; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0024830 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0024830
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionCentromere protein S-like
Genome locationchr12:22729711..22732265
RNA-Seq ExpressionIVF0024830
SyntenyIVF0024830
Gene Ontology termsGO:0000712 - resolution of meiotic recombination intermediates (biological process)
GO:0006312 - mitotic recombination (biological process)
GO:0007129 - synapsis (biological process)
GO:0031297 - replication fork processing (biological process)
GO:0036297 - interstrand cross-link repair (biological process)
GO:0043240 - Fanconi anaemia nuclear complex (cellular component)
GO:0071821 - FANCM-MHF complex (cellular component)
GO:0003682 - chromatin binding (molecular function)
GO:0046982 - protein heterodimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009072 - Histone-fold
IPR029003 - CENP-S/Mhf1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004154006.1 protein MHF1 homolog isoform X2 [Cucumis sativus]7.93e-7694.62Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDDSASELLRDRFRLS+ISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFK+T +QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_008440142.1 PREDICTED: centromere protein S isoform X1 [Cucumis melo]3.22e-82100Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_008440159.1 PREDICTED: centromere protein S isoform X2 [Cucumis melo]4.97e-7998.46Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFT +QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_011652290.1 protein MHF1 homolog isoform X1 [Cucumis sativus]5.14e-7996.15Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDDSASELLRDRFRLS+ISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFK+TTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_038894698.1 protein MHF1 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]7.86e-7490Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        M+T +EED SASELLRDRFRLSTISIAEAEAN+SGMEISEPVMTCVADLAFK+TTEQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVIL+AHRNEHL+AILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        K KEPQSERKRKKAPKK+DRDRGAVHI +A
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LR97 Uncharacterized protein4.5e-5794.62Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDDSASELLRDRFRLS+ISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFK+ T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A1S3B159 centromere protein S isoform X16.1e-62100Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A1S3B173 centromere protein S isoform X21.7e-5998.46Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A5A7UM53 Centromere protein S isoform X16.1e-62100Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A5D3BHQ8 Centromere protein S isoform X21.7e-5998.46Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
E1BSW7 Centromere protein S1.3e-0527.78Show/hide
Query:  EEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEP
        E+ +   + LR     +T  + +  A   G+  S+  +  ++++ F+   E  A+DLE+FA+HA R ++ +EDV L A R+  L   +T   ++L +   
Subjt:  EEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEP

Query:  QSERKRKK
        + + K+KK
Subjt:  QSERKRKK

Q2TBR7 Centromere protein S2.2e-0836.19Show/hide
Query:  IAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAV
        + E  A+   M+ S+  +  ++++ F    E  AKDLE+FA+HA R ++NTEDV L A R+  L   +T    D+   +   E+K KK  K +D +R +V
Subjt:  IAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAV

Query:  HIAEA
          AEA
Subjt:  HIAEA

Q6NRI8 Centromere protein S4.5e-0628.32Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        M    EE  S ++ L+        S+ +  A+   ++ S+  +  ++++ F+   E  AKDLE+FA+HA R ++N +DV L A R+  L A ++   +++
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKK
         A   + + K+KK
Subjt:  KAKEPQSERKRKK

Q8N2Z9 Centromere protein S9.2e-0731.01Show/hide
Query:  ETRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        ET  ++  S  + L+     +   + E  A    M+ S+  +  +++L F+   E  AKDLE+FA+HA R ++NTEDV L A R+  L   +T    ++ 
Subjt:  ETRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
          +   ERK +K  K +D  + +   AEA
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

Q9FI55 Protein MHF1 homolog6.1e-3569.57Show/hide
Query:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ
        E+ S  +L+RDRFRLS ISIAEAEA K+GMEI  PV+ CVADLAFK+  E +AKDLELFA HAGRK VN +DV+L+AHRN++LAA L S+CN+LKAKEPQ
Subjt:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ

Query:  SERKRKK-APKKDDR
        SERKRKK + KK+D+
Subjt:  SERKRKK-APKKDDR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G50930.1 Histone superfamily protein4.3e-3669.57Show/hide
Query:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ
        E+ S  +L+RDRFRLS ISIAEAEA K+GMEI  PV+ CVADLAFK+  E +AKDLELFA HAGRK VN +DV+L+AHRN++LAA L S+CN+LKAKEPQ
Subjt:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ

Query:  SERKRKK-APKKDDR
        SERKRKK + KK+D+
Subjt:  SERKRKK-APKKDDR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTAGAATGGAAGAAGACGACTCCGCTTCCGAACTATTGAGGGACAGGTTCCGGCTCTCCACCATTTCTATTGCTGAAGCTGAAGCGAATAAAAGCGGCATGGA
AATTTCTGAACCCGTGATGACTTGTGTTGCGGATTTAGCATTCAAATTTACAACAGAACAGTTGGCGAAGGACCTTGAGTTATTTGCTCAACATGCTGGTCGGAAATCGG
TAAATACAGAAGATGTAATACTAACAGCCCATAGAAACGAGCATTTAGCTGCCATATTAACATCCATCTGCAATGATCTAAAGGCAAAAGAGCCTCAAAGTGAAAGAAAG
CGTAAAAAGGCACCAAAAAAGGATGATAGAGATAGAGGTGCCGTGCATATTGCTGAAGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACGATTCGTTTAAGGCCATCCCATTCCCGTCACGTCGTCAGAGGCATTCGTGGAGGGAAATAAATGCGAAATGGAAAAAGGTAAAGCCTCTGCTCTGCAATGGAAACT
AGAATGGAAGAAGACGACTCCGCTTCCGAACTATTGAGGGACAGGTTCCGGCTCTCCACCATTTCTATTGCTGAAGCTGAAGCGAATAAAAGCGGCATGGAAATTTCTGA
ACCCGTGATGACTTGTGTTGCGGATTTAGCATTCAAATTTACAACAGAACAGTTGGCGAAGGACCTTGAGTTATTTGCTCAACATGCTGGTCGGAAATCGGTAAATACAG
AAGATGTAATACTAACAGCCCATAGAAACGAGCATTTAGCTGCCATATTAACATCCATCTGCAATGATCTAAAGGCAAAAGAGCCTCAAAGTGAAAGAAAGCGTAAAAAG
GCACCAAAAAAGGATGATAGAGATAGAGGTGCCGTGCATATTGCTGAAGCCTAATCACATCTCCCATCTGGCAGATCTCTAGTTAACAAGTGTGCGTACCAACAAGCAAG
CGCAATAGCTTGTGATATTTTTCCGTTTCTTGGTTATACTAATTGGTAAAACCATTTTCGCATGATATGGGCGTATGGAGTTCTTCTGATTCAAAGTATAAGCTTCGGTA
TCATGCAATCCATTGAAGTGGCCCAAGTGTAGAAACATGTATTTTGGTTTTGCTTTAGGCATTTGAGATTGTCAAAAAGCGTGAGGTTTAATGTTTGTTAGTAGTTTTCG
TTGCAAACAGGAAATTGCTCTTTGTACATCGACAGAACAGTTTTATAGTTAAGACTGGTAAGTGCTCAATAGTTTGATATTATAAAGTCATAAATCATGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTTEQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQSERK
RKKAPKKDDRDRGAVHIAEA