS RSRS S+T RRH ES R RSRSRS+SVTSRSVSPA
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LXJ6 RRM domain-containing protein | 4.8e-173 | 94.04 | Show/hide |
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVH RRRSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTH SSDRSRSRSRSI++HRR+YGSPYHRRSYSYSRR
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RYDSP YRRRYDSPDYYRHH+SYSRS SPYRRWSRDRSYSP D+YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPKSRN RHYSRSYSPEPRRRTLRN+ SPS+E S
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YSRSISPERS RSGSS+YSSSISPERGRS RSRSCSHTPRRHESTRKRGYSSRSRSRSQSVTSRSVSPA
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| A0A1S3C508 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 1.3e-189 | 100 | Show/hide |
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRR
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RYDSPYYRRRYDSPDYYRHHRSYSRSSSPYRRWSRDRSYSPYDYYSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPKSRNGRHYSRSYSPEPRRRTLRNYSHSPSRESRRS
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| A0A6J1D9V3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 | 5.1e-122 | 75.45 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPS++RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ADP TRESRGFGFITMSSN+EAE CI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRSRS S RHRRSYGSPYH RSY
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SPY RRRYDSP YYR HRSYSRS SPY R DRSYS YDYYS D YYRRHRYRSVSRS+SPK+R +GR YSRSYSP P RRTLR+YS S
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PS RSYSRS+SPERS+RSGS + S R RS RSRS SHT RRH E++ KR YS SRSRS+SV SRSVSPA
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|
|
| A0A6J1GBJ2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X5 | 9.9e-118 | 75.94 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS RITRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ DP TRESRGFGFITMSSNDEAE CI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTV VRRR RSYSSRRSPSYSPY RS S S++YSSDRSRSRS S NR RRS SPY RSYS YSR
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Query: RRYDSPYYRRRYDSPDYYRHHRSYSRSSSPYRR---WSRDRSYSPYDYYSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPKSR-NGRHYSRSYSPEPRRRTLRNYSHSPSR
RRYDSPYYRR HRSYSRS SP R RDRSYSPYDY SPD YYRRHR RSVSRS+SPK+R + R YS SYSP RR R++S S
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RSYSRS+SPERSRR S +S SISPER RS RSRS SHTPR H ++ GYS S SV SRSVSPA
Subjt: ESRRSYSRSISPERSRRSGSSVYSSSISPERGRSLRSRSCSHTPRRHESTRKRGYSSRSRSRSQSVTSRSVSPA
|
|
| A0A6J1HP51 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 | 1.8e-119 | 70.24 | Show/hide |
Query: MSYSRRSRYSRSPSFKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCI
MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+T+RELEKHFSAEGTVLDVHL+ADP TRESRGFGFITMSSNDEAE CI
Subjt: MSYSRRSRYSRSPSFKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCI
Query: KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL-RTVHVRRR-SRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYS
KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPG+YLGL RTV R R S SYSSRRSPSYSPY +SSS S+HYSSDRSRSRS S++RH+RS+
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Query: RRRYDSPYYRRRYDSPDYYRHHRSYSRSSSPYR--RWSRDRSYSPYDYYSPDPYYRRHRY--RSVSRSLSPKSRNGRHYSRSYSP---------------
SPY RRRYDSPD YRHHRSYSRS SPYR RDRSYSPYD YSP+PYYRRHR+ RS SRS +P R RSYSP
Subjt: RRRYDSPYYRRRYDSPDYYRHHRSYSRSSSPYR--RWSRDRSYSPYDYYSPDPYYRRHRY--RSVSRSLSPKSRNGRHYSRSYSP---------------
Query: -------------------EPRRRTLRNYSHSPSRESRRSYSRSISPERSRRSGSSVYSSSISPERGRSLRSRSCSHTPRRH-ESTRKRGYSSRSRSRSQ
PRRRT+R+YS SPS+ESR +YS SIS ERS RSGS YS S+SPE R RSRSCSHTPRRH ES RKRG S SRSRSQ
Subjt: -------------------EPRRRTLRNYSHSPSRESRRSYSRSISPERSRRSGSSVYSSSISPERGRSLRSRSCSHTPRRH-ESTRKRGYSSRSRSRSQ
Query: SVTSRSVSPA
SV SR+VSPA
Subjt: SVTSRSVSPA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.6e-11 | 38.21 | Show/hide |
Query: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRR-------GRT
P DVE +L V L+ R + L + F G V DV++ D T+ESRGF F+ +AE+ + ++ +VL+GR + V+ AR R R
Subjt: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRR-------GRT
Query: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRRRYDSPYYRRRYDSPDYY
P P RY G R+ RR RSRS S RS S S Y RS SRS S RS S+SRS R + S RS S SR R SP P
Subjt: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRRRYDSPYYRRRYDSPDYY
Query: RHHRSYSRSSSP
R S SRS SP
Subjt: RHHRSYSRSSSP
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.5e-11 | 38.21 | Show/hide |
Query: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRR-------GRT
P DVE +L V L+ R + L + F G V DV++ D T+ESRGF F+ +AE+ + ++ +VL+GR + V+ AR R R
Subjt: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRR-------GRT
Query: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRRRYDSPYYRRRYDSPDYY
P P RY G R+ RR RSRS S RS S S Y RS SRS S RS S+SRS R + S RS S SR R SP P
Subjt: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRRRYDSPYYRRRYDSPDYY
Query: RHHRSYSRSSSP
R +S SRS SP
Subjt: RHHRSYSRSSSP
|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 6.8e-15 | 33.33 | Show/hide |
Query: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKAR
+ S + + +S EN GN+L+V+G++ R+ EL++ FS GTV V ++ +P+T+ SRGFGF++ S+ +EA + I LN GR++ V+KA+
Subjt: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKAR
Query: RRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYS---YSRRRYDSPYYRRRYDSPDY
R R +PTPG+Y+G RR SR + S YRR++ R R NR+R SY +R +S Y + RY+ RR +
Subjt: RRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYS---YSRRRYDSPYYRRRYDSPDY
Query: YRHHRSYSRS
+ H RS++ +
Subjt: YRHHRSYSRS
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.6e-11 | 38.21 | Show/hide |
Query: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRR-------GRT
P DVE +L V L+ R + L + F G V DV++ D T+ESRGF F+ +AE+ + ++ +VL+GR + V+ AR R R
Subjt: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAENCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRR-------GRT
Query: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRRRYDSPYYRRRYDSPDYY
P P RY G R+ RR RSRS S RS S S Y RS SRS S RS S+SRS R + S RS S SR R SP P
Subjt: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSRSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSRSINRHRRSYGSPYHRRSYSYSRRRYDSPYYRRRYDSPDYY
Query: RHHRSYSRSSSP
R +S SRS SP
Subjt: RHHRSYSRSSSP
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.2e-56 | 52.96 | Show/hide |
Query: MSYSRRSRYSRSPS-FKRSVSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRITRRELEKHFSAEGTVLDVHLLADPLTRESRGFGFITMSSNDEAE
MSYSRRSRYS S S + + RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHL+ DP TRESRGFGFI+M S +A
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CI+ L+ SVL+GR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT R +S SYS RRS S S SRS YSSDR RS S S R RS SP++RR
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YS R R SPYYRRR S Y R+ R+ RS RR+ SR RSYSP RYR+ RS SP R GR RSYSP
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+ R R+YS S RS S S+SP G S SISP +GR SRS S RRH+ SS SRS +S TSRSVSP
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MSYSRRSRYS S S + + RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHL+ DP TRESRGFGFI+M S +A
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CI+ L+ SVL+GR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT R +S SYS RRS S S SRS YSSDR RS S S R RS SP++RR
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YS R R SPYYRRR S Y R+ R+ RS RR+ SR RSYSP RYR+ RS SP R GR RSYSP
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+ R R+YS S RS S S+SP G S SISP +GR SRS S RRH+ SS SRS +S TSRSVSP
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CI+ L+ SVL+GR+ITVEK
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| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.4e-36 | 53.43 | Show/hide |
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S SR SRS S R VS S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V L+ +P TR SRGF F+TMSS +AE CIK
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YLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ R S R YR R S R + D RS R RS + H RS RRS S
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RRY+
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| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.3e-34 | 53.17 | Show/hide |
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S SR SRS S R VS S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V L+ +P TR SRGF F+TMSS +AE CI
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KYLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ R S R YR R S R + D RS R RS + H RS RRS S
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RRY+
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S SR SRS S R VS S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V L+ +P TR SRGF F+TMSS +AE CI
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KYLN+SVLEGR ITVE+
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