CuGenDBv2

Gene ID	IVF0024250
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5
Genome location	chr07:3851664..3861100
RNA-Seq Expression	IVF0024250
Synteny	IVF0024250
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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Query:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIA
        SA+D ILGSSEG+DVNV E+A EALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+ I  AFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE+RSENDI+LNDNAEENLRDLIYQ A
Subjt:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS KMTPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQ+I+NIV DAS+ETTKIGMEARYNCCL+IHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AV+NGPYL+RR +ETQPAIMTAERF
Subjt:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

2.7e-246

84.95

Show/hide

Query:  MEDFSVNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM----VGLQADSQTVRTLAC
        ME+F+V+DPTQLL+AAA+FANYPGVR D SVKEF  RFPLP +INALQ KAE PG+E+TLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM    VGLQADSQ VR+LAC
Subjt:  MEDFSVNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM----VGLQADSQTVRTLAC

Query:  KTVTRLLQESDETVPSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTVTRLL+E+D T   A QLI+DY IYPLL++CLLNGNEQVANSSMD++K LAAFP+GMEII P+NKTEATHLG VASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
Subjt:  KTVTRLLQESDETVPSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS

Query:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCVRNLI
        SVASAVYN+NLL+LLESEI+NS DTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESILRSRAMVI GRLLSKENIFSLVDESCVR LI
Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCVRNLI

Query:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIA
        S++D ILGSSEG+DVNV E+A EALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+ I  AFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGE+RSENDI+LNDNAEENL DLIYQ A
Subjt:  SAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIA

Query:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS K+TPSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL EICSKQ+I+NIV DAS+ETTKIGMEARYNCCL+IHKAFMSS RLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        AV+NGPYL+RR +ETQPAIMTAERF
Subjt:  AVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

4.1e-162

56.54

Show/hide

Query:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM----VGLQADSQTVRTLACKTVTR
        + D  QL  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+TLV CL+R+FKTKYGASLIP YM    VGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM----VGLQADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESDETVPSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D    S++QL+++ GIYPLLLD ++N +++VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETVPSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCVRNLISAVDG
        V  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E+ V+ LISA+DG
Subjt:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCVRNLISAVDG

Query:  ILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK
         L S E  D +  EAAI+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +H + +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI GE+R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K
Subjt:  ILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSK

Query:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG
        +TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL EI +K+EI+NIV DA++ET KI MEARYNCC +IH+AF+ S     DP       KLQEAVR+G
Subjt:  MTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG

Query:  PYLNRRNVETQPAIMTAERF
        PY+++++   +P +MT E F
Subjt:  PYLNRRNVETQPAIMTAERF

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

2.8e-158

53.44

Show/hide

Query:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM----VGLQADSQTVRTLACKTVTR
        + D  QL  AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  + PG E+TLV CL+R+FKTKYGASLIP YM    VGL+ADS  V++LACKTV  
Subjt:  VNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYM----VGLQADSQTVRTLACKTVTR

Query:  LLQESDETVPSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D    S++QL+++ GIYPLLLD ++N +++VAN++ ++IK+LA FP  M +I PS   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETVPSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDES-----------
        V  + LL LLE+E+  +KDTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+I GRLLSKENI+ +V+E+           
Subjt:  VYNANLLSLLESEINNSKDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDES-----------

Query:  ---------------------CVRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF
                             CV+ LISA+DG L S E  D +  EAAI+ALGQ+GS+T GA L+LS+ P   +H + +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI 
Subjt:  ---------------------CVRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWGATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIF

Query:  GESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCL
        GE+R +++ +++  AEE+LR LIY  A++S+K+TPSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL EI +K+EI+NIV DA++ET KI MEARYNCC 
Subjt:  GESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEICSKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCL

Query:  SIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF
        +IH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+++++   +P +MT E F
Subjt:  SIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGATTTTTCTGTAAATGATCCGACTCAGCTACTTCAAGCAGCTGCAAACTTTGCAAATTATCCCGGTGTTCGGATTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCG
CTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAATTTCCTGGTGTAGAGGATACTTTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTTAAGACCAAGTATGGAG
CTTCTCTTATACCGCATTATATGGTTGGACTACAGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAACCTTAGCTTGTAAAACGGTCACTCGCCTTTTGCAGGAGTCTGATGAAACTGTT
CCTTCGGCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCCACTTTTGCTCGACTGTCTTCTCAATGGTAATGAACAAGTTGCTAACTCATCGATGGATTCAATTAAGAC
ATTGGCTGCATTTCCACAGGGGATGGAAATCATCATCCCATCGAATAAAACAGAAGCAACACACCTAGGGATTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGGGAAGAGTTCGAG
TCATGGCATTGGTAGTGAAGCTATTTTCAGTTTCTAGCTCCGTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAATAATTCAAAGGAC
ACACTTGTAACTTTAAGTGTGTTGGAACTCTTGTACGAGCTAGTGGAGATTGAACACGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTACTAAGCTCTATAAT
CAGCAACTCATCAGCGGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCCATGGTCATTTGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACATCTTCTCGCTTGTAGATGAATCATGTGTGAGGA
ATTTGATATCTGCTGTAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGAGAGGATGTAAATGTATCTGAAGCTGCAATTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCAAGCACGTGGGGA
GCCACCTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACCTGTGTGAAGCATGCAATTTATACAGCATTTGATCGGCATGAGCATGGTAAACAGCTGGCGGCCATGCATGCTCTTGGTAA
CATCTTCGGGGAAAGTCGATCAGAGAATGATATTGTGCTAAATGATAATGCAGAGGAAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCATCCAGAAGTTCAAAAATGACAC
CCTCAGGTCTTTTTCTAGCTGTTCTTCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGTCTGACGGAGATCTGC
TCGAAACAAGAGATAGTAAATATAGTTTGTGATGCAAGTTCAGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAACTGTTGTTTGTCTATCCATAAGGCTTTCATGTC
TTCACCTAGGCTTACTGGCGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCGAAGCTGCAGGAAGCGGTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATGTTGAAACTCAACCAG
CAATAATGACAGCTGAAAGATTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEDFSVNDPTQLLQAAANFANYPGVRIDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEFPGVEDTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMVGLQADSQTVRTLACKTVTRLLQESDETV
PSAIQLIIDYGIYPLLLDCLLNGNEQVANSSMDSIKTLAAFPQGMEIIIPSNKTEATHLGIVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEINNSKD
TLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVICGRLLSKENIFSLVDESCVRNLISAVDGILGSSEGEDVNVSEAAIEALGQIGSSTWG
ATLLLSSFPTCVKHAIYTAFDRHEHGKQLAAMHALGNIFGESRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASRSSKMTPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLTEIC
SKQEIVNIVCDASSETTKIGMEARYNCCLSIHKAFMSSPRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLNRRNVETQPAIMTAERF

IVF0024250 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome