; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0024972 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0024972
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotein TIFY 5A-like
Genome locationchr12:19801315..19802240
RNA-Seq ExpressionIVF0024972
SyntenyIVF0024972
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR018467 - CO/COL/TOC1, conserved site
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019513.1 Protein TIFY 5A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.97e-4372.5Show/hide
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XP_022927150.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita moschata]2.16e-4271.67Show/hide
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XP_023520316.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.97e-4372.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX13 Uncharacterized protein2.7e-4082.64Show/hide
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A0A1S3BA64 protein TIFY 5A-like9.2e-57100Show/hide
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A0A6J1CG02 protein TIFY 5A-like3.6e-1652.85Show/hide
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A0A6J1EN30 protein TIFY 5A-like5.1e-3171.67Show/hide
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A0A6J1KQP6 protein TIFY 5A-like4.0e-2870.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCACTTCCCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCCTTCCTCCTCTCCTTCCACCACCACCACCACCACTACCGCTGCCGCCGCCTCCAATTCATCTTC
ACAACACAACCATATCACTCCCATCGGTGTCCCCACGCCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTAGAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGAGAAGAT
GGACGACATGTCGGATTAGTTCATCAGCAGAGAGAGTATGGATGAGGAGCGGGGAAGCTAGCCCCTCCATGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAGAGAAAGCTT
CGCATTCAAACACTTTCACCCTACACTCACTAA
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CACCACCACCACTACCGCTGCCGCCGCCTCCAATTCATCTTCACAACACAACCATATCACTCCCATCGGTGTCCCCACGCCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAA
TAATAGTAGAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGAGAAGATGGACGACATGTCGGATTAGTTCATCAGCAGAGAGAGTATGGATGAGGAGCGGGGAAGCTAGCCCCTCC
ATGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAGAGAAAGCTTCGCATTCAAACACTTTCACCCTACACTCACTAACTTTCCAAATTTTGGAATAATCGTGGCTTCTTCAT
AATTCTCTCTTCCCTTTTGTCATTTTTCTTCTTTAGCTTTTAGGAGCTATAAGTTTGTGTTTGGATTGTATTTGTACATACTTGGAGCTTATTAATTTTCCAATACATTA
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