; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0025748 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0025748
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTranslocase subunit seca
Genome locationchr09:10458685..10460159
RNA-Seq ExpressionIVF0025748
SyntenyIVF0025748
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047427.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold498G00180 [Cucumis melo var. makuwa]2.97e-108100Show/hide
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KAG7032498.1 hypothetical protein SDJN02_06547 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.09e-8380.38Show/hide
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        LP+FS   A PP SPPPS  R GG VR NFGN PAVRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA
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XP_004140334.1 uncharacterized protein LOC101221533 [Cucumis sativus]3.24e-10994.94Show/hide
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XP_008465783.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503385 [Cucumis melo]5.17e-115100Show/hide
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XP_038906747.1 uncharacterized protein LOC120092671 [Benincasa hispida]4.60e-10289.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KRF1 Uncharacterized protein6.8e-8494.94Show/hide
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A0A1S3CR46 uncharacterized protein LOC1035033852.7e-88100Show/hide
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A0A5D3C147 Uncharacterized protein5.8e-83100Show/hide
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        AASPPLSPPPSAGRKGGCVRVNFGNNPAVRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA
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A0A6J1E6Z2 uncharacterized protein LOC1114311741.3e-6379.5Show/hide
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        V EEM R+A TDRRER+VCPKPRRLGLIN T NDNPFRHRFDS    DA+DLLF KGGC LE FNSS+TQLASS PY CG+PPSRVANPLIQDARFG+EK
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A0A6J1I2X1 uncharacterized protein LOC1114704602.3e-6379.11Show/hide
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        E MR+A TDRRER+VCPKPRRLGLIN T NDNPFRHRFDS    DA+DLLF KGGC LE F SS+TQLASS PY CG+PPSRVANPLIQDARFG+EKPK+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13390.1 unknown protein6.0e-2440.59Show/hide
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        EEMR  +A +DRR+ ++CPKPRR+G +N   + +      H+ +       S+ +D +  KGG G  + + + T +     +F GSPPSRV+NPL +D+ 
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        F +E   LL + S + S P +    PPS+ R G CV    +FGNNP VR+ GFDC  DR   NRSI  LA
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AT1G13390.2 unknown protein6.0e-2440.59Show/hide
Query:  EEMR--SAATDRRERIVCPKPRRLGLINDTCNDN---PFRHRFD-------SDAMDLLFLKGGCGLEKFNSSNTQLASSTPYFCGSPPSRVANPLIQDAR
        EEMR  +A +DRR+ ++CPKPRR+G +N   + +      H+ +       S+ +D +  KGG G  + + + T +     +F GSPPSRV+NPL +D+ 
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Query:  FGDEKPKLLPLFSTAASPPLS---PPPSAGRKGGCV--RVNFGNNPAVRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA
        F +E   LL + S + S P +    PPS+ R G CV    +FGNNP VR+ GFDC  DR   NRSI  LA
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AT1G68490.1 unknown protein1.5e-3046.2Show/hide
Query:  EMRSAATDRRER----IVCPKPRRLGLINDTCNDNP-----FRHRF-------DSDAMDLLFLKGGCGLEKFNSSNTQLASSTPYFCGSPPSRVANPLIQ
        ++RS++    ER    +VCPKPRR+GL N+  + +      F H+        ++D +D++  K G G E+ N     + S +P+ CGSPPSRVANPL Q
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Query:  DARFGDEKPKLLPLF--STAASPPLSPPPSAGRKGGC-VRVNFGNNPAVRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA
        DARF DE   +  +        P  SP  S+GRKGGC VR NFGN+P VR+EGFDC LDR+ RN SIPALA
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AT3G02555.1 unknown protein7.9e-2449.66Show/hide
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        + +VCPKPRR   +       PFR  F  S A D+   K G   L+ F    +  + S P+F GSPPSR ANPL QDARFGDEK           SP LS
Subjt:  ERIVCPKPRRLGLINDTCNDNPFRHRFD-SDAMDLLFLKGGCG-LEKFNSSNTQLASSTPYFCGSPPSRVANPLIQDARFGDEKPKLLPLFSTAASPPLS

Query:  P-PPSAGR-KGGCVRVNFGNNPA-VRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA
        P  PSA R K GC R+ FG  PA VR+EGFDC L+R+R N SIPA+A
Subjt:  P-PPSAGR-KGGCVRVNFGNNPA-VRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA

AT5G16110.1 unknown protein1.5e-2747.2Show/hide
Query:  DRRERIVCPKPRRLGLINDTCNDNPFRHRFDSDAMDLLFLKGGCGL-------EKFNSSNTQLASSTPYFCGSPPSRVANPLIQDARFGDEK--------
        DR++ +VCPKPRR+GL+ +     P R      A DL   K G  L       E   +    L+SS PYF GSPPSR ANPL QDARF DEK        
Subjt:  DRRERIVCPKPRRLGLINDTCNDNPFRHRFDSDAMDLLFLKGGCGL-------EKFNSSNTQLASSTPYFCGSPPSRVANPLIQDARFGDEK--------

Query:  PKLLPLFSTAASPPLSPPPSAGRKGGCVRVNFG-NNPAVRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA
        P L P +S    P  S   S+    GCVR+ FG N+PAVR+EGFDC L+R+R+N SIPA+A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATTGGGTTTGTGAAGAGATGCGAAGCGCCGCCACCGACCGCCGTGAGCGAATTGTTTGTCCCAAACCCCGCCGTCTCGGTCTCATCAATGATACTTGCAACGATAA
CCCATTTAGACACCGGTTTGATTCAGATGCTATGGATCTCCTCTTCTTAAAGGGTGGTTGTGGTTTGGAGAAATTTAACAGTAGTAATACACAATTAGCCTCGTCGACGC
CGTATTTTTGTGGATCGCCGCCGAGCAGAGTAGCTAACCCATTGATCCAAGACGCTCGATTTGGGGATGAGAAGCCAAAGCTGCTCCCCCTCTTCTCGACGGCGGCTTCT
CCTCCTTTGTCTCCACCGCCGTCGGCCGGTAGAAAAGGTGGATGTGTCCGGGTTAACTTTGGTAACAACCCGGCGGTGAGGATCGAAGGGTTTGACTGCCGCCTCGACAG
GGAGAGGCGAAACCGCAGCATCCCTGCCCTGGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTGAAATAGAGAGGAAATCTCCCCATCGCTCTCTCTATGTCCCTCTAGCTGTGCTTTGCTGTTGCCCAATAGATATTACCCTTTTTTCCCATTCTTTCTCTCTCTCCAT
TTTCATTTTATTTTCCAATTAACAAATCTGATTCCCGTCTCTTTGCCCCATTCTCTCTTCTTTATGTTCTTGTTATATAACTCATAACCCACGCTCCTCCTCTCCTTTTT
CTCCTAACCACAATCCTCTCTCTTCTTCTTTAGGCAAACAGAAAACTAAAATTAGAAGAAGATGAATTGGGTTTGTGAAGAGATGCGAAGCGCCGCCACCGACCGCCGTG
AGCGAATTGTTTGTCCCAAACCCCGCCGTCTCGGTCTCATCAATGATACTTGCAACGATAACCCATTTAGACACCGGTTTGATTCAGATGCTATGGATCTCCTCTTCTTA
AAGGGTGGTTGTGGTTTGGAGAAATTTAACAGTAGTAATACACAATTAGCCTCGTCGACGCCGTATTTTTGTGGATCGCCGCCGAGCAGAGTAGCTAACCCATTGATCCA
AGACGCTCGATTTGGGGATGAGAAGCCAAAGCTGCTCCCCCTCTTCTCGACGGCGGCTTCTCCTCCTTTGTCTCCACCGCCGTCGGCCGGTAGAAAAGGTGGATGTGTCC
GGGTTAACTTTGGTAACAACCCGGCGGTGAGGATCGAAGGGTTTGACTGCCGCCTCGACAGGGAGAGGCGAAACCGCAGCATCCCTGCCCTGGCTTAGAAACCCTATCCA
AGCCTAGCCGAGCCGATTGAGCAATGATGATTAAGAAAACGAACACATGGATTTTAAATTTTTTTCCAACATTCAAATTTAAGATATTAAAGTACAATTTTGAAAGAAAA
AAGAAACCTTTTTGTCCAAAACACCATTGTTGTAAATAATTCGGAAAGGAAATCCAAGTAAATATATGTCAAAAGAAAAAAGGGGCCTTGTTAGGTTTCTTTCTCTATTT
AGTTGAGTTGAGGTTTGAGAGTCCTTATTTGACCATATTGAAAAATAAGAGTCAGAGGGAGAGGGAGATTATGCTTCTCTATTTTGTAGCATATGTATGTTCTTTTATTT
CTCTTTAGGAGTGTCCAAGATTGTTTCTTTGTAGCTTAAGGGAAAACTTTTTGTTGCAGCTTGAGAATGAGAAAACATGTACAAATTGAAGCTGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNWVCEEMRSAATDRRERIVCPKPRRLGLINDTCNDNPFRHRFDSDAMDLLFLKGGCGLEKFNSSNTQLASSTPYFCGSPPSRVANPLIQDARFGDEKPKLLPLFSTAAS
PPLSPPPSAGRKGGCVRVNFGNNPAVRIEGFDCRLDRERRNRSIPALA