CuGenDBv2

Gene ID	IVF0025337
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	chr05:17579065..17579316
RNA-Seq Expression	IVF0025337
Synteny	IVF0025337
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

GFP97092.1 protein tic 214 [Phtheirospermum japonicum]

6.28e-45

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

OWK25800.1 hypothetical protein AJ87_01050 [Rhizobium yanglingense]

9.20e-45

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

YP_009661885.1 hypothetical chloroplast RF1 [Mimosa pudica]

6.57e-45

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI V+ALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

YP_009706462.1 Ycf1 [Styphnolobium japonicum var. japonicum]

4.85e-44

93.59

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI ++ALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

YP_247646.1 hypothetical protein CsCp100 [Cucumis sativus]

3.44e-44

94.87

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAW+MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRP+TI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1P8C7U3 Protein TIC 214

9.9e-34

94.87

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAW+MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRP+TI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

A0A1X9Q205 Protein TIC 214

9.9e-34

94.87

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAW+MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRP+TI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

A0A218KG90 Protein TIC 214

9.9e-34

94.87

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAW+MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRP+TI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

A0A286SB96 Protein TIC 214

9.9e-34

94.87

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAW+MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRP+TI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

A0A4P9CZ26 Protein TIC 214

1.5e-34

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI V+ALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q2MI42 Protein TIC 214

7.8e-36

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

Q2MIC9 Protein TIC 214

7.8e-36

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

Q33BW4 Protein TIC 214

7.8e-36

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

Q3C1P6 Protein TIC 214

7.8e-36

96.15

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

Q4VZL0 Protein TIC 214

2.7e-36

94.87

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRAW+MEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRP+TI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G07739.1 Ycf1 protein

5.8e-34

90.12

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGP YLF+LRA VM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

ATCG01000.1 Ycf1 protein

1.2e-34

91.36

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

ATCG01130.1 Ycf1 protein

1.2e-34

91.36

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

ATMG00370.1 Ycf1 protein

1.2e-34

91.36

Show/hide

Query:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF
        GLYYGFLTTFSIGPSYLF+LRA VM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTI VLALPYLLFHFF
Subjt:  GLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVM---EEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCGAGCCAAAAAAGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCATTCTCCGAGCTTGGGTTATGGAAGAAGGAACTGAGAAGAA
AGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAACTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAATTGTCCTAG
CTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MRAKKGLYYGFLTTFSIGPSYLFILRAWVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTIIVLALPYLLFHFF

IVF0025337 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome