; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0023908 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0023908
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionF-box protein PP2-B10-like
Genome locationchr02:18739727..18741731
RNA-Seq ExpressionIVF0023908
SyntenyIVF0023908
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
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A0A0A0LU29 F-box domain-containing protein2.3e-14185.71Show/hide
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A0A5A7UXQ9 F-box protein PP2-B10-like1.4e-17099.32Show/hide
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A0A5D3CCF2 F-box protein PP2-B10-like isoform X12.5e-14085.37Show/hide
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A0A5D3CGR9 F-box protein PP2-B10-like1.2e-171100Show/hide
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Q3E6P4 F-box protein At2g022405.9e-5439.58Show/hide
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        G + F  LPE  I+NI++ T+P DAC +++VS+ F +A  SD VWD+FLP + +  + RS+        +  SKKE++F+LC++P+LI+D KKS  L+K 
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        SGK+CIML +++L I W  +  YW W S PESRF ++  ++  CW EIR K S+ +LSP T Y+ YIVFK ++R     H+  V+  +G+VG E S + +
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              D         R G     T ++++   P  R DGW E  LGEF N+   DE+E  + +++    K+  + QGIE RP
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Q6NPT8 F-box protein PP2-B17.2e-5238.06Show/hide
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        F +LPE  I+ +++ T+P DAC  ++VS++  +AAQSD+VW+ FLP++    + +S            SKKEIF SL ++ +L+++ KKS  ++K SGKK
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        C ML A +L+I+W D+  YW W + PES+F +V  +   CW E+R KIS GMLS  T Y+ Y+VFK    + +GF +  V+A VG VG   + K+V  +S
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           D          I +  VSRA     P   + R E               GP+ R DGW E+ LG+F  +N G    G DE+EI + + +    K+  
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Query:  VFQGIEIRPK
        + QGIEIRP+
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Q9ZVQ6 F-box protein PP2-B101.1e-5541.49Show/hide
Query:  FSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQSGKK
        F S PE  I+ I++ T P DAC ++ VS+ F +  +SDI+W++FLP D +  I  S+        +  SKKE++FSLCN P+L DD KKS+ L+K SGK+
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        C+ML A +LSI+W D   YW W   PESRF +V  +   CW EIR + ++ +LSP T Y+ YIVFK  + K +GF    ++A VG+VG E S + +C   
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Query:  YMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
               F    R G  ++          P+ R DGW EI LGEF N GG   +DE+E+   + +    K   + QGIEIRP
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Q9ZVQ8 Putative F-box protein PP2-B83.0e-5038.41Show/hide
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        G  +   LPE  ++ I++ T+P DAC  ++VS+ F +A +SDIVW++F+P + +  I +S+     F     SKKE++F+LC+  +LIDD KKSL ++K 
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Query:  SGKKCIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVG---SEHSV
        + K+CIM+ A +L+I W ++   W W   P++RF  V  ++  C  EIR +I+S ++SP T Y+ YIV+K     Y GF    V+ +VG+VG    E   
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Query:  KTVCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
        + +C D  MD+   F+   R G N         L  P  R DGW EI +GEF N+GG   DDE+E++  + +    K   + QGIEIRP
Subjt:  KTVCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP

Q9ZVR5 Putative F-box protein PP2-B22.8e-4836.49Show/hide
Query:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ
        G + F +LPE  I+NI++ T+P DAC +++VS+ F +A  SD VWD+FLP+D    +  S+        +  SKKE++F++C++P+L++D  KS  L+K+
Subjt:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ

Query:  SGKKCIMLG-ARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKT
        +GKKC ML   + + I W  T  YW W S PE+RF EV  ++  CW E+R  +++  LSP T Y+ YIVFK +        +  V+A VG+VG E S + 
Subjt:  SGKKCIMLG-ARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKT

Query:  VCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSR-LEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
                      H+   G +    +  +R +  P  R DGW E  LG+F N+ G D V+  + +++  + K   + QGIE RP
Subjt:  VCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSR-LEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G02230.1 phloem protein 2-B15.1e-5338.06Show/hide
Query:  FSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQSGKK
        F +LPE  I+ +++ T+P DAC  ++VS++  +AAQSD+VW+ FLP++    + +S            SKKEIF SL ++ +L+++ KKS  ++K SGKK
Subjt:  FSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQSGKK

Query:  CIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTVCLDS
        C ML A +L+I+W D+  YW W + PES+F +V  +   CW E+R KIS GMLS  T Y+ Y+VFK    + +GF +  V+A VG VG   + K+V  +S
Subjt:  CIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTVCLDS

Query:  YMDDV---------IMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLE---------------GPRGRHDGWFEIVLGEF--DNKG----GDDEVEIILKKVRCTFSKNSF
           D          I +  VSRA     P   + R E               GP+ R DGW E+ LG+F  +N G    G DE+EI + + +    K+  
Subjt:  YMDDV---------IMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLE---------------GPRGRHDGWFEIVLGEF--DNKG----GDDEVEIILKKVRCTFSKNSF

Query:  VFQGIEIRPK
        + QGIEIRP+
Subjt:  VFQGIEIRPK

AT2G02240.1 F-box family protein4.2e-5539.58Show/hide
Query:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ
        G + F  LPE  I+NI++ T+P DAC +++VS+ F +A  SD VWD+FLP + +  + RS+        +  SKKE++F+LC++P+LI+D KKS  L+K 
Subjt:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ

Query:  SGKKCIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTV
        SGK+CIML +++L I W  +  YW W S PESRF ++  ++  CW EIR K S+ +LSP T Y+ YIVFK ++R     H+  V+  +G+VG E S + +
Subjt:  SGKKCIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTV

Query:  CLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
              D         R G     T ++++   P  R DGW E  LGEF N+   DE+E  + +++    K+  + QGIE RP
Subjt:  CLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP

AT2G02250.1 phloem protein 2-B22.0e-4936.49Show/hide
Query:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ
        G + F +LPE  I+NI++ T+P DAC +++VS+ F +A  SD VWD+FLP+D    +  S+        +  SKKE++F++C++P+L++D  KS  L+K+
Subjt:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ

Query:  SGKKCIMLG-ARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKT
        +GKKC ML   + + I W  T  YW W S PE+RF EV  ++  CW E+R  +++  LSP T Y+ YIVFK +        +  V+A VG+VG E S + 
Subjt:  SGKKCIMLG-ARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKT

Query:  VCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSR-LEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
                      H+   G +    +  +R +  P  R DGW E  LG+F N+ G D V+  + +++  + K   + QGIE RP
Subjt:  VCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSR-LEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP

AT2G02340.1 phloem protein 2-B82.2e-5138.41Show/hide
Query:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ
        G  +   LPE  ++ I++ T+P DAC  ++VS+ F +A +SDIVW++F+P + +  I +S+     F     SKKE++F+LC+  +LIDD KKSL ++K 
Subjt:  GRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQ

Query:  SGKKCIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVG---SEHSV
        + K+CIM+ A +L+I W ++   W W   P++RF  V  ++  C  EIR +I+S ++SP T Y+ YIV+K     Y GF    V+ +VG+VG    E   
Subjt:  SGKKCIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVG---SEHSV

Query:  KTVCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
        + +C D  MD+   F+   R G N         L  P  R DGW EI +GEF N+GG   DDE+E++  + +    K   + QGIEIRP
Subjt:  KTVCLDSYMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP

AT2G02360.1 phloem protein 2-B107.7e-5741.49Show/hide
Query:  FSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQSGKK
        F S PE  I+ I++ T P DAC ++ VS+ F +  +SDI+W++FLP D +  I  S+        +  SKKE++FSLCN P+L DD KKS+ L+K SGK+
Subjt:  FSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQSGKK

Query:  CIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTVCLDS
        C+ML A +LSI+W D   YW W   PESRF +V  +   CW EIR + ++ +LSP T Y+ YIVFK  + K +GF    ++A VG+VG E S + +C   
Subjt:  CIMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTVCLDS

