; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0026702 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0026702
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRAS-related protein RABC1
Genome locationchr03:9011422..9016086
RNA-Seq ExpressionIVF0026702
SyntenyIVF0026702
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AIS71927.1 RAS-related protein RABC1 [Citrullus lanatus]7.39e-14998.13Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PET-TTTAGGCCSY
        PET +++AGGCCSY
Subjt:  PET-TTTAGGCCSY

XP_011657438.1 ras-related protein RABC1 isoform X1 [Cucumis sativus]6.36e-15299.53Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        PETTT+AGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

XP_016900129.1 PREDICTED: ras-related protein RABC1 isoform X1 [Cucumis melo]1.56e-152100Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        PETTTTAGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

XP_022926286.1 ras-related protein RABC1-like [Cucurbita moschata]2.04e-14897.18Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        P+   +AGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

XP_038885351.1 ras-related protein RABC1 [Benincasa hispida]8.67e-15098.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFARE GCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        PETT +AGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A097BTY5 RAS-related protein RABC12.7e-11598.13Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PET-TTTAGGCCSY
        PET +++AGGCCSY
Subjt:  PET-TTTAGGCCSY

A0A0A0KH59 Uncharacterized protein1.3e-11799.53Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        PETTT+AGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

A0A1S4DVW9 ras-related protein RABC1 isoform X14.4e-118100Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        PETTTTAGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

A0A5A7V1Q4 Ras-related protein RABC1 isoform X14.4e-118100Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        PETTTTAGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

A0A6J1EEF0 ras-related protein RABC1-like5.9e-11597.18Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PETTTTAGGCCSY
        P+   +AGGCCSY
Subjt:  PETTTTAGGCCSY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC16.1e-10185.58Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +TT+
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGG-CCS
        T+   CCS
Subjt:  TAGG-CCS

O49841 Ras-related protein RABC2a9.5e-8671.98Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LL+ F S S EDL+PTIGVDFKIK +TVGGK+LKL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII+VYDVTRRETFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
         D+W KEI+LYSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP   T 
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGGCCS
        T  GCCS
Subjt:  TAGGCCS

P36862 GTP-binding protein yptV31.2e-5963.13Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFED-LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAK
        DY FK+LL+GDSGVGKS +L RFTS  FE+  + TIGVDFK+K++T  GK+ KL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII VYDVTRR+TF +L   W +
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFED-LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAK

Query:  EIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG
        E D+YST +  IKM+V NKVD  ++R VS +EG DFAR +GCLF+E SA+  + V Q F+EL+LKILDTP LL   + G
Subjt:  EIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG

Q5ZLG1 Ras-related protein Rab-183.9e-5556.35Show/hide
Query:  KLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE-DLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAKEIDL
        K+L+IG+SGVGKS+LLLRFT D+F+ +L+ TIGVDFK+K ++V G K KLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQG+I+VYDVTRR+TF  L D W  E++ 
Subjt:  KLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE-DLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAKEIDL

Query:  YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTTTAGGCCS
        Y T  D +KMLVGNK+DKE+ R V + EG+ FAR++  LF+E SAKT   V+  F+ELV KI+ TP L    S      +  ++        GG CS
Subjt:  YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTTTAGGCCS

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b7.5e-7566.18Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
        +DIWAKEI+LYSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P+   
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGGCCS
          G CCS
Subjt:  TAGGCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B184.4e-10285.58Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +TT+
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGG-CCS
        T+   CCS
Subjt:  TAGG-CCS

AT1G43890.2 RAB GTPASE HOMOLOG B184.4e-10285.58Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +TT+
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGG-CCS
        T+   CCS
Subjt:  TAGG-CCS

AT1G43890.3 RAB GTPASE HOMOLOG B184.4e-10285.58Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P +TT+
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGG-CCS
        T+   CCS
Subjt:  TAGG-CCS

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B5.4e-7666.18Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
        +DIWAKEI+LYSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P+   
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGGCCS
          G CCS
Subjt:  TAGGCCS

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A6.7e-8771.98Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LL+ F S S EDL+PTIGVDFKIK +TVGGK+LKL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII+VYDVTRRETFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT
         D+W KEI+LYSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP   T 
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTT

Query:  TAGGCCS
        T  GCCS
Subjt:  TAGGCCS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGTCCGCACCGTCTTCGAGTCAACCGGAGTTTGATTACTTATTTAAGTTGCTGTTGATTGGTGATTCCGGGGTAGGGAAGAGTACTCTTCTTTTGCGCTTTACCTC
TGATTCCTTTGAGGATCTTTCTCCAACTATTGGTGTCGATTTCAAGATCAAGCATGTTACAGTTGGGGGCAAGAAATTGAAGCTTGCAATATGGGATACAGCTGGGCAGG
AGAGGTTTCGAACGCTAACAGGTTCATACTATAGAGGAGCTCAAGGAATCATTATGGTGTATGATGTGACACGGCGAGAGACATTCACAAATCTATCTGACATATGGGCT
AAAGAAATTGATTTGTACTCAACAAATCAGGATTGCATTAAGATGCTTGTTGGAAACAAAGTGGATAAGGAAAGTGAACGTGTCGTCAGTAAAAAAGAGGGAATTGACTT
TGCTCGAGAATATGGATGTCTATTTCTTGAATGCAGTGCGAAAACTCGGGTCAATGTGGAGCAATGCTTTGACGAGCTTGTGTTGAAGATATTGGACACCCCCAGTCTTC
TGGCTGATGGCTCAACAGGTTTAAAAAAGAATATCTTCAAAGAGAAACCTCCCGAAACGACCACTACGGCTGGTGGCTGCTGCTCGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAGATTTACGGAGAAACGAATCAATCGGTGAGAGAAGAAAGTTTTTGAATTCAGAGTGTAGAGTCATTTCAAAGCTTTCTCCAATCTCTCTCGCTCTAATCATACCCA
GTGAATCTTCCAGATTACTATTTGATTCACTGTTTGCTTTGCTCTCCCTCTGTAATTGTATTTGCTGTTTTGATTGATCGTGAAATTGATTGAAAGCTTGAATTTGTTGA
TTAAGGTGTTTCTAATGTCGTCCGCACCGTCTTCGAGTCAACCGGAGTTTGATTACTTATTTAAGTTGCTGTTGATTGGTGATTCCGGGGTAGGGAAGAGTACTCTTCTT
TTGCGCTTTACCTCTGATTCCTTTGAGGATCTTTCTCCAACTATTGGTGTCGATTTCAAGATCAAGCATGTTACAGTTGGGGGCAAGAAATTGAAGCTTGCAATATGGGA
TACAGCTGGGCAGGAGAGGTTTCGAACGCTAACAGGTTCATACTATAGAGGAGCTCAAGGAATCATTATGGTGTATGATGTGACACGGCGAGAGACATTCACAAATCTAT
CTGACATATGGGCTAAAGAAATTGATTTGTACTCAACAAATCAGGATTGCATTAAGATGCTTGTTGGAAACAAAGTGGATAAGGAAAGTGAACGTGTCGTCAGTAAAAAA
GAGGGAATTGACTTTGCTCGAGAATATGGATGTCTATTTCTTGAATGCAGTGCGAAAACTCGGGTCAATGTGGAGCAATGCTTTGACGAGCTTGTGTTGAAGATATTGGA
CACCCCCAGTCTTCTGGCTGATGGCTCAACAGGTTTAAAAAAGAATATCTTCAAAGAGAAACCTCCCGAAACGACCACTACGGCTGGTGGCTGCTGCTCGTATTGATTTA
TATACTAAAAAATGTAGGAGGATTCTCATTTTGTTTTAGGCTACTTGTTCCGTAGTTATTCCATTTCAGCACACACCCTAAAGGGGATCTTCAGTTTTCCCTTAATAGAT
TATACGTTCGTTAAACTAAAATGTCTGCTTGACACTTAATTTTCTTGTATTCTTTCAGTCGTTCTTACTAGGTTGACGATTAATTGGTTCTTTCTGGTTTGAGTTTGATT
TATCATGAACTTACAAAGTGACATATGAAAACAGATCCTGAAATCCTATCAATACTTGTTTTTTAGGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWA
KEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPETTTTAGGCCSY