; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0000548 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0000548
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr4:9654723..9661319
RNA-Seq ExpressionLag0000548
SyntenyLag0000548
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7490476.1 SET-binding protein [Solea senegalensis]1.3e-0741.67Show/hide
Query:  PPSRASLAPSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS
        P  R+S++PSPS K+ ++I+PSPS K   + +PSPS K+ + ++PSPS K+ ++++PSPS K+ ++ +PSPS  + ++ +PSPS +  ++ +P+PS
Subjt:  PPSRASLAPSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS

KAG7490477.1 SET-binding protein [Solea senegalensis]1.3e-0741.67Show/hide
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        P  R+S++PSPS K+ ++I+PSPS K   + +PSPS K+ + ++PSPS K+ ++++PSPS K+ ++ +PSPS  + ++ +PSPS +  ++ +P+PS
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XP_007894292.2 proliferation marker protein Ki-67 [Callorhinchus milii]2.5e-0638.61Show/hide
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        P R SLA   PSP  K+L +  PSP  K+L +  PSP  K+L    PSP  K+L +  PSP  K+L +  PSP  N+L   TPSP  K+L + +PSP  K
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Query:  VFLSAPPFEG-------SPLRFLFSKFEGSPLLLFKCLAAVDSLVPLHLQMLLRSPNK
           +  P  G       SP     S    SP L  K LAA  S  P    +  +SP++
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XP_031027822.1 uncharacterized protein SmJEL517_g00105 [Synchytrium microbalum]6.5e-0746.9Show/hide
Query:  ASLAPSP-SSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVFLSA
        AS APSP +S    S APSP +  L SAAPSP +  L   APSP +  L S APSP +  L S APSP ++ L S  PSP +  L S APSP +    SA
Subjt:  ASLAPSP-SSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVFLSA

Query:  PPFEGSPLRFLFS
         P   +P   L S
Subjt:  PPFEGSPLRFLFS

XP_962131.1 anchored cell wall protein 8 [Neurospora crassa OR74A]9.4e-0640Show/hide
Query:  LPPSRASLAPSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKV
        +P   +S AP PSS A++   P+PSS A++   P+PSS A++   P+PSS A++   P+PSS A++   P+PSS+ ++   P+PSS  ++   P+PSS V
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Query:  FLSAPPFEGS
         +  PP   S
Subjt:  FLSAPPFEGS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1I8IUL4 DDE_Tnp_IS1595 domain-containing protein8.3e-0848.96Show/hide
Query:  PSRASLAPSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS
        P+ AS AP+P+S AL+  AP+P+S AL+  AP+P+S AL+  AP+P+S  L+  AP+P+S AL+  AP+P+S+AL+   P+P+S AL+  AP+P+S
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A0A507CAM6 Uncharacterized protein3.1e-0746.9Show/hide
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        AS APSP +S    S APSP +  L SAAPSP +  L   APSP +  L S APSP +  L S APSP ++ L S  PSP +  L S APSP +    SA
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Query:  PPFEGSPLRFLFS
         P   +P   L S
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A0A7C8H5H8 Chitinase1.7e-0543.86Show/hide
Query:  PKFEGSHALRCSFFSLSSKVLTRFAAVPSSLSSKFLPPSLKVLMRFAATFLQVRRFSHALLQFLPPSRASL---APSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAP
        P    S +   S  S S+ V +   AV SS SS     S   +   ++        S   ++  P +R+S     PSPSS A++S  PSPSS A++S  P
Subjt:  PKFEGSHALRCSFFSLSSKVLTRFAAVPSSLSSKFLPPSLKVLMRFAATFLQVRRFSHALLQFLPPSRASL---APSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAP

Query:  SPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVFLSAP
        SPSS A++   PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS   +S P
Subjt:  SPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVFLSAP

B6QFQ7 Chitinase1.7e-0543.86Show/hide
Query:  PKFEGSHALRCSFFSLSSKVLTRFAAVPSSLSSKFLPPSLKVLMRFAATFLQVRRFSHALLQFLPPSRASL---APSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAP
        P    S +   S  S S+ V +   AV SS SS     S   +   ++        S   ++  P +R+S     PSPSS A++S  PSPSS A++S  P
Subjt:  PKFEGSHALRCSFFSLSSKVLTRFAAVPSSLSSKFLPPSLKVLMRFAATFLQVRRFSHALLQFLPPSRASL---APSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAP

Query:  SPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVFLSAP
        SPSS A++   PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS   +S P
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Q7S939 Anchored cell wall protein 84.5e-0640Show/hide
Query:  LPPSRASLAPSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKV
        +P   +S AP PSS A++   P+PSS A++   P+PSS A++   P+PSS A++   P+PSS A++   P+PSS+ ++   P+PSS  ++   P+PSS V
Subjt:  LPPSRASLAPSPSSKALLSIAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLFVAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKV

Query:  FLSAPPFEGS
         +  PP   S
Subjt:  FLSAPPFEGS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCATTCCTTCTCTTCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTGTTTCGCTGCAGTTCCTTTTCTCCAAGTACGAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGTTGC
GATGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCAAAGTTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGT
CTGAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAAGTTCGAAGGTTCTCACG
CGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCCTAAGTTCGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCATGCGCTTCGCTGCTACTTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGC
GCTGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTCGCGCTTCGCTTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTCTCTCCATTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTG
CTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTTCGTTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTCCTTCTCCAAGTTCAAAGGCGCTTCTCTCCACTGCT
CCTTCTCCAAGTTCGAATGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGTTTCTCTCCGCCCCTCC
TTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTTATTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCTCGTTCCACTCCATCTTCAAA
TGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGAAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGCTACTCAAATCACCCAATAAGATGGGGACTGGTCTAGCAGGA
GTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGCTACTCAAATCATCCAATAAAATAGAGACTGGTCTAGCAAGAGTGCATCATTGTAGGCAAATTTGGAGTGCGTCCCTGAAGGCGAA
TCTGGTGACTACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGAGTGCATCACTGAAGGCGAATCTGGTGACTACTTCTGCAGGCTACTCAGATCACCCA
ATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAAGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATAGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAA
ATCTGGCTACTCAGATCATCCAATGAAATAGGGGACTGGTCTAGCAGAAGTGAAATCATTGCAACTTTCCTTCCAAATTTCTATCAATTGAGGATCCCACAATCTGTTCC
AAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGTTGTTCGTGTGAATTATAAAGCATCAGATTATACGAATTGGGAGCTACAAGAGGTAGTGGCGGATT
TTCAACTTCTCAGCTGCTATATCAGGGTAGACGTGGGAGCCAGTTCATCATCTTCTCTGGTGGTAATCCCCTTTTTCCTCTACTACTGTCTTTATCGATTTTATTGTTTA
GCCTTTATTATGGATCCCTCTTCGCTGGTTGACGATTGGTCTCGCCTGAGTTTAACATCGGAAGAGGAACAGATTTCGGATGTTCCAGACAAGGAAGCAGTGGATAGATC
CAATCTCTCTGGATCTTTGCTTAATCGGCAAGTTGCTCTGTTATCGGCCACTGGGAGCAGAGGCTGTGCGAAGGAACTTTCGAGTGGCGTGGAAGCTCGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCATTCCTTCTCTTCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTGTTTCGCTGCAGTTCCTTTTCTCCAAGTACGAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGTTGC
GATGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCAAAGTTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGT
CTGAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAAGTTCGAAGGTTCTCACG
CGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCCTAAGTTCGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCATGCGCTTCGCTGCTACTTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGC
GCTGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTCGCGCTTCGCTTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTCTCTCCATTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTG
CTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTTCGTTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTCCTTCTCCAAGTTCAAAGGCGCTTCTCTCCACTGCT
CCTTCTCCAAGTTCGAATGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGTTTCTCTCCGCCCCTCC
TTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTTATTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCTCGTTCCACTCCATCTTCAAA
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GTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGCTACTCAAATCATCCAATAAAATAGAGACTGGTCTAGCAAGAGTGCATCATTGTAGGCAAATTTGGAGTGCGTCCCTGAAGGCGAA
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AAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGTTGTTCGTGTGAATTATAAAGCATCAGATTATACGAATTGGGAGCTACAAGAGGTAGTGGCGGATT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MHSFSSSSKVLTCFAAVPFLQVRRCSFSKFEGSYIVAMQFLLSKFKVSHAFRYSSFPPSSKVLTRFGEVPSSKSEVRRFSRASLQFLLPKFEGSHALRCSFFSLSSKVLT
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PSPSSNALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVFLSAPPFEGSPLRFLFSKFEGSPLLLFKCLAAVDSLVPLHLQMLLRSPNKMGTGLAEVHHCRQIWLLKSPNKMGTGLAG
VHHCRQIWLLKSSNKIETGLARVHHCRQIWSASLKANLVTTPAGYSDHPIKWGLECITEGESGDYFCRLLRSPNKMGTGLARVHHCRQIWLLRSPNKIGTGLAGVHHCRQ
IWLLRSSNEIGDWSSRSEIIATFLPNFYQLRIPQSVPRPEDSREDPSGCPKVVRVNYKASDYTNWELQEVVADFQLLSCYIRVDVGASSSSSLVVIPFFLYYCLYRFYCL
AFIMDPSSLVDDWSRLSLTSEEEQISDVPDKEAVDRSNLSGSLLNRQVALLSATGSRGCAKELSSGVEAR