; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0025667 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0025667
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationchr03:20078307..20081107
RNA-Seq ExpressionIVF0025667
SyntenyIVF0025667
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.38e-5888.12Show/hide
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XP_011649873.1 uncharacterized protein LOC101216688 [Cucumis sativus]8.96e-6497.03Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]3.95e-5887.13Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.78e-5888.12Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein3.0e-4897.03Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial9.2e-50100Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S149.2e-50100Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067331.3e-4387.13Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449965.8e-4487.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1Z780 30S ribosomal protein S143.1e-1848.91Show/hide
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P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial9.9e-3367.35Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.4e-3468.37Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.9e-2864.89Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial8.3e-3265.31Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S141.3e-3263.64Show/hide
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        G KRN  D+ RR LAA+FE++R L+KA C DP LP ++R+++RYKLSKLPRNS+F R+RNRC+FTGR R V +LFR+SRIVFR LA KG +MG+ K+SW
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S145.1e-0837.78Show/hide
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        R++L  K+  ++R+  K I   PSL +  + +   KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPR  Y+ F +S  + RE+ +  L+ G  ++SW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGGGACAAGCGAAACATTCTTGATAATTATCGCCGACAGCTTGCTGCCAAGTTTGAGGTGAAGCGGAATCTTTTCAAAGCCATTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
CAAAGATGTTCGTGAGGAGCATCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCAAGAAATAGTTCGTTCACTCGATTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGTCGACCTAGGGGTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTATGTCTCGTATCGTTTTCCGTGAACTGGCGAAGAAAGGTCTTGTAATGGGTGTCAAGAAAGCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGCGAATTTGTCGGTTCTTCAGCCGATTTCGCTCTCTTCCATCGACCTCAATTCCCTTGTCTGCTCAAACTCGAAGAACTCAAAGGCAGCTACAGCCATTGCAGAGGATT
TCAACCCTTGAAGGTGAAGCGAAATGTCGGGGGACAAGCGAAACATTCTTGATAATTATCGCCGACAGCTTGCTGCCAAGTTTGAGGTGAAGCGGAATCTTTTCAAAGCC
ATTTGCAATGATCCGAGTCTTCCCAAAGATGTTCGTGAGGAGCATCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCAAGAAATAGTTCGTTCACTCGATTGAGGAATCGCTGCATTTT
CACCGGTCGACCTAGGGGTGTCTACCAGCTTTTCCGTATGTCTCGTATCGTTTTCCGTGAACTGGCGAAGAAAGGTCTTGTAATGGGTGTCAAGAAAGCTTCTTGGTAGA
TATTGATTGATGGTAGAGACTTTTGTCGTTGTGGCCAGCGGGAATTAAACATATGCTCTGAAAAATGTAATATTAATTTAAATTCCTTGGACATGATCCATGCCAAAGAA
GAGCAAAGGCTTTACTTTTACTATTCAATAAGTGTTTTGTCTTAGACAGTTAAGAATTGTGTTGTATTTTTCTGATAGTTACCATTTCCTTTTCCCCTACCATTTAGTTG
GTTGCACTCTCCCTGCTTATCTGCTACTTACCCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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