; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0026348 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0026348
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTranscription factor bHLH49 isoform X1
Genome locationchr03:26449256..26451510
RNA-Seq ExpressionIVF0026348
SyntenyIVF0026348
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.48e-179100Show/hide
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XP_016899947.1 PREDICTED: transcription factor bHLH74 isoform X2 [Cucumis melo]2.45e-12699.48Show/hide
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XP_038885625.1 transcription factor bHLH74-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.27e-13781.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein2.0e-13193.63Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X17.4e-13999.63Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X24.9e-9899.48Show/hide
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A0A2K2AGW6 BHLH domain-containing protein2.7e-4044.33Show/hide
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            QI N  CP +Y +            ++++ +S +  + + P   N  +R+ V  SNS   PNKNAE      P    ++I  + D K QK+E   S
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X18.8e-140100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NKN9 Transcription factor bHLH741.8e-2557.02Show/hide
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        K V+LDEIINYVQSLQQQVEF
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Q84T08 Transcription factor BHLH0897.2e-2260.42Show/hide
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        S     ++DS+ A K G QN    + PK++YI V+ARRG+A ++HSLAER RREKISERMK+LQ LVPGC+++ GK  VLDEIINY+Q+LQ+QVEF
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Q9C670 Transcription factor bHLH765.0e-2360.78Show/hide
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        EF
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Q9CAA9 Transcription factor bHLH491.8e-2537.89Show/hide
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        F +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E+        Q+     SN+   
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         +N + N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPG
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Q9SRT2 Transcription factor bHLH624.2e-2254.24Show/hide
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        L++  KT+  ++  SA  ++K       SD K+ K   +N        P ++YI V+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.3e-2657.02Show/hide
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        K V+LDEIINYVQSLQQQVEF
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AT1G26260.1 cryptochrome-interacting basic-helix-loop-helix 53.5e-2460.78Show/hide
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        EF
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AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.3e-2637.89Show/hide
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        C+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEF
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AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.3e-2637.89Show/hide
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        C+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEF
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AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.4e-2538.05Show/hide
Query:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNE-------NQRKFVVGSNSSSPN
        F +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E       N +K    S+++   
Subjt:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNE-------NQRKFVVGSNSSSPN

Query:  KNAEDNLNVAPTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC
        K    N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC
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Query:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEF
        +++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEF
Subjt:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAATAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCTGATATGGTGGGTTCTTTAGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCACAGTCAGATCGCCAATATTAAATGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGTAAAGTCTCAACCCGATCGCGTTAATGAAAATCAAAGAAAATTTGTTGTTGGTTCCAATTCTTCCAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATAACTTGAATGTGGCACCAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACACAGAAAGTGGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAG
ATAGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAATCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTTCAAGCGCGACGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
AGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATCAACTA
TGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTTATCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGAAAAGTAAGGAATCTGTTTCTTTTTTTTCTAAGTCTCTCTTGAGCTGTTACTTAGCTAAGGCCATTGTTTTTTCATATTTGTCTCAACTTTATGCTCTGAAAGGTTC
TTTCACTTTATAATGTTTGTTAGATTTTATGCTTCACATATTAGATTTCCTTTTGGTTTCATAAAGCTGCATATTTACTTTTTCCTGTTTACTCCTTTCTATGAAATCAC
CACCTTCCCAACTTTGGTCAAACTCCTCTTCTTCAGCTTCTCTTTTACACTTCTAAATTTCAGTCCTTTATTCGGTTTTTCTGACACACAAGTTTAGTATAGTATCCTTT
GGTTTTTCTTTTTCTTTTGAATTTGGTTTGGCTGCCCAAATTGGGAAATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAATAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGT
TCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGGATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAA
AACCATTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATATGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCTGATATGGTGGGTTCTTTAGGCTTTCTAACTGAAGCTGATC
ACAGTCAGATCGCCAATATTAAATGTCCATTTAGTTATGTGCAAATTCTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGTAAAGTCTCAACCCGATCGCGTTAAT
GAAAATCAAAGAAAATTTGTTGTTGGTTCCAATTCTTCCAGCCCAAATAAGAATGCTGAAGATAACTTGAATGTGGCACCAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAAC
ACAGAAAGTGGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAGATAGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAATCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTG
TTCAAGCGCGACGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAAAGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGC
CATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATCAACTATGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTTATCGATGAAACTCGCAAATGTCGGACTAGAA
TCAAGCTTGGAGACAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATACCTTTCATCATCGAACGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCATAGATCAAGGACATT
TCACACAAGTCCTCATGTCATGTTCCAACTTTATGGAACAAGGCCAACCATGCCAAAAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAACCTTTTCAAGATGAAAGGATAATCAGTA
GATGATCAAATTATGCAGCTGCAAAAACCAGAGATGGATGTCAGTATTTATCCTTTGATAGTCATTACATGTGGCGCAGCAAATTAATTAAAGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFYR