; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0026171 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0026171
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL72-like
Genome locationchr08:5963994..5965201
RNA-Seq ExpressionIVF0026171
SyntenyIVF0026171
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025673.1 RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo var. makuwa]5.87e-137100Show/hide
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KAG6603909.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.40e-9474.61Show/hide
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XP_008440820.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo]1.99e-144100Show/hide
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XP_011658497.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHA2B [Cucumis sativus]1.05e-13297.89Show/hide
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XP_038881295.1 RING-H2 finger protein ATL79-like [Benincasa hispida]7.72e-11085.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKP7 RING-type domain-containing protein2.2e-10397.91Show/hide
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A0A1S3B2S4 RING-H2 finger protein ATL72-like1.3e-111100Show/hide
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A0A5D3CLV8 RING-H2 finger protein ATL72-like4.7e-106100Show/hide
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A0A6J1GEN4 RING-H2 finger protein ATL74-like4.0e-7374.61Show/hide
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A0A6J1IJG4 RING-H2 finger protein ATL74-like7.6e-7273.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL641.9e-1140.86Show/hide
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Q8GW38 RING-H2 finger protein ATL472.1e-1041.89Show/hide
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        L+  +PV++Y +              E  +C +CL EF   D+LR+LPNC H FH  CID WL L +  CPLCR
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Q8H7N9 E3 ubiquitin-protein ligase Os03g01882002.1e-1032.59Show/hide
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        T+    A+   FV+    S+      Q  +P  +   ST S Q                  ++   P  +YGD  + M +           C +CLAEF 
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          DELRVLP C HVFH  CID WL   ++ CPLCR
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL51.2e-1041.57Show/hide
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        +S S  PL  T    +L  +P+++Y   +   P            C +CL+EFE  DE RVLP C HVFH  CID W   RS  CPLCR
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Q9SJJ7 RING-H2 finger protein ATL579.4e-1137.5Show/hide
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        SQ + ++PVY Y  ++             + +CVICL++FE G+ ++V+P+C HVFH  C+D WL    + CPLCR + +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23980.1 RING/U-box superfamily protein1.5e-1141.89Show/hide
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        L+  +PV++Y +              E  +C +CL EF   D+LR+LPNC H FH  CID WL L +  CPLCR
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AT1G63840.1 RING/U-box superfamily protein5.1e-1240.26Show/hide
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AT2G27940.1 RING/U-box superfamily protein6.7e-1237.5Show/hide
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        SQ + ++PVY Y  ++             + +CVICL++FE G+ ++V+P+C HVFH  C+D WL    + CPLCR + +
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AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein1.3e-1240.86Show/hide
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        R  L + S+ P        +L  +P+++Y  SS N P        E   C +CL+EFE  DE R+LP C H FH  CID W   RS  CPLCR
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AT3G62690.1 AtL58.7e-1241.57Show/hide
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        +S S  PL  T    +L  +P+++Y   +   P            C +CL+EFE  DE RVLP C HVFH  CID W   RS  CPLCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCATATTGGCCTTCGGCCTCGGTAGTAATGCCCCACTGCCCTCTCAATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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