Query:  YMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP
               F    R G  ++          P+ R DGW EI LGEF N GG   +DE+E+   + +    K   + QGIEIRP
Subjt:  YMDDVIMFQHVSRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGG---DDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGTTATGAAGGAAGAACAGATTTCTCCTCTCTGCCCGAAGGAGTAATAGCTAACATTTTGGCACTCACGACTCCGTTAGATGCCTGCAGGTCGTCGGCTGTTTC
CCGGGCTTTCCATGCGGCGGCGCAGTCCGATATTGTGTGGGACAGATTCCTGCCTAACGATTTGGACGATTTCATTTGTCGGAGCAAACCTGGTGGCCTGAATTTTGATC
CAATTACGTGTTCTAAGAAAGAGATCTTTTTCTCCCTTTGCAATAGCCCGCTGCTCATTGATGACGCCAAGAAGAGTTTATCATTGGACAAGCAGAGTGGTAAGAAATGC
ATAATGCTTGGAGCGAGGGATCTTTCAATTGTTTGGGATGATACATCTGTCTATTGGACCTGGGAATCTCATCCTGAGTCAAGGTTTGGAGAAGTAGTTGTTATTGTAAG
GGGATGTTGGCTTGAAATACGTAGAAAGATAAGCAGTGGAATGTTGTCTCCTACTACAACGTATGCAACTTACATTGTGTTCAAGATGAGGGAACGTAAATACTTTGGGT
TCCATATAGATTTTGTTGATGCCATGGTGGGAATTGTTGGTAGTGAACACTCTGTGAAGACTGTTTGTTTGGATTCTTATATGGATGACGTTATTATGTTCCAACATGTA
TCACGAGCAGGGAGCAATCATCTACCAACGAATAACATGTCAAGGTTGGAAGGGCCAAGGGGGAGACATGATGGTTGGTTTGAAATTGTGTTGGGAGAGTTTGATAATAA
AGGTGGAGATGATGAAGTTGAAATCATTCTCAAGAAGGTTAGGTGTACTTTTTCCAAGAACAGCTTCGTTTTTCAAGGTATTGAGATTAGGCCTAAAATCAACCCAGAAT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTACCCTAAAATAAAACTATCCCTTGCCACCGGAAAAACCATGGAGGGTTATGAAGGAAGAACAGATTTCTCCTCTCTGCCCGAAGGAGTAATAGCTAACATTTTGG
CACTCACGACTCCGTTAGATGCCTGCAGGTCGTCGGCTGTTTCCCGGGCTTTCCATGCGGCGGCGCAGTCCGATATTGTGTGGGACAGATTCCTGCCTAACGATTTGGAC
GATTTCATTTGTCGGAGCAAACCTGGTGGCCTGAATTTTGATCCAATTACGTGTTCTAAGAAAGAGATCTTTTTCTCCCTTTGCAATAGCCCGCTGCTCATTGATGACGC
CAAGAAGAGTTTATCATTGGACAAGCAGAGTGGTAAGAAATGCATAATGCTTGGAGCGAGGGATCTTTCAATTGTTTGGGATGATACATCTGTCTATTGGACCTGGGAAT
CTCATCCTGAGTCAAGGTTTGGAGAAGTAGTTGTTATTGTAAGGGGATGTTGGCTTGAAATACGTAGAAAGATAAGCAGTGGAATGTTGTCTCCTACTACAACGTATGCA
ACTTACATTGTGTTCAAGATGAGGGAACGTAAATACTTTGGGTTCCATATAGATTTTGTTGATGCCATGGTGGGAATTGTTGGTAGTGAACACTCTGTGAAGACTGTTTG
TTTGGATTCTTATATGGATGACGTTATTATGTTCCAACATGTATCACGAGCAGGGAGCAATCATCTACCAACGAATAACATGTCAAGGTTGGAAGGGCCAAGGGGGAGAC
ATGATGGTTGGTTTGAAATTGTGTTGGGAGAGTTTGATAATAAAGGTGGAGATGATGAAGTTGAAATCATTCTCAAGAAGGTTAGGTGTACTTTTTCCAAGAACAGCTTC
GTTTTTCAAGGTATTGAGATTAGGCCTAAAATCAACCCAGAATAGATGAACTCGAGTAAACTTCTTCAAACTCATGTTAGGACTTTTAGTGTCATGATAGGACATCCAAA
AACGTTGTTTTATTTTGTATGTAGAGAAGTTAAAAGAAACTCTACAGTAGATTTTAGTCTGATTGTTGCTATTTGTTTTTTATTAGTTAAGAACACGTGCGATCCACATG
CCCGTGACATTTGAGTGAGATTTATATAAATTGAATAAGATGCTTGAATTTGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGYEGRTDFSSLPEGVIANILALTTPLDACRSSAVSRAFHAAAQSDIVWDRFLPNDLDDFICRSKPGGLNFDPITCSKKEIFFSLCNSPLLIDDAKKSLSLDKQSGKKC
IMLGARDLSIVWDDTSVYWTWESHPESRFGEVVVIVRGCWLEIRRKISSGMLSPTTTYATYIVFKMRERKYFGFHIDFVDAMVGIVGSEHSVKTVCLDSYMDDVIMFQHV
SRAGSNHLPTNNMSRLEGPRGRHDGWFEIVLGEFDNKGGDDEVEIILKKVRCTFSKNSFVFQGIEIRPKINPE