| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| BBN69746.1 VIRB2-interacting protein 2 [Prunus dulcis] | 2.0e-89 | 48.16 | Show/hide |
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++D+RPISL T LYK+V++VL RL+ VL STI+ YQ+AFV+ RQILDA+L+ANE++ + R K G+V K D+EKA+D V+W F+D +L KG ++WR
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SWIRGC+ + N+S++INGRPRG+ RA+RGLRQ DP+SPFLF ++M +R++ KA+ +G + + I+H+QFADDTI F + ++EY N+ ++
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+E F VS IN K ++GIN D + A GC +G+WP YLGLPL G FW P++EKVE RL+ W + +SKGGRLT++ A L ++P Y
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Y+SLF++P + IE + + FLW+G
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|
| CAN66330.1 hypothetical protein VITISV_000598 [Vitis vinifera] | 7.2e-92 | 41.13 | Show/hide |
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++D+RPISL TCLYKI+A+VL+ RL+ VL TI Q AFV+ RQILDA L+ANEI+ + R ++G+V K D EKA+D V+W+FLDH+L KG +WR
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SW+RGC+SSV+Y+IL+NG +G ++A RGLRQ DP+SPFLF ++ +R+L K E ++ GFR N ++H+QFADDTILF S EDE
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+V F +S +NL K + GIN D L A CK WP YLGLPL G + FW P+IE++ RRL W +++S GGR+TLL + LS++P+
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Y+LSLF++P + +IE + + FLW G G R I+ F ++ K PI + W NL D++ L
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LD ++LS D+ W L G ++KS T ++ K +WK + KVK +W +AHK +NT D+LQ
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|
|
| PRQ36601.1 putative RNA-directed DNA polymerase [Rosa chinensis] | 2.3e-90 | 50.31 | Show/hide |
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+ DYRPISL T LYKI+A+VL RL+ VL TI+ Q AF++ RQILDA LVANE++ + ++KK+GLV K D EKA+D V+WNFLD+ + +KG ++WR
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WI GC+ S N+SI INGRPRG+ A+RGLRQ DP+S FLF +++ +RL+ +A +I G + I H+QFADDTI F K +D+++ N+ V
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+E+F S IN K V+GIN + LE A GC++G+WP YLGLPL G +FW P++EK+E+ L+ W +F+S+GGRLTL+ A LS+LPTY
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YLSLFQ+P + +ES+ KIF W G
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| VVA21938.1 Hypothetical predicted protein, partial [Prunus dulcis] | 2.0e-89 | 48.16 | Show/hide |
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++D+RPISL T LYK+V++VL RL+ VL STI+ YQ+AFV+ RQILDA+L+ANE++ + R K G+V K D+EKA+D V+W F+D +L KG ++WR
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SWIRGC+ + N+S++INGRPRG+ RA+RGLRQ DP+SPFLF ++M +R++ KA+ +G + + I+H+QFADDTI F + ++EY N+ ++
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+E F VS IN K ++GIN D + A GC +G+WP YLGLPL G FW P++EKVE RL+ W + +SKGGRLT++ A L ++P Y
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Y+SLF++P + IE + + FLW+G
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| VVA39726.1 Hypothetical predicted protein, partial [Prunus dulcis] | 1.5e-89 | 48.16 | Show/hide |
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++D+RPISL T LYK+V++VL RL+ VL STI+ YQ+AFV+ RQILDA+L+ANE++ + R K G+V K D+EKA+D V+W F+D +L KG ++WR
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SWIRGC+ + N+S++INGRPRG+ RA+RGLRQ DP+SPFLF ++M +R++ KA+ +G + + I+H+QFADDTI F + ++EY N+ ++
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+E F VS IN K ++GIN D + A GC++G+WP YLGLPL G FW P++EKVE RL+ W + +SKGGRLT++ A L ++P Y
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Y+SLF++P + IE + + FLW+G
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A5C3T9 Uncharacterized protein | 3.5e-92 | 41.13 | Show/hide |
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++D+RPISL TCLYKI+A+VL+ RL+ VL TI Q AFV+ RQILDA L+ANEI+ + R ++G+V K D EKA+D V+W+FLDH+L KG +WR
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SW+RGC+SSV+Y+IL+NG +G ++A RGLRQ DP+SPFLF ++ +R+L K E ++ GFR N ++H+QFADDTILF S EDE
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+V F +S +NL K + GIN D L A CK WP YLGLPL G + FW P+IE++ RRL W +++S GGR+TLL + LS++P+
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Y+LSLF++P + +IE + + FLW G G R I+ F ++ K PI + W NL D++ L
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LD ++LS D+ W L G ++KS T ++ K +WK + KVK +W +AHK +NT D+LQ
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| M5WKV4 Reverse transcriptase domain-containing protein (Fragment) | 2.9e-91 | 49.08 | Show/hide |
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+ DYRPISL T LYK++++VL RL+ VL +TI++ Q AFV+ RQILDA LVANE++ + ++K+KGLV K D EKA+D V+WNF+D +L KG KWR
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WI GC+ SVN+SI+ING+PRG+ RA+RGLRQ DP+SPFLF ++ +R++ +A+ +++G S H+ + ++H+QFADDTI ++EY N+ ++
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++ F VS IN K +LGIN T AL A GC++G WP YLGLPL G NFW P+++KVE+RL+ W + +SKGGRLTL+ A LS++P+Y
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Query: YLSLFQLPKKIGLEIESMYKIFLWKG
Y+SLF++P + ++E + + FLW+G
Subjt: YLSLFQLPKKIGLEIESMYKIFLWKG
|
|
| M5X4S0 Reverse transcriptase domain-containing protein (Fragment) | 6.5e-91 | 49.08 | Show/hide |
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+ DYRPISL T LYK++++VL RL+ VL +TI++ Q AFV+ RQILDA LVANE++ + ++K+KGLV K D EKA+D V+WNF+D ++ KG KWR
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WI GC+ SVN+SI+ING+PRG+ RA+RGLRQ DP+SPFLF ++ +RL+ +A+ +++G S H+ + ++H+QFADDTI ++EY N+ ++
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++ F VS IN K +LGIN T L A GC++G WP YLGLPL G NFW P++EKVE+RL+ W + +SKGGRLTL+ A LS++P+Y
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Y+SLF++P + ++E + + FLW+G
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|
| M5XHS0 Reverse transcriptase domain-containing protein (Fragment) | 2.2e-91 | 49.08 | Show/hide |
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+ DYRPISL T LYK++++VL RL+ VL +TI++ Q AFV+ RQILDA LVANE++ + ++K+KGLV K D EKA+D V+WNF+D +L KG KWR
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WI GC+ SVN+SI+ING+PRG+ RA+RGLRQ DP+SPFLF ++ +R++ +A+ +++G S H+ + ++H+QFADDTI ++EY N+ ++
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++ F VS IN K +LGIN T AL A GC++G WP YLGLPL G NFW P+++KVE+RL+ W + +SKGGRLTL+ A LS++P+Y
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Y+SLF++P + ++E + + FLW+G
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|
| M5XUF8 Reverse transcriptase domain-containing protein (Fragment) | 2.9e-91 | 48.47 | Show/hide |
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++D+RPISL T LYK+V++VL RL+ VL STI+ YQ+AFV+ RQILDA+L+ANE++ + R K G+V K D+EKA+D V+W F+D +L KG ++WR
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SWIRGC+ + N+S++INGRPRG+IRA+RGLRQ DP+SPFLF ++M +R++ KA+ +G H + ++H+QFADDTI F + ++EY N+ ++
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+E F VS IN K ++GIN D L A GC++G WP +YLGLPL G FW P++EKVE RL+ W + +SKGGRLT++ A L ++P Y
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Y+S+F++P + IE + + FLW+G
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O00370 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 2.2e-19 | 23.77 | Show/hide |
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++RPISL KI+ ++L R+++ + I Q F+ Q + +I NR K K ++I D EKAFDK+ F+ L G+ +
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IR +I++NG+ G RQ P+SP LF +++ R + + + I G + + ++ FADD I++ + SA N+ K++
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Query: ENFEHVSWHNINLQKMEVLGINADTTALEVFAQQTGCKLGMWPNTYLGLPL--NGASSLRNFWMPIIEKVERRLKNWGASFISKGGRLTLLLATLSNLPT
NF VS + IN+QK + N + + + YLG+ L + + + P++++++ W S GR+ ++ +
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Query: YYLSL--FQLPKKIGLEIESMYKIFLWKGGPRFIIMCIILSNGKS
Y + +LP E+E F+W I I+ K+
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|
| P08548 LINE-1 reverse transcriptase homolog | 1.8e-13 | 27.44 | Show/hide |
Query: DYRPISLTTCLYKIVARVLTERLKRVLPSTITEYQTAFVENRQILDASLVANEIIYDWNRRKKKG-LVIKPDIEKAFDKVDWNFLDHILFAKGLKNKWRS
+YRPISL KI+ ++LT R+++ + I Q F+ Q + +I N+ K K +++ D EKAFD + F+ L G++ +
Subjt: DYRPISLTTCLYKIVARVLTERLKRVLPSTITEYQTAFVENRQILDASLVANEIIYDWNRRKKKG-LVIKPDIEKAFDKVDWNFLDHILFAKGLKNKWRS
Query: WIRGCVSSVNYSILINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDTILFSKFEDEYSATNMFKVV
I S +I++NG G RQ P+SP LF ++M L + I G I ++ FADD I++ + S T + +V+
Subjt: WIRGCVSSVNYSILINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDTILFSKFEDEYSATNMFKVV
Query: ENFEHVSWHNINLQK
+ + +VS + IN K
Subjt: ENFEHVSWHNINLQK
|
|
| P11369 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 9.6e-15 | 22.87 | Show/hide |
Query: DYRPISLTTCLYKIVARVLTERLKRVLPSTITEYQTAFVENRQILDASLVANEIIYDWNRRKKKG-LVIKPDIEKAFDKVDWNFLDHILFAKGLKNKWRS
++RPISL KI+ ++L R++ + + I Q F+ Q + +I+ N+ K K ++I D EKAFDK+ F+ +L G++ + +
Subjt: DYRPISLTTCLYKIVARVLTERLKRVLPSTITEYQTAFVENRQILDASLVANEIIYDWNRRKKKG-LVIKPDIEKAFDKVDWNFLDHILFAKGLKNKWRS
Query: WIRGCVSSVNYSILINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDTILFSKFEDEYSATNMFKVV
I+ S +I +NG I G RQ P+SP+LF +++ R + + + I G + + I+ + ADD I++ + + S + ++
Subjt: WIRGCVSSVNYSILINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDTILFSKFEDEYSATNMFKVV
Query: ENFEHVSWHNINLQKMEVLGINADTTALEVFAQQTGCKLGMWPNTYLGLPLNGASS---LRNFWMPIIEKVERRLKNWGASFISKGGRLTLLLATLSNLP
+F V + IN K + A + + T + YLG+ L +NF + ++++ L+ W S GR+ ++ +
Subjt: ENFEHVSWHNINLQKMEVLGINADTTALEVFAQQTGCKLGMWPNTYLGLPLNGASS---LRNFWMPIIEKVERRLKNWGASFISKGGRLTLLLATLSNLP
Query: TYYLSL--FQLPKKIGLEIESMYKIFLW
Y + ++P + E+E F+W
Subjt: TYYLSL--FQLPKKIGLEIESMYKIFLW
|
|
| P14381 Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein | 1.1e-10 | 24.85 | Show/hide |
Query: DYRPISLTTCLYKIVARVLTERLKRVLPSTITEYQTAFVENRQILDASLVANEIIYDWNRRKKKGLVIKPDIEKAFDKVDWNFLDHILFAKGLKNKWRSW
++RP+SL + YKIVA+ ++ RLK VL I Q+ V R I D + ++++ R + D EKAFD+VD +L L A ++ +
Subjt: DYRPISLTTCLYKIVARVLTERLKRVLPSTITEYQTAFVENRQILDASLVANEIIYDWNRRKKKGLVIKPDIEKAFDKVDWNFLDHILFAKGLKNKWRSW
Query: IRGCVSSVNYSILINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDTILFSKFEDEYSATNMFKVVE
++ +S + IN + RG+RQ P+S L+ + + F LL K + G + + +ADD IL + +D + E
Subjt: IRGCVSSVNYSILINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDTILFSKFEDEYSATNMFKVVE
Query: NFEHVSWHNINLQKMEVLGINADTTALEVFAQQTGCKLGMWPN---TYLGLPLNGAS-SLRNFWMPIIEKVERRLKNWG--ASFISKGGRLTLLLATLSN
+ S IN K L +L+V + W + YLG+ L+ + ++ + E V RL W A +S GR ++ +++
Subjt: NFEHVSWHNINLQKMEVLGINADTTALEVFAQQTGCKLGMWPN---TYLGLPLNGAS-SLRNFWMPIIEKVERRLKNWG--ASFISKGGRLTLLLATLSN
Query: LPTYYLSLFQLPKKIGLEIESMYKIFLWKG
Y L ++ +I+ FLW G
Subjt: LPTYYLSLFQLPKKIGLEIESMYKIFLWKG
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| P92555 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg01250 | 4.9e-11 | 47.06 | Show/hide |
Query: LINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDT
+ING P+G + +RGLRQ DP+SP+LFI+ + L +A+ G + G R +NS INH+ FADDT
Subjt: LINGRPRGRIRATRGLRQDDPISPFLFIMIMGYFNRLLTKAESDGIINGFRSDHNSISINHIQFADDT
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