; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0026725 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0026725
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr01:10895370..10895528
RNA-Seq ExpressionIVF0026725
SyntenyIVF0026725
Gene Ontology termsGO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0040540.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.54e-1597.62Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
        MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
KAA0061073.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.70e-1495.24Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
        MEERVEGTEKELLS+KEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
TYK04121.1 Retrotransposable element Tf2 [Cucumis melo var. makuwa]3.70e-1495.24Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
        MEERVEGTEKELLS+KEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
TYK05582.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.54e-1597.62Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
        MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
TYK14623.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.15e-1495.24Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
        MEERVEGTEKELLSLK+MLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T8C0 Ty3/gypsy retrotransposon protein9.7e-1193.02Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
        MEERVEGTEKELLS+KEMLLEMKKAVDRL DEMKENHSYKKK+
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
A0A5A7TB62 Retrotransposon protein5.7e-1195.35Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
        MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK+
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
A0A5A7UYM1 Ty3/gypsy retrotransposon protein9.7e-1193.02Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
        MEERVEGTEKELLS+KEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK+
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
A0A5D3BWN1 Retrotransposable element Tf29.7e-1193.02Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
        MEERVEGTEKELLS+KEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK+
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
A0A5D3C2Z9 Retrotransposon protein5.7e-1195.35Show/hide
Query:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
        MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAV+RLADEMKENHSYKKK+
Subjt:  MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGAAAGAGTCGAGGGTACTGAAAAGGAACTCCTGAGTCTGAAAGAGATGCTGCTGGAAATGAAGAAGGCTGTAGATCGATTGGCTGACGAAATGAAGGAAAATCA
TAGTTACAAAAAAAAGAAGAATCAGGTACCACATCAGACGGATCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGAAAGAGTCGAGGGTACTGAAAAGGAACTCCTGAGTCTGAAAGAGATGCTGCTGGAAATGAAGAAGGCTGTAGATCGATTGGCTGACGAAATGAAGGAAAATCA
TAGTTACAAAAAAAAGAAGAATCAGGTACCACATCAGACGGATCAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEERVEGTEKELLSLKEMLLEMKKAVDRLADEMKENHSYKKKKNQVPHQTDQ