; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0025552 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0025552
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionWRKY protein
Genome locationchr07:20135734..20137424
RNA-Seq ExpressionIVF0025552
SyntenyIVF0025552
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003657 - WRKY domain
IPR036576 - WRKY domain superfamily
IPR044810 - WRKY transcription factor, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044848.1 putative WRKY transcription factor 29 [Cucumis melo var. makuwa]1.23e-19699.63Show/hide
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KAG6577177.1 WRKY transcription factor 22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.81e-11469.96Show/hide
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XP_038903556.1 probable WRKY transcription factor 29 [Benincasa hispida]2.23e-14981.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BTM4 probable WRKY transcription factor 291.0e-151100Show/hide
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A0A5A7TPM8 Putative WRKY transcription factor 298.5e-15199.63Show/hide
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A0A5D3CZ98 Putative WRKY transcription factor 291.0e-151100Show/hide
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A0A6J1EZF1 probable WRKY transcription factor 292.3e-8769.23Show/hide
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E7CEX4 WRKY protein4.4e-13995.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04609 WRKY transcription factor 221.4e-3336.14Show/hide
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O64747 Probable WRKY transcription factor 357.2e-3065.66Show/hide
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Q9FLX8 Probable WRKY transcription factor 271.3e-3149.67Show/hide
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          PT RN+LAG+TR K   + NP      SP + T    I      P++G  D
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Q9SA80 Probable WRKY transcription factor 142.5e-3065Show/hide
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        V SD W WRKYGQKPIKGSP+PR YYRCSSSKGCSARKQVERS +DP + V+TYT+EHNH  P +RNALAG+TR    +  NPN     + N NS+S+ S
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Q9SUS1 Probable WRKY transcription factor 293.7e-3438.75Show/hide
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        W WRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGC ARKQVER+  +PE F +TYT EHNH  PTRRN+LAG+TR K                + +P  + ++   
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Query:  NSTSVA----SIEEDQHHPMEGVADGEVLMD-MPFEFFTG
        + +SVA    S+ E   H   G  +G  L + +P +  +G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30650.1 WRKY DNA-binding protein 141.8e-3165Show/hide
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AT2G34830.1 WRKY DNA-binding protein 355.1e-3165.66Show/hide
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AT4G01250.1 WRKY family transcription factor1.0e-3436.14Show/hide
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        +DW L A+V+GC+ +   ++TT  +  +   TN +++  R       G              +SS S  +   E    +N                 K P
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Query:  EPTRRNALAGTTRKKFPALENPNLD--MILSPNNSTSVASIEE----DQHHPMEGVADGE----VLMD--MPFEFFTGLEDLLFG
         PT RN+LAG+TR+K P+ +  +      ++  +S+ V S +E     + H   G  DGE     L D  +  +FF GLE+   G
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AT4G23550.1 WRKY family transcription factor2.6e-3538.75Show/hide
Query:  NNYYNPQISSSSIFHDEFEGLFG-----RNSSNNSAAASISHLLRDFKEPADQKLH--------HKNQI-IQPTKQKQSKKSRQNRVVKEVKADKVCSDS
        +++Y P++ +S +  DE   L+         +  +++ S+    + F++   Q+ H          + I I  +K K+SKK++Q RVV++VK + + SD+
Subjt:  NNYYNPQISSSSIFHDEFEGLFG-----RNSSNNSAAASISHLLRDFKEPADQKLH--------HKNQI-IQPTKQKQSKKSRQNRVVKEVKADKVCSDS

Query:  WGWRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGCSARKQVERSLSDPEVFVVTYTAEHNHAEPTRRNALAGTTRKKF-------------PALENPNLDMILSPN
        W WRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGC ARKQVER+  +PE F +TYT EHNH  PTRRN+LAG+TR K                + +P  + ++   
Subjt:  WGWRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGCSARKQVERSLSDPEVFVVTYTAEHNHAEPTRRNALAGTTRKKF-------------PALENPNLDMILSPN

Query:  NSTSVA----SIEEDQHHPMEGVADGEVLMD-MPFEFFTG
        + +SVA    S+ E   H   G  +G  L + +P +  +G
Subjt:  NSTSVA----SIEEDQHHPMEGVADGEVLMD-MPFEFFTG

AT5G52830.1 WRKY DNA-binding protein 279.3e-3349.67Show/hide
Query:  FKEPADQKLHHKNQIIQPTKQKQSKKSRQNRVVKEVKADKVCSDSWGWRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGCSARKQVERSLSDPEVFVVTYTAEHNH
        F+   DQ L  ++   QP  + + +K++Q R +  V  + + SD W WRKYGQKPIKGSPYPR+YYRCSSSKGC ARKQVERS  DP +F+VTYT EH H
Subjt:  FKEPADQKLHHKNQIIQPTKQKQSKKSRQNRVVKEVKADKVCSDSWGWRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGCSARKQVERSLSDPEVFVVTYTAEHNH

Query:  AEPTRRNALAGTTRKKFPALENPNLDMILSPNNSTSVASIEEDQHHPMEGVAD
          PT RN+LAG+TR K   + NP      SP + T    I      P++G  D
Subjt:  AEPTRRNALAGTTRKKFPALENPNLDMILSPNNSTSVASIEEDQHHPMEGVAD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGATTGGGGTTTGCAAGCAATTGTAAAAGGGTGCAACGGAATACCAATTGGTTCTTCAACAACAGCAGCAACAACAAGGCTTATGGAAGATACAAATAATTTGTA
TTCTTTTTTGAGATCAGATCAAGAAGAAGATGGAGGATTTTTTTCTTCTTGTGTTTATAATAATTATTATAATCCTCAAATTTCAAGTTCTTCAATATTTCATGATGAGT
TTGAAGGATTATTTGGAAGGAATTCATCCAATAATTCAGCAGCTGCCTCCATTTCTCATCTTCTTAGAGATTTTAAGGAACCTGCTGATCAAAAGCTTCATCACAAGAAC
CAAATTATCCAACCAACTAAACAGAAACAAAGCAAGAAAAGTAGACAAAATAGGGTAGTGAAAGAGGTGAAAGCAGATAAAGTATGTTCAGATTCATGGGGATGGAGAAA
ATATGGACAAAAACCAATCAAAGGCTCTCCATACCCAAGAAGCTATTATAGATGCAGCTCCTCGAAAGGATGTTCTGCTCGAAAGCAAGTCGAACGTAGCCTCTCCGATC
CCGAAGTCTTTGTCGTAACCTACACAGCCGAGCACAACCATGCCGAGCCTACTCGCCGTAACGCCCTTGCAGGGACCACCCGGAAGAAGTTCCCGGCGCTTGAGAACCCG
AATTTGGACATGATTCTCTCACCTAATAATTCGACTTCAGTGGCATCCATTGAAGAAGATCAACATCATCCAATGGAAGGTGTGGCAGATGGGGAAGTTTTGATGGATAT
GCCATTTGAATTCTTCACTGGTTTGGAGGATTTACTTTTTGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAAGAAGTACTTTTCAAAGTCAGCTCCCCTCTTCCCCTTAGCTTAAGTTCTTTGTATATATTTTTCCCCCATTGTCTTTTTGAGAATTATTATTAATTATTGTAATATC
AATGGAGGATTGGGGTTTGCAAGCAATTGTAAAAGGGTGCAACGGAATACCAATTGGTTCTTCAACAACAGCAGCAACAACAAGGCTTATGGAAGATACAAATAATTTGT
ATTCTTTTTTGAGATCAGATCAAGAAGAAGATGGAGGATTTTTTTCTTCTTGTGTTTATAATAATTATTATAATCCTCAAATTTCAAGTTCTTCAATATTTCATGATGAG
TTTGAAGGATTATTTGGAAGGAATTCATCCAATAATTCAGCAGCTGCCTCCATTTCTCATCTTCTTAGAGATTTTAAGGAACCTGCTGATCAAAAGCTTCATCACAAGAA
CCAAATTATCCAACCAACTAAACAGAAACAAAGCAAGAAAAGTAGACAAAATAGGGTAGTGAAAGAGGTGAAAGCAGATAAAGTATGTTCAGATTCATGGGGATGGAGAA
AATATGGACAAAAACCAATCAAAGGCTCTCCATACCCAAGAAGCTATTATAGATGCAGCTCCTCGAAAGGATGTTCTGCTCGAAAGCAAGTCGAACGTAGCCTCTCCGAT
CCCGAAGTCTTTGTCGTAACCTACACAGCCGAGCACAACCATGCCGAGCCTACTCGCCGTAACGCCCTTGCAGGGACCACCCGGAAGAAGTTCCCGGCGCTTGAGAACCC
GAATTTGGACATGATTCTCTCACCTAATAATTCGACTTCAGTGGCATCCATTGAAGAAGATCAACATCATCCAATGGAAGGTGTGGCAGATGGGGAAGTTTTGATGGATA
TGCCATTTGAATTCTTCACTGGTTTGGAGGATTTACTTTTTGGATGACGACTTATCCTTTTGGGGAAGTGATTATATTGTTGTTCATTTTATGAATATGAAATAGCAATT
GTAAAACTTATGATCTCCTCTTCTTGGAAAAGAGCATGTACGATCATGATGATTAAGGGTTTAGTGGGGGTGAATTATTTCGAAAGAAAATGGAACAAATGGTACAGAGA
GATGTCTTTTTCAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATTGAGATGGTTTTTAAAACGGGATGGGAGAATCGAAATCTCTAACATAAAATTGAGTTCATGTTAGTTAAGCTATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDWGLQAIVKGCNGIPIGSSTTAATTRLMEDTNNLYSFLRSDQEEDGGFFSSCVYNNYYNPQISSSSIFHDEFEGLFGRNSSNNSAAASISHLLRDFKEPADQKLHHKN
QIIQPTKQKQSKKSRQNRVVKEVKADKVCSDSWGWRKYGQKPIKGSPYPRSYYRCSSSKGCSARKQVERSLSDPEVFVVTYTAEHNHAEPTRRNALAGTTRKKFPALENP
NLDMILSPNNSTSVASIEEDQHHPMEGVADGEVLMDMPFEFFTGLEDLLFG