| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0045186.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-20 | 40.98 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
PKETR G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRV DEV S+RV + I DD + LS+++ MNDVDKDQW+
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
Query: KVMDLEMKSFVF-------------HFHL-----------------GSCYLTDIKG--ASSSFPNGNLGEAEFVLGIQIVRNQ
K MDLEMKS F HF + S +++ ++G F +LGEA+++LGIQI+R++
Subjt: KVMDLEMKSFVF-------------HFHL-----------------GSCYLTDIKG--ASSSFPNGNLGEAEFVLGIQIVRNQ
|
|
| KAA0047456.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-18 | 53.39 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
PKE R G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRVVDEV S+RV G + V+IPDDG+ LS+++ MNDVD
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
Query: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
KDQW+K MDLEM+S F+
Subjt: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
|
|
| KAA0059678.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.3e-18 | 51.33 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
PKETR G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRV+DEV ++ H V+IPDDG+ LS+++ MNDVDK+QW+
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
Query: KVMDLEMKSFVFH
K MDLE++S F+
Subjt: KVMDLEMKSFVFH
|
|
| KAA0060473.1 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-18 | 53.98 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
PKETR F + QENK FVSTNA F EE H+++ +SK+ L++ TNE STRVVDEV S+RVV IPDDG+ SLS+++ MNDVDKD+W+
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
Query: KVMDLEMKSFVFH
K MDLEM+ F+
Subjt: KVMDLEMKSFVFH
|
|
| TYJ98650.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.1e-18 | 53.39 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
PKE R G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRVVDEV S+RV G + V+IPDDG+ LS+++ MNDVD
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
Query: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
KDQW+K MDLEM+S F+
Subjt: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TZQ3 Gag/pol protein | 5.4e-19 | 53.39 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
PKE R G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRVVDEV S+RV G + V+IPDDG+ LS+++ MNDVD
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
Query: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
KDQW+K MDLEM+S F+
Subjt: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
|
|
| A0A5A7UWW0 Retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass | 5.4e-19 | 53.98 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
PKETR F + QENK FVSTNA F EE H+++ +SK+ L++ TNE STRVVDEV S+RVV IPDDG+ SLS+++ MNDVDKD+W+
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
Query: KVMDLEMKSFVFH
K MDLEM+ F+
Subjt: KVMDLEMKSFVFH
|
|
| A0A5A7UWW4 Gag/pol protein | 1.6e-18 | 51.33 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
PKETR G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRV+DEV ++ H V+IPDDG+ LS+++ MNDVDK+QW+
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
Query: KVMDLEMKSFVFH
K MDLE++S F+
Subjt: KVMDLEMKSFVFH
|
|
| A0A5D3BFS9 Gag/pol protein | 5.4e-19 | 53.39 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
PKE R G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRVVDEV S+RV G + V+IPDDG+ LS+++ MNDVD
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRV----VDGSVHL-VIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVD
Query: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
KDQW+K MDLEM+S F+
Subjt: KDQWIKVMDLEMKSFVFH
|
|
| A0A5D3DUH7 Gag/pol protein | 9.9e-21 | 40.98 | Show/hide |
Query: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
PKETR G F + QEN+ FVSTNA F EE H+++ +SK+ L NEAT STRV DEV S+RV + I DD + LS+++ MNDVDKDQW+
Subjt: PKETRSGYFSNSQENKEFVSTNAKFSEEVHIKNINYKSKVDLSKLTNEATVTSTRVVDEVDCSTRVVDGSVHLVIIPDDGIVGSLSFRKKMNDVDKDQWI
Query: KVMDLEMKSFVF-------------HFHL-----------------GSCYLTDIKG--ASSSFPNGNLGEAEFVLGIQIVRNQ
K MDLEMKS F HF + S +++ ++G F +LGEA+++LGIQI+R++
Subjt: KVMDLEMKSFVF-------------HFHL-----------------GSCYLTDIKG--ASSSFPNGNLGEAEFVLGIQIVRNQ
|
|
