; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0026883 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0026883
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSKI/DACH domain-containing protein 1
Genome locationchr04:2017791..2018438
RNA-Seq ExpressionIVF0026883
SyntenyIVF0026883
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8651391.1 hypothetical protein Csa_002099 [Cucumis sativus]1.33e-7579.67Show/hide
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KAG7024556.1 hypothetical protein SDJN02_13373, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.19e-4765.75Show/hide
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XP_008466205.1 PREDICTED: SKI/DACH domain-containing protein 1 [Cucumis melo]4.76e-114100Show/hide
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XP_011652564.1 uncharacterized protein LOC105435032 [Cucumis sativus]2.40e-7779.67Show/hide
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XP_038899400.1 uncharacterized protein LOC120086706 [Benincasa hispida]2.86e-5272.13Show/hide
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        MANFH SKSDYDHH     R RNH  CK HP HHQSPGVCSLCLTEKLSRILS  T  SS  K S SLSSS SSSYYSS SSSSS CS SP  Y +YN+D
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           RRK AFV FSASSIFKKSKSMA +    RG T ES+  KKSN   LGFWSRFLNRPR KRMEFQDVLM SRT+V RNVHG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJL6 Uncharacterized protein5.9e-6078.89Show/hide
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        MANFH+SKSD D   H   R+  HHHC+ HPNHHQSPGVCSLCLTEKLSRI++ A SSRNKIS+SLSSS SSSYYSSCSS+SSS SSSPK Y YYNSDNH
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          R+K   +FSASSIFKKSK+MARLKRG TTTESDCGKKSNN DLGFWSRFLNR R KRMEFQ+VLMRSRTVV R NVHG
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A0A1S3CQP1 SKI/DACH domain-containing protein 11.4e-88100Show/hide
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A0A6J1FD38 uncharacterized protein LOC1114430184.1e-3764.09Show/hide
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        MANFH SKSDYD          +   CK HP HHQSPGVCSLCL EKLS+I+ST   S  K+S SLSSSCS+SYYSS +SS SSCSS   PY  YN+D  
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          R+KAFV FSASSIFKKS+SMA   RL+RG  TESD GK   NN+LGFWS+ L RPR K MEF++VLM SRTVV R+VHG
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A0A6J1FKF2 uncharacterized protein LOC1114460764.6e-2859.78Show/hide
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        MAN H SKSDYD      RRHR    CK HP H QSPGVCSLCLTEKLS+ILS   SSR KIS SLSSS S SY Y S  SS SSCSS  +PY+      
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             KA    +ASSI+KKS+SMA   R +RG  T+SD GKKS+   LGFWSRFLNRPR KRME ++ LM SR+  VV  NVHG
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A0A6J1IHL9 uncharacterized protein LOC1114761653.2e-3765.19Show/hide
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        MANFH SKSDYD          +   CK HP HHQSPGVCSLCL EKLS+I+S   +S  K+S SLSSSCSSSYYSS +SS SSCSS   PY  YN+D  
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          R+KAFV FSASSIFKKS+SMA   RLKR   TESD GK SN   LGFWSRFL RPR K MEF++VLM SRTVV R+VHG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAACTTTCACACCTCTAAATCCGATTACGACCACCACCACCACCACCACCGCCGTCACCGCAACCACCACCACTGCAAACACCACCCAAACCACCACCAATCTCC
CGGTGTTTGTTCTCTATGTTTAACCGAAAAGCTCTCGCGGATTCTCTCCACCGCCGGTTCATCGCGTAATAAAATCTCTAGTTCTCTTTCTTCTTCTTGTTCCTCTTCTT
ATTACTCCTCTTGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTTCTTCGCCGAAGCCTTACAATTATTACAATTCGGATAATCATCGTCGTCGTAAGAAGGCTTTTGTGTTGTTT
TCTGCGTCTTCGATCTTTAAGAAGAGTAAATCGATGGCGAGATTGAAACGAGGAACGACAACGGAGAGTGATTGTGGAAAGAAGAGTAATAATAATGACTTAGGGTTTTG
GTCGAGGTTTCTGAATCGACCGAGACCGAAGAGGATGGAATTTCAGGATGTTTTGATGCGTTCGAGAACTGTTGTACACAGGAACGTGCATGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCCAATATGGCCAACTTTCACACCTCTAAATCCGATTACGACCACCACCACCACCACCACCGCCGTCACCGCAACCACCACCACTGCAAACACCACCCAAACCACCACC
AATCTCCCGGTGTTTGTTCTCTATGTTTAACCGAAAAGCTCTCGCGGATTCTCTCCACCGCCGGTTCATCGCGTAATAAAATCTCTAGTTCTCTTTCTTCTTCTTGTTCC
TCTTCTTATTACTCCTCTTGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTGTTCTTCTTCGCCGAAGCCTTACAATTATTACAATTCGGATAATCATCGTCGTCGTAAGAAGGCTTTTGT
GTTGTTTTCTGCGTCTTCGATCTTTAAGAAGAGTAAATCGATGGCGAGATTGAAACGAGGAACGACAACGGAGAGTGATTGTGGAAAGAAGAGTAATAATAATGACTTAG
GGTTTTGGTCGAGGTTTCTGAATCGACCGAGACCGAAGAGGATGGAATTTCAGGATGTTTTGATGCGTTCGAGAACTGTTGTACACAGGAACGTGCATGGATGAACGTAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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